More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0429 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 687 aa  1409    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  32.12 
 
 		 715 aa  307  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1458  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 694 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.552636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 720 aa  276  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 853 aa  271  4e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 851 aa  270  7e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1486  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 693 aa  254  4.0000000000000004e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 695 aa  243  7.999999999999999e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 720 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 724 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 690 aa  219  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 732 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 733 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 690 aa  212  2e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.02 
 
 		 695 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 710 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 763 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 757 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 747 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 704 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 712 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 700 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 749 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 737 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 748 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.7 
 
 		 759 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 757 aa  194  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 783 aa  194  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 732 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  27.81 
 
 		 685 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 670 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 713 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 697 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 753 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 680 aa  189  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 751 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 771 aa  189  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 666 aa  188  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 732 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 755 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 783 aa  186  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 723 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 736 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 773 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 822 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 726 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2495  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 712 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.237347 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 765 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 755 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 743 aa  183  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 794 aa  183  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 729 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 730 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1802  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 743 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 641 aa  181  4.999999999999999e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 744 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 762 aa  180  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  25.58 
 
 		 729 aa  180  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 773 aa  180  8e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 753 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 802 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 769 aa  179  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 761 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2484  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 744 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000223864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 728 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 792 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 771 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 741 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 795 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.03 
 
 		 755 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 743 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 774 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 764 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 734 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 713 aa  172  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 763 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 736 aa  172  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 790 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.84 
 
 		 739 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2161  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 729 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 743 aa  171  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 779 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 710 aa  170  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 780 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 766 aa  170  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 761 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 722 aa  170  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 746 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 722 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1660  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 729 aa  169  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000750921  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 753 aa  168  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 798 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3405  outer membrane protein  26.23 
 
 		 714 aa  168  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.411389  normal  0.175669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 790 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2715  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 733 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 730 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 745 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 702 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>