More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0677 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0677  30S ribosomal protein S5  100 
 
 		 170 aa  334  3.9999999999999995e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.780274  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  85.19 
 
 		 163 aa  273  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  83.95 
 
 		 163 aa  271  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  84.57 
 
 		 163 aa  271  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  75.93 
 
 		 163 aa  243  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  72.84 
 
 		 163 aa  241  3e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  66.04 
 
 		 169 aa  207  4e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  66.04 
 
 		 169 aa  207  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  66.04 
 
 		 169 aa  208  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  66.04 
 
 		 168 aa  207  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  62.82 
 
 		 163 aa  207  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  64.71 
 
 		 162 aa  206  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000275279  hitchhiker  0.000000114757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  62.42 
 
 		 162 aa  206  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  61.49 
 
 		 166 aa  205  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  63.06 
 
 		 166 aa  202  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  61.25 
 
 		 165 aa  202  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  65.13 
 
 		 167 aa  201  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  65.33 
 
 		 166 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  62.67 
 
 		 166 aa  197  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  57.23 
 
 		 173 aa  197  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  64 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00008348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  60.9 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  61.01 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  61.54 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000595354  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000033601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000320585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000828927  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  62.03 
 
 		 166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000149284  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000826666  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  64.67 
 
 		 166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  63.33 
 
 		 166 aa  195  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 162 aa  194  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  60.67 
 
 		 166 aa  194  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  58.6 
 
 		 162 aa  194  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  57.96 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000304124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  57.96 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  62.09 
 
 		 168 aa  192  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  58.33 
 
 		 164 aa  190  7e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  60 
 
 		 167 aa  188  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000409593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  59.21 
 
 		 162 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0340  ribosomal protein S5  61.44 
 
 		 171 aa  187  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000051388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  60.81 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  60.81 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  58.23 
 
 		 173 aa  185  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  0.0000146915 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  60.14 
 
 		 166 aa  185  3e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  59.6 
 
 		 169 aa  184  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  56.67 
 
 		 166 aa  183  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  59.33 
 
 		 161 aa  183  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  54.84 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  58.02 
 
 		 168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  57.33 
 
 		 165 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  57.33 
 
 		 165 aa  181  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  57.24 
 
 		 190 aa  181  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0475  30S ribosomal protein S5  59.26 
 
 		 166 aa  182  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0209  ribosomal protein S5  58.55 
 
 		 153 aa  181  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0864  SSU ribosomal protein S5P  57.14 
 
 		 177 aa  181  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  hitchhiker  0.00625642 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  54.19 
 
 		 172 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000167346  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  56.67 
 
 		 168 aa  180  9.000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000123427  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0736  30S ribosomal protein S5  60.67 
 
 		 166 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000183061  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0773  30S ribosomal protein S5  59.48 
 
 		 180 aa  179  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.554764  normal  0.012841 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06420  30S ribosomal protein S5  57.41 
 
 		 166 aa  179  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0942299  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  53.7 
 
 		 182 aa  179  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3892  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000919521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  57.89 
 
 		 208 aa  178  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2152  ribosomal protein S5  58 
 
 		 168 aa  178  4e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  0.352454 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  53.55 
 
 		 172 aa  178  4e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  58.67 
 
 		 166 aa  177  4e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  56.44 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2307  30S ribosomal protein S5  59.75 
 
 		 167 aa  177  4.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 172 aa  177  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0471  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0107379  hitchhiker  0.00000305269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04503  30S ribosomal protein S5  55.76 
 
 		 180 aa  177  5.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.271958  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4732  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000128716  normal  0.628759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0504  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566357  normal  0.161255 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0501  30S ribosomal protein S5  56.96 
 
 		 166 aa  177  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000260695  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0643  ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 166 aa  177  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00626233  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4531  30S ribosomal protein S5  54.94 
 
 		 166 aa  177  7e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00205716  normal  0.206831 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  52.9 
 
 		 172 aa  177  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000015537  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3984  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183647  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  52.26 
 
 		 172 aa  177  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3805  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 166 aa  177  8e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000511085  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  57.82 
 
 		 167 aa  176  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  55.21 
 
 		 168 aa  176  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259388  unclonable  0.00000856318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5062  30S ribosomal protein S5  56.33 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000956097  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0344  30S ribosomal protein S5  53.89 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.327612  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0514  30S ribosomal protein S5  53.89 
 
 		 176 aa  176  1e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0137335  unclonable  0.0000000000177209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0340  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000106255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3497  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000313723  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3598  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00671988  normal  0.0253177 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0976  30S ribosomal protein S5  55.42 
 
 		 170 aa  175  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0109709  hitchhiker  0.0000385854 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  54.6 
 
 		 167 aa  175  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000220088  unclonable  0.0000000000604487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3727  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0653825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4626  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000983466  normal  0.887849 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3786  30S ribosomal protein S5  56.79 
 
 		 167 aa  176  2e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000185577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>