More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0657 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0657  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 453 aa  917    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000265417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1463  response regulator receiver protein  50.44 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.292556 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0431  response regulator receiver  52.11 
 
 		 451 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  48.31 
 
 		 451 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0754  TPR repeat-containing protein  40.31 
 
 		 453 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.63318  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0830  response regulator receiver protein  31.41 
 
 		 455 aa  239  9e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  24.83 
 
 		 979 aa  73.9  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.95 
 
 		 3145 aa  73.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  23.99 
 
 		 808 aa  73.6  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 250 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.35 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.98 
 
 		 1056 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.94 
 
 		 810 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2010  hypothetical protein  25 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.340104  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 878 aa  66.6  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 750 aa  66.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 1486 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  36 
 
 		 605 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 505 aa  65.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.12 
 
 		 887 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.75 
 
 		 818 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.45 
 
 		 784 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.52 
 
 		 750 aa  63.9  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 		 632 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.02 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.41 
 
 		 909 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  42.67 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.62 
 
 		 988 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 4489 aa  62  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1767  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.17 
 
 		 882 aa  61.6  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.33 
 
 		 730 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 718 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 827 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2480  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  24.17 
 
 		 882 aa  61.6  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.76 
 
 		 1276 aa  60.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.76 
 
 		 3172 aa  60.8  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  24.91 
 
 		 622 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 465 aa  60.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  24.44 
 
 		 764 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.41 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.16 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.47 
 
 		 1737 aa  60.5  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  33.61 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.82 
 
 		 1022 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  23.76 
 
 		 1154 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  38.46 
 
 		 1240 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2553  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.852958 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.35 
 
 		 2240 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25 
 
 		 878 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 711 aa  57.8  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.61 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 594 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.72 
 
 		 1694 aa  57.8  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  18.79 
 
 		 833 aa  57.4  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  24.91 
 
 		 581 aa  57  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.96 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.96 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3497  TPR repeat-containing protein  34.51 
 
 		 178 aa  57  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767668 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  27.59 
 
 		 837 aa  56.6  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.82 
 
 		 689 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  31.25 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  23.81 
 
 		 676 aa  56.6  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 754 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 667 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.08 
 
 		 762 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  24.9 
 
 		 1676 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  22.81 
 
 		 3035 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  26.64 
 
 		 681 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.24 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.19 
 
 		 265 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 1252 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  24.92 
 
 		 706 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 3560 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 285 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  27.03 
 
 		 875 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 573 aa  55.1  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 		 1252 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 4079 aa  55.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.98 
 
 		 293 aa  55.8  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  30.28 
 
 		 1213 aa  55.5  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 		 754 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  23.72 
 
 		 685 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  29.34 
 
 		 302 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 292 aa  54.7  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  22.68 
 
 		 1061 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.41 
 
 		 587 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  24.47 
 
 		 1764 aa  54.3  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  25.4 
 
 		 2145 aa  54.3  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  21.86 
 
 		 561 aa  54.3  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  29.25 
 
 		 314 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 955 aa  54.7  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  21.89 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  32.41 
 
 		 267 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.44 
 
 		 566 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.3 
 
 		 927 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>