More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0462 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  55.82 
 
 		 595 aa  637    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  52.78 
 
 		 630 aa  655    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  53.46 
 
 		 598 aa  637    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  53.32 
 
 		 606 aa  660    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  51.33 
 
 		 603 aa  650    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  53.67 
 
 		 617 aa  667    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  53.63 
 
 		 629 aa  647    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  53.19 
 
 		 600 aa  638    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  53.43 
 
 		 650 aa  645    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  52.47 
 
 		 620 aa  649    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 608 aa  1238    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 		 613 aa  667    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 602 aa  640    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  51.43 
 
 		 604 aa  643    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 		 617 aa  662    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  56.49 
 
 		 615 aa  684    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  54.98 
 
 		 617 aa  662    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  77.87 
 
 		 614 aa  966    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  79.26 
 
 		 613 aa  973    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  56.49 
 
 		 615 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  54.7 
 
 		 620 aa  670    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  70.18 
 
 		 619 aa  885    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  53.19 
 
 		 630 aa  651    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  53.47 
 
 		 605 aa  657    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1260  GTP-binding protein TypA  67.77 
 
 		 613 aa  850    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.826692  normal  0.0575842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  56.49 
 
 		 615 aa  682    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  57.31 
 
 		 616 aa  693    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1761  small GTP-binding protein  65.44 
 
 		 634 aa  796    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  58.25 
 
 		 605 aa  704    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  53.89 
 
 		 593 aa  635    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  59.33 
 
 		 608 aa  751    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 		 610 aa  647    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  52.4 
 
 		 610 aa  647    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  52.88 
 
 		 622 aa  645    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  51.77 
 
 		 641 aa  646    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  55.41 
 
 		 608 aa  678    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  53.23 
 
 		 620 aa  653    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  80.07 
 
 		 612 aa  1003    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  55.72 
 
 		 630 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  56.83 
 
 		 594 aa  685    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  54.13 
 
 		 614 aa  670    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  58.95 
 
 		 594 aa  709    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  53.4 
 
 		 608 aa  634  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0359  GTP-binding protein TypA  53.28 
 
 		 614 aa  633  1e-180  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.584062  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  52.88 
 
 		 624 aa  634  1e-180  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 608 aa  632  1e-180  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4060  GTP-binding protein TypA  52.74 
 
 		 631 aa  632  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0939929  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  52.17 
 
 		 610 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  52.45 
 
 		 598 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  51.99 
 
 		 599 aa  631  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  52.77 
 
 		 614 aa  629  1e-179  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  51.66 
 
 		 616 aa  629  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  53.28 
 
 		 632 aa  627  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  53.28 
 
 		 605 aa  628  1e-178  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  52.43 
 
 		 607 aa  625  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  52.01 
 
 		 607 aa  626  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26090  GTP-binding protein TypA/BipA  51.81 
 
 		 636 aa  626  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.876916 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3364  GTP-binding protein TypA  52.1 
 
 		 607 aa  625  1e-178  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  52.68 
 
 		 601 aa  627  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 608 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 608 aa  622  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15530  small GTP-binding protein domain protein  52.02 
 
 		 636 aa  622  1e-177  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 608 aa  622  1e-177  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2264  GTP-binding protein TypA  52.36 
 
 		 607 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687417 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  53.86 
 
 		 608 aa  623  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  53.19 
 
 		 606 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  53.19 
 
 		 606 aa  624  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  51.9 
 
 		 621 aa  622  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 		 610 aa  622  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  51.91 
 
 		 608 aa  622  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  52.91 
 
 		 602 aa  624  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2817  GTP-binding protein TypA  52.1 
 
 		 642 aa  624  1e-177  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.664891  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0330  GTP-binding protein TypA/BipA  51.83 
 
 		 608 aa  623  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 		 606 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 601 aa  619  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0987  GTP-binding protein TypA  51.51 
 
 		 645 aa  620  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0410239  normal  0.953039 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 608 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  52.18 
 
 		 608 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  52.18 
 
 		 608 aa  619  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  52.6 
 
 		 614 aa  621  1e-176  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 608 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1268  GTP-binding protein TypA  51.67 
 
 		 629 aa  619  1e-176  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.352532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 608 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0793  GTP-binding protein TypA  51.37 
 
 		 635 aa  619  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 608 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  51.5 
 
 		 606 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  53.52 
 
 		 608 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0343  GTP-binding protein TypA  52.36 
 
 		 607 aa  621  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 607 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 607 aa  615  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  52.85 
 
 		 608 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  52.82 
 
 		 606 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  52.82 
 
 		 606 aa  616  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  50.67 
 
 		 603 aa  616  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31160  GTP-binding protein TypA/BipA  52.74 
 
 		 640 aa  615  1e-175  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  51.57 
 
 		 608 aa  617  1e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  51.17 
 
 		 607 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  53.02 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  53.02 
 
 		 608 aa  615  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2535  GTP-binding protein TypA  52.2 
 
 		 642 aa  618  1e-175  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000592047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>