More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0804 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  100 
 
 		 394 aa  800    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  68.12 
 
 		 389 aa  543  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  64.3 
 
 		 391 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  64.25 
 
 		 389 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3126  aminotransferase class V  63.14 
 
 		 390 aa  449  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  59 
 
 		 395 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  40.5 
 
 		 380 aa  295  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  40.17 
 
 		 384 aa  290  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  39.61 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  42.86 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  42.22 
 
 		 383 aa  286  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  39.02 
 
 		 382 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  39.02 
 
 		 382 aa  286  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  41.38 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  40.67 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  37.85 
 
 		 385 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  39.84 
 
 		 382 aa  280  3e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  41.71 
 
 		 380 aa  280  4e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  43.64 
 
 		 379 aa  278  1e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  42.54 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  38.57 
 
 		 384 aa  275  7e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.38 
 
 		 400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  41.55 
 
 		 379 aa  273  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  39.58 
 
 		 397 aa  272  6e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  41.83 
 
 		 379 aa  272  7e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  38.29 
 
 		 382 aa  271  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  39.45 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  38.5 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  39.5 
 
 		 385 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  37.4 
 
 		 382 aa  269  5e-71  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  37.36 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  40 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  37.99 
 
 		 386 aa  263  6e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  36.72 
 
 		 382 aa  262  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  40.06 
 
 		 379 aa  259  4e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  34.07 
 
 		 384 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  34.07 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  37.81 
 
 		 382 aa  256  5e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.33 
 
 		 387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  34.6 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  37.5 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  40.33 
 
 		 383 aa  252  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  37.4 
 
 		 362 aa  249  8e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  37.81 
 
 		 385 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  37.12 
 
 		 362 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  34.17 
 
 		 387 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  37.65 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  37.5 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  37.19 
 
 		 381 aa  246  6.999999999999999e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  36.57 
 
 		 362 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  32.88 
 
 		 387 aa  242  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0969  aminotransferase class V  34.93 
 
 		 374 aa  241  1e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.716227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  36.06 
 
 		 360 aa  236  4e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  38.95 
 
 		 412 aa  229  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1929  aminotransferase class V  38.27 
 
 		 370 aa  222  8e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  34.51 
 
 		 384 aa  219  5e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  34.77 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2475  Serine--glyoxylate transaminase  35.97 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  35.03 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  33.33 
 
 		 387 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  34.25 
 
 		 391 aa  213  5.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0073  aminotransferase, class V  38.94 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  32.36 
 
 		 382 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  32.63 
 
 		 382 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  32.1 
 
 		 382 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  35.82 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  35.32 
 
 		 401 aa  206  6e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0418  Alanine--glyoxylate transaminase  35.97 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0053  aminotransferase, class V  36.57 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0208  hypothetical protein  34.03 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  35.24 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  36.47 
 
 		 417 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  35.24 
 
 		 402 aa  202  6e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.223279 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2387  aminotransferase class V  37.5 
 
 		 355 aa  202  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.271517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  35.59 
 
 		 417 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3670  aminotransferase class V  36.68 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.569732 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1731  Serine--pyruvate transaminase  33.05 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.186952 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  33.42 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  36.26 
 
 		 421 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  34.42 
 
 		 399 aa  201  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  35.86 
 
 		 406 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  35.99 
 
 		 398 aa  199  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  31.4 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  31.4 
 
 		 385 aa  198  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  34.97 
 
 		 396 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  35 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  34.2 
 
 		 391 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  35.57 
 
 		 406 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  35.84 
 
 		 406 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  35.49 
 
 		 402 aa  195  9e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  36.16 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1287  aminotransferase, class V  33.99 
 
 		 387 aa  194  3e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17916  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  34.99 
 
 		 406 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2489  putative serine--glyoxylate aminotransferase  36.13 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  34.41 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0174  aminotransferase class V  38.03 
 
 		 360 aa  193  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  35.03 
 
 		 391 aa  192  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  33.53 
 
 		 396 aa  192  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  36.87 
 
 		 401 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  34.77 
 
 		 391 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0189325 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>