More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0681 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0681  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
264 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1744  methionine aminopeptidase, type I  68.5 
 
 
259 aa  359  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.289602  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0100  methionine aminopeptidase, type I  66.41 
 
 
264 aa  354  7.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.150888 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2236  methionine aminopeptidase, type I  64.29 
 
 
254 aa  349  3e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0460012  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2044  methionine aminopeptidase, type I  60.24 
 
 
254 aa  323  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.0000236003  hitchhiker  0.000194463 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2753  methionine aminopeptidase, type I  61.11 
 
 
254 aa  315  4e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0236  methionine aminopeptidase, type I  53.91 
 
 
248 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0067703  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0444  methionine aminopeptidase, type I  53.66 
 
 
248 aa  268  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2692  methionine aminopeptidase, type I  53.06 
 
 
249 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2377  methionine aminopeptidase, type I  53.06 
 
 
249 aa  266  2e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0702  methionine aminopeptidase, type I  53.09 
 
 
249 aa  264  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000166875  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1577  methionine aminopeptidase, type I  52.05 
 
 
248 aa  263  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00040265  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01380  methionine aminopeptidase, type I  51.23 
 
 
251 aa  261  6.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1368  methionine aminopeptidase, type I  50.62 
 
 
248 aa  261  1e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00612315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1503  methionine aminopeptidase, type I  50.83 
 
 
248 aa  259  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0648  methionine aminopeptidase, type I  55.56 
 
 
236 aa  258  5.0000000000000005e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0618158  hitchhiker  0.00000114545 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0888  methionine aminopeptidase, type I  47.76 
 
 
248 aa  258  1e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000023195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1002  methionine aminopeptidase, type I  48.78 
 
 
250 aa  257  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000954293  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0723  methionine aminopeptidase, type I  51.44 
 
 
248 aa  256  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.277652  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0307  methionine aminopeptidase, type I  51.85 
 
 
249 aa  256  2e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.557928  normal  0.2574 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0246  methionine aminopeptidase, type I  50.41 
 
 
249 aa  255  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000972645  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3645  methionine aminopeptidase, type I  46.94 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000862286  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1248  methionine aminopeptidase, type I  52.46 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000462112  normal  0.100012 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0955  methionine aminopeptidase, type I  52.81 
 
 
236 aa  252  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.321891  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1088  methionine aminopeptidase, type I  52.14 
 
 
236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0403434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2438  methionine aminopeptidase, type I  50.41 
 
 
248 aa  251  6e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3306  methionine aminopeptidase, type I  52.81 
 
 
236 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000948834 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0127  methionine aminopeptidase  46.69 
 
 
248 aa  249  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000038209  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0132  methionine aminopeptidase  46.28 
 
 
248 aa  248  6e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000671118  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0132  methionine aminopeptidase  46.28 
 
 
248 aa  248  6e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000101117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0128  methionine aminopeptidase  46.28 
 
 
248 aa  248  6e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  8.69033e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0126  methionine aminopeptidase  46.28 
 
 
248 aa  248  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000906303  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0153  methionine aminopeptidase  46.28 
 
 
248 aa  248  6e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000019178  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0132  methionine aminopeptidase  46.28 
 
 
248 aa  248  6e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000383298  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0768  methionine aminopeptidase, type I  47.76 
 
 
250 aa  247  1e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0126  methionine aminopeptidase  45.87 
 
 
248 aa  247  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000327766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0216  methionine aminopeptidase, type I  46.69 
 
 
249 aa  246  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2835  methionine aminopeptidase, type I  52.67 
 
 
248 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1933  methionine aminopeptidase, type I  51.22 
 
 
269 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2311  hypothetical protein  49.2 
 
 
254 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000322255  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3984  methionine aminopeptidase, type I  50.82 
 
 
263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0405477  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0623  methionine aminopeptidase, type I  47.13 
 
 
262 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0145  methionine aminopeptidase  46.15 
 
 
236 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.25768e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0163  methionine aminopeptidase  46.15 
 
 
236 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000161795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5173  methionine aminopeptidase  46.15 
 
 
236 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000101637  unclonable  1.02861e-25 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3973  methionine aminopeptidase, type I  49.02 
 
 
257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2124  methionine aminopeptidase, type I  48.78 
 
 
256 aa  241  7.999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.896424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1522  methionine aminopeptidase, type I  45.49 
 
