71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0584 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0584  thymidylate synthase complementing protein ThyX  100 
 
 		 267 aa  548  1e-155  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000716478  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  40.27 
 
 		 229 aa  145  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  40.55 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  39.71 
 
 		 245 aa  135  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  41.26 
 
 		 228 aa  135  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  39.09 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  40.32 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  41.76 
 
 		 231 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  42.35 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  36.32 
 
 		 232 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  41.44 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.56 
 
 		 228 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  35.9 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  38.38 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  35.44 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  36.96 
 
 		 226 aa  113  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  34.4 
 
 		 246 aa  111  9e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  37.5 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  35.02 
 
 		 245 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  40.56 
 
 		 245 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.6 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.76 
 
 		 258 aa  105  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  35.26 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  34.33 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  37.63 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.98 
 
 		 254 aa  102  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  32.13 
 
 		 245 aa  98.6  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  32.13 
 
 		 245 aa  98.6  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.62 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1187  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.26 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.933104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  29.03 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.03 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.96 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.03 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1200  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.94 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.001686  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0769  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.28 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.354412  normal  0.842984 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0501  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.25 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.91 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1753  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.81 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0709  thymidylate synthase, flavin-dependent  35.03 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.62086  normal  0.337229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.14 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  29.28 
 
 		 253 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  29.11 
 
 		 252 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  29.11 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1148  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.34 
 
 		 267 aa  52.8  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.606793 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  30.41 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2792  FAD-dependent thymidylate synthase  28.88 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2189  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.98 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  30.41 
 
 		 250 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.22 
 
 		 195 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.22 
 
 		 195 aa  50.1  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3898  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.23 
 
 		 216 aa  49.3  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.262304 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25280  FAD-dependent thymidylate synthase  27.55 
 
 		 250 aa  48.9  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0348718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.83 
 
 		 195 aa  48.5  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3547  FAD-dependent thymidylate synthase  30.59 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  28.42 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1800  FAD-dependent thymidylate synthase  26.83 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0219748  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2102  FAD-dependent thymidylate synthase  30.51 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2161  FAD-dependent thymidylate synthase  30.51 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298336  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2115  FAD-dependent thymidylate synthase  30.51 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5811  FAD-dependent thymidylate synthase  28.8 
 
 		 250 aa  46.6  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  24.42 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1388  FAD-dependent thymidylate synthase  28.74 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  25.7 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  24.42 
 
 		 220 aa  44.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1882  thymidylate synthase, flavin-dependent  24 
 
 		 217 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0694605  normal  0.133921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1346  FAD-dependent thymidylate synthase  28.74 
 
 		 247 aa  43.9  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2401  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0011  FAD-dependent thymidylate synthase  26.95 
 
 		 210 aa  43.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0001  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.31 
 
 		 204 aa  42.7  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.248117  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1195  FAD-dependent thymidylate synthase  29.17 
 
 		 274 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200813  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0508  thymidylate synthase complementing protein ThyX  25.18 
 
 		 289 aa  42  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>