156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0524 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0524  HPP family protein  100 
 
 
178 aa  349  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.734133  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1921  HPP family protein  55.93 
 
 
178 aa  170  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0464  HPP family protein+B94  55.43 
 
 
175 aa  169  2e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.938531 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0138  HPP family protein+B94  55.49 
 
 
179 aa  166  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0469  HPP family protein  50 
 
 
207 aa  157  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1999  CBS domain-containing protein  46.01 
 
 
199 aa  156  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0632  HPP family protein+B94  45.3 
 
 
183 aa  154  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4921  HPP family protein  48.1 
 
 
199 aa  151  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2508  HPP family protein  48.41 
 
 
231 aa  150  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000920608  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0503  HPP family membrane protein  52 
 
 
186 aa  147  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0078  HPP family protein?  48.33 
 
 
182 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0083  HPP family protein?  48.33 
 
 
182 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0730  HPP family protein  48.72 
 
 
194 aa  137  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0081  HPP family protein  48.33 
 
 
182 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0079  HPP family protein  48.33 
 
 
182 aa  137  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3855  HPP family protein  46.11 
 
 
182 aa  137  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0083  HPP family protein  47.78 
 
 
182 aa  137  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.687562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4271  HPP family protein  47.78 
 
 
182 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3792  HPP family protein  41.18 
 
 
190 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0064  HPP family protein+B94  47.78 
 
 
182 aa  136  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0081  HPP family protein  47.78 
 
 
182 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2401  HPP  48.3 
 
 
178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0666  HPP family protein+B94  48.04 
 
 
174 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000611096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3346  CBS domain-containing protein  45.3 
 
 
182 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6723  HPP family protein  47.13 
 
 
185 aa  131  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.250369  normal  0.81684 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1127  HPP  37.84 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.020454  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2629  HPP family protein?  38.56 
 
 
164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0334543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1960  CBS domain-containing protein  39.35 
 
 
180 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.831698  normal  0.993391 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1207  HPP family protein+B94  47.88 
 
 
176 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2445  HPP family protein  47.78 
 
 
202 aa  121  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1297  HPP family protein  47.31 
 
 
188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000152799 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3703  HPP family protein+B94  45.81 
 
 
188 aa  117  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.422801  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2325  CBS domain-containing protein  50.79 
 
 
285 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820911  normal  0.700753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3150  HPP family protein  40.23 
 
 
164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.970731  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1896  HPP family protein  43.21 
 
 
190 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.891291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2943  HPP family protein+B94  43.05 
 
 
189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00825304  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2928  HPP family protein?  46.75 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2126  HPP domain-containing protein  40.91 
 
 
173 aa  111  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.821618  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0299  HPP  41.01 
 
 
175 aa  111  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.618442  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1929  HPP  45.6 
 
 
323 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.171366  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4302  HPP family protein  47.74 
 
 
238 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  44.81 
 
 
392 aa  108  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4307  hypothetical protein  42.52 
 
 
184 aa  104  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4702  CBS domain containing membrane protein  47.24 
 
 
379 aa  104  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0125248  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  50.42 
 
 
378 aa  104  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6427  CBS domain-containing protein  46.46 
 
 
361 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0999  hypothetical protein  42.52 
 
 
184 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5455  CBS domain containing membrane protein  42.86 
 
 
379 aa  103  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1037  hypothetical protein  40.94 
 
 
184 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86469e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0854  membrane spanning protein  40.94 
 
 
184 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0871  hypothetical protein  40.16 
 
 
184 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00388157  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1124  hypothetical protein  40.94 
 
 
184 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3929  CBS domain-containing protein  41.73 
 
 
325 aa  100  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0895  hypothetical protein  39.37 
 
 
184 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0953  hypothetical protein  39.37 
 
 
184 aa  100  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1197  HPP family protein  39.74 
 
 
382 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.528927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0159  HPP family/CBS domain-containing protein  39.74 
 
 
397 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0437  HPP family protein  39.74 
 
 
397 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1488  HPP family/CBS domain-containing protein  39.74 
 
 
397 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1403  HPP family/CBS domain-containing protein  39.74 
 
 
465 aa  100  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.202725  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1140  HPP family/CBS domain-containing protein  39.74 
 
 
382 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5364  HPP family protein?  38.51 
 
 
383 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344775  normal  0.280172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2087  HPP family protein?  38.89 
 
 
379 aa  100  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.211615  normal  0.139739 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0007  HPP family protein  45.67 
 
 
346 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730187  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0430  HPP family protein?  44.52 
 
 
240 aa  99.4  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.126514  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2361  CBS domain containing membrane protein  44.88 
 
 
379 aa  99  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0859081 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2162  HPP family protein+B94  41.1 
 
 
169 aa  99  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503667  normal  0.0389709 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3928  CBS domain-containing protein  41.4 
 
 
387 aa  98.6  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000126137 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  48.82 
 
 
388 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0846  HPP family protein+B94  36.72 
 
 
207 aa  98.6  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.164128 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2351  HPP domain-containing protein  42.74 
 
 
324 aa  97.1  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5035  CBS domain containing membrane protein  43.08 
 
 
344 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.352033  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4776  HPP family protein  36.08 
 
 
189 aa  97.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1147  CBS domain containing membrane protein  49.61 
 
 
404 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5317  CBS domain containing membrane protein  43.31 
 
 
376 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.955981  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4053  CBS domain-containing protein  40 
 
 
400 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.250275  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  41.22 
 
 
416 aa  95.5  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3426  HPP family protein?  37.64 
 
 
373 aa  94.4  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  44.59 
 
 
382 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  38.36 
 
 
449 aa  93.6  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3655  hypothetical protein  51.54 
 
 
389 aa  93.6  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3821  HPP family protein  38.86 
 
 
404 aa  93.6  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0819644  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1304  CBS domain-containing protein  41.14 
 
 
391 aa  92.8  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.388311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  49.61 
 
 
373 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5763  CBS domain-containing protein  41.77 
 
 
391 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  44.59 
 
 
382 aa  92.4  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3965  CBS domain-containing protein  41.14 
 
 
391 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.23088  normal  0.173621 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4427  CBS domain-containing protein  41.14 
 
 
391 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.963922  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  38.95 
 
 
368 aa  92  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1473  CBS domain-containing protein  42.42 
 
 
390 aa  92  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.103531 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15991  hypothetical protein  36.14 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.456081  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1392  hypothetical protein  37.25 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4119  CBS domain-containing protein  40.51 
 
 
399 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2548  HPP family protein?  39.52 
 
 
391 aa  88.6  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.709048 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3827  CBS domain-containing protein  39.87 
 
 
391 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.940711  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4541  CBS domain-containing protein  39.87 
 
 
391 aa  88.2  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.6284  normal  0.0139408 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3090  HPP family protein?  37.25 
 
 
159 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3233  HPP family protein?  37.25 
 
 
159 aa  87.8  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1070  HPP family protein  42.74 
 
 
301 aa  87  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496114  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2981  HPP family protein  37.75 
 
 
159 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>