 
249 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2644  methionine aminopeptidase, type I  45.9 
 
 
249 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0351  methionine aminopeptidase, type I  45.53 
 
 
254 aa  239  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1917  methionine aminopeptidase, type I  49 
 
 
261 aa  238  5e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2925  methionine aminopeptidase, type I  46.22 
 
 
256 aa  238  9e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0473  methionine aminopeptidase, type I  46.31 
 
 
251 aa  237  1e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000088934  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0133  methionine aminopeptidase  44.21 
 
 
248 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000284186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1955  methionine aminopeptidase, type I  50.6 
 
 
264 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0129  methionine aminopeptidase  44.63 
 
 
255 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0818  methionine aminopeptidase, type I  47.13 
 
 
268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0496  methionine aminopeptidase, type I  45.9 
 
 
251 aa  234  8e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000338054  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_438  methionine aminopeptidase  45.49 
 
 
251 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000000226178  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2040  methionine aminopeptidase, type I  49.8 
 
 
264 aa  233  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1116  methionine aminopeptidase, type I  46.77 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000848605  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08720  methionine aminopeptidase, type I  44.94 
 
 
259 aa  233  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  hitchhiker  0.0000000254038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3141  methionine aminopeptidase, type I  45.08 
 
 
259 aa  232  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.183346  normal  0.371364 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1809  methionine aminopeptidase  41.86 
 
 
279 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  decreased coverage  0.00302878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1762  methionine aminopeptidase, type I  45.45 
 
 
272 aa  231  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0420  methionine aminopeptidase, type I  43.55 
 
 
251 aa  231  1e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1724  methionine aminopeptidase, type I  45.9 
 
 
247 aa  230  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664848  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1336  methionine aminopeptidase, type I  46.61 
 
 
256 aa  230  2e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05331  methionine aminopeptidase  41.86 
 
 
279 aa  230  2e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.114757 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1343  methionine aminopeptidase, type I  46.61 
 
 
256 aa  229  3e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2624  methionine aminopeptidase, type I  45.7 
 
 
274 aa  229  4e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0837779  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1534  methionine aminopeptidase  45.06 
 
 
275 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0205  methionine aminopeptidase, type I  48.59 
 
 
262 aa  229  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2446  methionine aminopeptidase  43.65 
 
 
277 aa  228  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251132 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0176  methionine aminopeptidase  44.26 
 
 
257 aa  228  7e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.137768 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4300  methionine aminopeptidase  43.27 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.182547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4238  methionine aminopeptidase  43.27 
 
 
253 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0780  methionine aminopeptidase, type I  42.8 
 
 
255 aa  224  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000341129  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2133  methionine aminopeptidase, type I  46 
 
 
259 aa  224  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150484  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1924  methionine aminopeptidase, type I  50.2 
 
 
264 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4424  methionine aminopeptidase  43.62 
 
 
253 aa  222  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1714  methionine aminopeptidase  44.57 
 
 
285 aa  222  6e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1636  methionine aminopeptidase, type I  42.29 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0333  methionine aminopeptidase  42.64 
 
 
276 aa  219  3e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4364  methionine aminopeptidase, type I  45.34 
 
 
265 aa  219  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0760334  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0402  methionine aminopeptidase  42.98 
 
 
255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0584  methionine aminopeptidase  44.44 
 
 
271 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1362  methionine aminopeptidase, type I  44.63 
 
 
257 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04771  methionine aminopeptidase  39.92 
 
 
280 aa  218  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.215617  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1372  methionine aminopeptidase, type I  44.67 
 
 
250 aa  218  7e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000159906  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1314  methionine aminopeptidase, type I  44.67 
 
 
250 aa  218  7e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000364172  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0975  methionine aminopeptidase, type I  42.86 
 
 
250 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0754  methionine aminopeptidase  41.7 
 
 
256 aa  218  8.999999999999998e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0645  methionine aminopeptidase  43.02 
 
 
281 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3883  methionine aminopeptidase, type I  42.69 
 
 
272 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0737  methionine aminopeptidase, type I  44.03 
 
 
248 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2061  methionine aminopeptidase, type I  43.09 
 
 
264 aa  216  2e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0863  methionine aminopeptidase, type I  46.59 
 
 
281 aa  217  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.236959  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2208  methionine aminopeptidase, type I  43.14 
 
 
265 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000857488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3676  methionine aminopeptidase  42.06 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>