More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0566 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  100 
 
 
282 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  49.62 
 
 
267 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  54.1 
 
 
271 aa  265  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  52.83 
 
 
270 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  50.56 
 
 
272 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  46.83 
 
 
273 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  49.43 
 
 
278 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  41.76 
 
 
290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  44.23 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  43.13 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  42.58 
 
 
290 aa  216  4e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  42.97 
 
 
301 aa  214  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  41.42 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  42.25 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  42.42 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  45.88 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  43.68 
 
 
272 aa  211  7.999999999999999e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  43.36 
 
 
284 aa  209  5e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  40.31 
 
 
270 aa  204  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  41.48 
 
 
278 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  43.9 
 
 
283 aa  203  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  42.74 
 
 
264 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  40.29 
 
 
285 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  40.33 
 
 
272 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  38.84 
 
 
272 aa  192  4e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  40.08 
 
 
276 aa  187  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  38.52 
 
 
281 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  37.86 
 
 
279 aa  178  9e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  36.89 
 
 
281 aa  177  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  36.89 
 
 
281 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  39.6 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  32.73 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  37.08 
 
 
279 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  38.68 
 
 
287 aa  172  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  42.74 
 
 
332 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  35.92 
 
 
381 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  35.36 
 
 
268 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.61 
 
 
272 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  37.01 
 
 
278 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1147  phosphate binding protein  34.63 
 
 
263 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  36.71 
 
 
284 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  37.23 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  36.82 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  36.69 
 
 
299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  37.26 
 
 
276 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  36.63 
 
 
277 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  38.8 
 
 
272 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  38.8 
 
 
272 aa  158  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  39.11 
 
 
272 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  35.57 
 
 
294 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  38.78 
 
 
330 aa  157  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  34.08 
 
 
273 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  34.78 
 
 
277 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  35.91 
 
 
292 aa  156  4e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  35.89 
 
 
273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  35.77 
 
 
281 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  33.09 
 
 
277 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  34.13 
 
 
274 aa  152  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  36.61 
 
 
218 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  34.78 
 
 
274 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  36.89 
 
 
285 aa  150  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  36.89 
 
 
284 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  34.55 
 
 
278 aa  149  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  34.26 
 
 
273 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  32.39 
 
 
292 aa  148  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  36.36 
 
 
328 aa  146  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  35.66 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.98 
 
 
298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  37.55 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 
273 aa  144  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  32.33 
 
 
274 aa  144  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  32.65 
 
 
303 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.7 
 
 
291 aa  142  6e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  35.34 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  36.43 
 
 
302 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  32.03 
 
 
269 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  31.73 
 
 
298 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  31.1 
 
 
281 aa  137  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0750  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.06 
 
 
300 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.87 
 
 
278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.45 
 
 
302 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0589  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.61 
 
 
293 aa  135  6.0000000000000005e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000214948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4587  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  33.47 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.668295 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0603  phosphate binding protein  33.47 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0770  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.66 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000063317 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  33.61 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0784  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein, putative  32.66 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.507413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0681  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.66 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.66 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0625  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.66 
 
 
308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0278418  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0844  putative phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.66 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0715  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  32.66 
 
 
299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1568  phosphate binding protein  29.69 
 
 
290 aa  132  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000201952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0473  phosphate binding protein  34.57 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0631  phosphate binding protein  32.66 
 
 
304 aa  132  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0547  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.16 
 
 
300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000976943  unclonable  2.05428e-28 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  31.2 
 
 
270 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  31.97 
 
 
286 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001521  ABC transporter substrate-binding protein  32.49 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000647387  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1882  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.2 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.628761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>