221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0678 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0678  ribosomal protein L30  100 
 
 		 58 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2239  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 56 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.108053  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0097  50S ribosomal protein L30  60 
 
 		 56 aa  67.4  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.108985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4489  ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  58.9  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2839  50S ribosomal protein L30  49.12 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1747  50S ribosomal protein L30  54.55 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.652105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0951  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0200139  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3310  50S ribosomal protein L30  52.63 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129618 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0644  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000104871  hitchhiker  0.000000231079 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00956  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0648954  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2259  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00380843  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2300  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.818228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1084  50S ribosomal protein L30  45.61 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.055199  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1267  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0399706  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0865  50S ribosomal protein L30P  52.54 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.012953  hitchhiker  0.0056399 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0580  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.868195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0233  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000351817  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2047  ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000587812  hitchhiker  0.00892932 
 
 
-
 
NC_002950  PG1920  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0440  50S ribosomal protein L30  51.85 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3279  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0271147  hitchhiker  0.00015076 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2932  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000405636 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1813  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3001  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  50.8  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0537795  normal  0.0504923 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1929  50S ribosomal protein L30  48.15 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.630046 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0267  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 63 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.16996  hitchhiker  0.00743529 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0345  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0645299 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2614  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2821  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.238696  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3758  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0279178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3465  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0155512  normal  0.071059 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3050  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0897802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1928  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2741  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0301719  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2137  50S ribosomal protein L30P  44.83 
 
 		 61 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0274633  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0294  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000487608  normal  0.0630356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0285  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.104363  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0366  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139804  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2036  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3151  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0153482  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1942  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.428807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3728  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00881974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3786  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3496  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943573  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1951  50S ribosomal protein L30  50 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3905  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  50.4  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0899974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2754  ribosomal protein L30  43.86 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.21278  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0068  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 62 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.02253  hitchhiker  0.000000000000613726 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0609  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.446566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0332  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00936849  decreased coverage  0.00323406 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3299  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3626  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000585179  hitchhiker  0.0000000000133791 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1007  50S ribosomal protein L30  47.27 
 
 		 62 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00128687  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4297  50S ribosomal protein L30  51.72 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3161  50S ribosomal protein L30  46.3 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00158521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0493  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3125  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2756  ribosomal protein L30  40 
 
 		 56 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133324  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3506  ribosomal protein L30  46.43 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000460865  hitchhiker  0.000000075211 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2601  50S ribosomal protein L30  46.55 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00274852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0071  50S ribosomal protein L30  42.86 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.230621  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1203  50S ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1040  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2889  ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4008  50S ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000205864  hitchhiker  0.0000650866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0399  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.894889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0605  ribosomal protein L30  44.83 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.243208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20690  LSU ribosomal protein L30P  46.55 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0391  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000847959  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0338  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0500477  hitchhiker  0.00104601 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2641  ribosomal protein L30  48.28 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0304  ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 59 aa  48.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00111257  normal  0.144172 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5052  50S ribosomal protein L30  40.74 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0761193  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0303  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.518978 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1120  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.481118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4258  ribosomal protein L30  42.59 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000321281  unclonable  0.00000000000208218 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001724  LSU ribosomal protein L30p (L7e)  44.83 
 
 		 58 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000860316  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3425  50S ribosomal protein L30  44.44 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.187681 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2383  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000813224  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0355  50S ribosomal protein L30  38.18 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000066194  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1733  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.134869  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00748  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 58 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2156  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 58 aa  47  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000499402  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1244  50S ribosomal protein L30P  38.6 
 
 		 74 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0186097  hitchhiker  0.00279952 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1836  50S ribosomal protein L30  38.18 
 
 		 63 aa  47  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.279591  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0379  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1364  ribosomal protein L30  37.74 
 
 		 58 aa  47  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000295854  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2516  50S ribosomal protein L30  41.82 
 
 		 62 aa  47  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0379  50S ribosomal protein L30  43.1 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0777  50S ribosomal protein L30  40 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.432706  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0076  50S ribosomal protein L30  41.38 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.663543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1215  50S ribosomal protein L30  46.03 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1178  50S ribosomal protein L30  46.03 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.109689  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1974  50S ribosomal protein L30  46.03 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0435549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4780  ribosomal protein L30  57.5 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.986627  hitchhiker  0.000000475085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0166  50S ribosomal protein L30  43.64 
 
 		 62 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000187774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1573  50S ribosomal protein L30  49.09 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0324  50S ribosomal protein L30P  48.28 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151243 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0698  ribosomal protein L30  41.51 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.298561  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0619  50S ribosomal protein L30  38.89 
 
 		 60 aa  47  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.268532  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>