16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0452 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0452  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  361  3e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0660965  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1774  hypothetical protein  41.61 
 
 
179 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.428331  normal  0.223629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0071  hypothetical protein  37.65 
 
 
181 aa  140  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233632 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2270  hypothetical protein  32.61 
 
 
176 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1145  hypothetical protein  32.78 
 
 
178 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.731789  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0234  hypothetical protein  30.51 
 
 
189 aa  96.7  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.621002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1607  hypothetical protein  34.81 
 
 
163 aa  93.6  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0255  hypothetical protein  33.76 
 
 
196 aa  92.8  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0449  hypothetical protein  35.14 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000134264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0269  hypothetical protein  30.56 
 
 
172 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.133845  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0036  hypothetical protein  26.25 
 
 
148 aa  55.5  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0043  hypothetical protein  30.33 
 
 
147 aa  53.9  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1850  hypothetical protein  25.32 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000113368  normal  0.143422 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1949  hypothetical protein  30.83 
 
 
136 aa  47  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.372883  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0702  hypothetical protein  22.36 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.171887  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2314  hypothetical protein  29.69 
 
 
156 aa  44.3  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>