273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0689 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0689  selenide, water dikinase  100 
 
 
328 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00779233  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0107  selenide, water dikinase  61.66 
 
 
350 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.317143 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1736  selenide, water dikinase  59.74 
 
 
351 aa  342  5e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298189  normal  0.96466 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2746  selenide, water dikinase  53.73 
 
 
321 aa  335  3.9999999999999995e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201658  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2225  selenophosphate synthase  53.98 
 
 
297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2036  selenide, water dikinase  52.53 
 
 
318 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0154042  hitchhiker  0.000215589 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1625  selenophosphate synthase  47.26 
 
 
328 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000489254  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0304  selenide, water dikinase  46.73 
 
 
347 aa  257  2e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.480411  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3401  selenide, water dikinase  51.2 
 
 
317 aa  253  3e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0323823 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1535  selenide, water dikinase  47.48 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000657698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2907  selenophosphate synthase  48.21 
 
 
343 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.547007  normal  0.430139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3849  selenide, water dikinase  46.67 
 
 
317 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1661  selenide, water dikinase  41.75 
 
 
342 aa  248  8e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1241  selenide, water dikinase  45.9 
 
 
309 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1707  selenide, water dikinase  46.52 
 
 
348 aa  245  9e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0134481  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3460  selenide, water dikinase  46.3 
 
 
343 aa  241  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3526  selenide, water dikinase  47.92 
 
 
343 aa  239  4e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0450  selenide, water dikinase  44.87 
 
 
354 aa  237  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0822  selenide, water dikinase  42.94 
 
 
326 aa  232  5e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.771892  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2761  selenide, water dikinase  46.1 
 
 
346 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.124113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1486  selenide, water dikinase  40.37 
 
 
340 aa  229  3e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2086  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  43.86 
 
 
343 aa  228  8e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2542  selenophosphate synthase  42.81 
 
 
315 aa  227  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000270867  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2374  selenide, water dikinase  43.16 
 
 
343 aa  226  4e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3249  selenide, water dikinase  43.14 
 
 
316 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3076  selenide, water dikinase  42.66 
 
 
347 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000815299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0607  selenide, water dikinase, selenocysteine-containing  45.86 
 
 
345 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1116  selenophosphate synthase  41.19 
 
 
323 aa  224  2e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.456278 
 
 
-
 
NC_002950  PG1753  selenide, water dikinase  39.94 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1228  selenide, water dikinase  45.6 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0811  selenide, water dikinase  41.64 
 
 
344 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3445  selenide, water dikinase  43.42 
 
 
351 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.413976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3363  selenophosphate synthase  44.08 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3509  selenide, water dikinase  43.42 
 
 
355 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.502042  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2053  selenide, water dikinase  41.94 
 
 
343 aa  211  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0099  selenophosphate synthase  42.39 
 
 
320 aa  211  1e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.574229 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1987  selenide, water dikinase  45.61 
 
 
319 aa  209  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3427  selenide, water dikinase  43.23 
 
 
316 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6596  selenide, water dikinase  45.37 
 
 
381 aa  206  5e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0844  selenide, water dikinase  36.05 
 
 
358 aa  206  5e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000873496  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4589  selenide, water dikinase  42.24 
 
 
340 aa  205  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11290  selenium donor protein  41.46 
 
 
321 aa  205  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.327064 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2461  selenide, water dikinase (selenocysteine-containing)  38.89 
 
 
354 aa  203  3e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000145839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0884  selenide, water dikinase  37.07 
 
 
344 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000463593 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0340  selenide, water dikinase  37.82 
 
 
317 aa  197  3e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0597288  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0830  selenophosphate synthase  36.39 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0252  selenide, water dikinase  38.08 
 
 
352 aa  195  9e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0491527 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0368  selenide, water dikinase  38.03 
 
 
337 aa  194  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0362  selenide, water dikinase (possible start at 335663)  38.83 
 
