More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0611 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  53.66 
 
 		 895 aa  953    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.35 
 
 		 892 aa  677    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.36 
 
 		 895 aa  671    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  45.79 
 
 		 893 aa  762    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  54.17 
 
 		 896 aa  961    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 920 aa  1877    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  31.57 
 
 		 888 aa  426  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  34.82 
 
 		 752 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  32.23 
 
 		 765 aa  379  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  29.05 
 
 		 913 aa  363  1e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  30.75 
 
 		 769 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.36 
 
 		 802 aa  351  5e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.58 
 
 		 808 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.68 
 
 		 752 aa  331  4e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  29.47 
 
 		 820 aa  327  6e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  31.17 
 
 		 751 aa  326  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.68 
 
 		 770 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  29.5 
 
 		 767 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.09 
 
 		 770 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  28.55 
 
 		 806 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  29.01 
 
 		 763 aa  301  2e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.31 
 
 		 793 aa  300  8e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.58 
 
 		 781 aa  300  9e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  30.01 
 
 		 760 aa  299  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.53 
 
 		 769 aa  298  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.18 
 
 		 793 aa  298  4e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.25 
 
 		 768 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  30.22 
 
 		 770 aa  295  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 768 aa  295  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  28.66 
 
 		 758 aa  294  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  28.76 
 
 		 769 aa  295  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  28.76 
 
 		 769 aa  295  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.53 
 
 		 769 aa  294  6e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.91 
 
 		 769 aa  293  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  28.44 
 
 		 769 aa  292  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.43 
 
 		 769 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  28.76 
 
 		 769 aa  290  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  28.76 
 
 		 768 aa  290  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  28.76 
 
 		 769 aa  290  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  28.76 
 
 		 768 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  28.76 
 
 		 769 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  28.76 
 
 		 768 aa  289  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  28.76 
 
 		 768 aa  289  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  28.76 
 
 		 768 aa  289  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.91 
 
 		 848 aa  289  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  29.55 
 
 		 761 aa  284  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.19 
 
 		 749 aa  278  4e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  27.46 
 
 		 767 aa  274  6e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.27 
 
 		 784 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.63 
 
 		 765 aa  271  4e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.57 
 
 		 800 aa  271  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  28.27 
 
 		 765 aa  270  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  27.49 
 
 		 738 aa  270  1e-70  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  29.06 
 
 		 791 aa  266  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.32 
 
 		 765 aa  265  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  28.32 
 
 		 765 aa  265  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  29.5 
 
 		 777 aa  263  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  27.89 
 
 		 785 aa  261  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.23 
 
 		 765 aa  261  6e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  29.24 
 
 		 784 aa  260  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.23 
 
 		 750 aa  260  9e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  29.06 
 
 		 765 aa  259  2e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  26.85 
 
 		 739 aa  257  9e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  26.92 
 
 		 739 aa  256  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  27.58 
 
 		 790 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  27.63 
 
 		 766 aa  256  2.0000000000000002e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2842  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.4 
 
 		 770 aa  255  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  27.96 
 
 		 765 aa  254  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  26.62 
 
 		 739 aa  253  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.5 
 
 		 811 aa  253  9.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  28.24 
 
 		 784 aa  253  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.8 
 
 		 763 aa  252  3e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.52 
 
 		 787 aa  251  4e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  26.06 
 
 		 790 aa  249  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  27.37 
 
 		 763 aa  248  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  26.55 
 
 		 794 aa  247  8e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.86 
 
 		 799 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  26.25 
 
 		 788 aa  246  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  26.44 
 
 		 787 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  27.09 
 
 		 781 aa  245  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  26.86 
 
 		 796 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  26.44 
 
 		 787 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.32 
 
 		 797 aa  244  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.05 
 
 		 784 aa  242  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.1 
 
 		 790 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  26.05 
 
 		 784 aa  241  5e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.41 
 
 		 803 aa  240  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  28.41 
 
 		 781 aa  239  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  27.97 
 
 		 785 aa  239  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.15 
 
 		 784 aa  238  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  24.65 
 
 		 785 aa  236  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.81 
 
 		 785 aa  235  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.86 
 
 		 787 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  26.78 
 
 		 772 aa  233  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  25.93 
 
 		 786 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  25.99 
 
 		 786 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  25.32 
 
 		 786 aa  231  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  26.98 
 
 		 798 aa  231  6e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  24.87 
 
 		 792 aa  230  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  25.48 
 
 		 781 aa  229  1e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>