More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0605 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
144 aa  300  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  72.52 
 
 
136 aa  206  8e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  70.45 
 
 
137 aa  201  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  72.52 
 
 
136 aa  199  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  57.78 
 
 
137 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  57.04 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  42.98 
 
 
138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  43.18 
 
 
146 aa  104  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.8 
 
 
149 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  50 
 
 
140 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 
139 aa  101  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  50.86 
 
 
140 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  49.14 
 
 
137 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  51.35 
 
 
140 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  38.28 
 
 
137 aa  100  9e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.6 
 
 
138 aa  99.4  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  41.32 
 
 
144 aa  93.6  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  38.79 
 
 
136 aa  90.9  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  36.13 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.98 
 
 
159 aa  89  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  37.7 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  43.24 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 
133 aa  87  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 
146 aa  87  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.64 
 
 
159 aa  87  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  38.33 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.33 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.33 
 
 
150 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.54 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  34.51 
 
 
138 aa  86.3  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.73 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  37.72 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  39.32 
 
 
135 aa  85.9  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.99 
 
 
161 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.33 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.3 
 
 
159 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.48 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.48 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
134 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
135 aa  84.3  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.73 
 
 
161 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  35.43 
 
 
155 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.3 
 
 
161 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.3 
 
 
161 aa  84  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  37.1 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  35.19 
 
 
136 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.46 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  35.34 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.2 
 
 
155 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.5 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  37.82 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  37.82 
 
 
155 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  37.1 
 
 
138 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  36.89 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  36.89 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  36.89 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  36.89 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  36.89 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.98 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  36.89 
 
 
164 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35 
 
 
150 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  36.89 
 
 
164 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.17 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  40.17 
 
 
134 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  39.32 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.51 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
149 aa  77.8  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.07 
 
 
134 aa  77.4  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.08 
 
 
147 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
155 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.13 
 
 
155 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.44 
 
 
115 aa  75.9  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  33.88 
 
 
148 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.07 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.07 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.07 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.07 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.07 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.65 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.07 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  34.19 
 
 
144 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.75 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.97 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.11 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.25 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  33.06 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.61 
 
 
127 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1211  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  34.38 
 
 
148 aa  73.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>