 
320 aa  192  5e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0196  selenophosphate synthetase  38.1 
 
 
352 aa  191  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5690  selenide, water dikinase  43.8 
 
 
343 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0135  selenophosphate synthetase  38.22 
 
 
347 aa  191  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.397327 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2397  selenide, water dikinase  37.06 
 
 
353 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1061  selenophosphate synthase  43.21 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.309297  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0170  selenophosphate synthetase  37.85 
 
 
352 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0175  selenophosphate synthetase  37.85 
 
 
352 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6563  selenophosphate synthetase  39.94 
 
 
358 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.207959  hitchhiker  0.00495665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4080  selenophosphate synthetase  37.15 
 
 
352 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0173  selenophosphate synthetase  37.15 
 
 
352 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0177  selenophosphate synthetase  37.15 
 
 
352 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3267  selenide, water dikinase  38.76 
 
 
359 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0176  selenophosphate synthetase  37.78 
 
 
352 aa  187  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.984786  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4713  selenophosphate synthetase  37.26 
 
 
351 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.31309  normal  0.849821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4182  selenophosphate synthetase  37.78 
 
 
352 aa  185  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0955566  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16910  selenophosphate synthase  43.53 
 
 
333 aa  185  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.254595  normal  0.381057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2243  selenophosphate synthetase  38.66 
 
 
346 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.466152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3479  selenophosphate synthase  38.41 
 
 
356 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.547237 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1054  selenophosphate synthetase  36.81 
 
 
348 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0300  selenophosphate synthetase  40.91 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3481  selenide, water dikinase  38.56 
 
 
671 aa  183  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.409241  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2116  selenophosphate synthetase  39.48 
 
 
389 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.113835  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2802  selenide, water dikinase  37.7 
 
 
356 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.543452  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1684  selenide, water dikinase  39.52 
 
 
351 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.815145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1505  selenophosphate synthetase  37.17 
 
 
360 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.252621  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0161  selenophosphate synthetase  37.97 
 
 
346 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0280932  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2555  selenophosphate synthetase  39.94 
 
 
354 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3543  selenophosphate synthetase  39.22 
 
 
352 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3860  selenophosphate synthase  37.13 
 
 
357 aa  179  5.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4912  selenophosphate synthetase  37.62 
 
 
354 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.462232  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3008  selenophosphate synthetase  37.62 
 
 
357 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4708  selenophosphate synthetase  37.94 
 
 
357 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262495  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5358  selenophosphate synthetase  37.62 
 
 
357 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3367  selenophosphate synthetase  37.62 
 
 
357 aa  179  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5238  selenophosphate synthetase  37.94 
 
 
354 aa  179  8e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0606  selenide, water dikinase  37.72 
 
 
353 aa  179  8e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3488  selenide, water dikinase  40 
 
 
359 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4341  selenophosphate synthetase  36.95 
 
 
346 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00762353  hitchhiker  0.000113499 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2385  selenophosphate synthase  38.69 
 
 
351 aa  178  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.510286 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0793  selenide, water dikinase  38.81 
 
 
344 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1754  selenophosphate synthetase  38.74 
 
 
357 aa  177  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207511  normal  0.482616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0120  selenophosphate synthetase  35.47 
 
 
351 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2089  selenophosphate synthetase  39.22 
 
 
348 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.330943  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1980  selenophosphate synthetase  39.22 
 
 
348 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196401  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0864  selenophosphate synthetase  39.72 
 
 
344 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5594  selenophosphate synthase  44.93 
 
 
333 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.161181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0511  selenophosphate synthase  38.81 
 
 
345 aa  177  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0641838  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5214  selenophosphate synthase  44.93 
 
 
333 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5302  selenophosphate synthase  44.93 
 
 
333 aa  177  3e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04230  selenophosphate synthase  42.66 
 
 
357 aa  176  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.776099  normal  0.124051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0190  selenophosphate synthetase  38.11 
 
 
352 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0742475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>