More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0398 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
352 aa  737    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  35.13 
 
 
365 aa  194  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  37.05 
 
 
341 aa  189  5e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 
334 aa  176  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.35 
 
 
341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 
321 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  40.54 
 
 
321 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  40.98 
 
 
347 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  39.9 
 
 
361 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  41.06 
 
 
353 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  41.63 
 
 
336 aa  160  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2696  glycosyl transferase family 2  41.87 
 
 
363 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0236324 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  39.56 
 
 
351 aa  157  3e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 
342 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.71 
 
 
367 aa  153  4e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  33.9 
 
 
327 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 
306 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  34.02 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  38.68 
 
 
305 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  37.67 
 
 
336 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  38.46 
 
 
338 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 
339 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
367 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  40.54 
 
 
341 aa  137  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
347 aa  136  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  33.88 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.36 
 
 
349 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  38.03 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  39.45 
 
 
1250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2876  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  35.92 
 
 
377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  36.92 
 
 
373 aa  129  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1579  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
280 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0249485  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
336 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 
308 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
316 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  32.26 
 
 
340 aa  122  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0270  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
333 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
398 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  37.91 
 
 
334 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
663 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0778  glycosyl transferase family 2  34.91 
 
 
384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  37.44 
 
 
334 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4803  alpha-1,6-rhamnosyltransferase MigA  33.33 
 
 
300 aa  119  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  32.63 
 
 
300 aa  119  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  36.23 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 
280 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  32.87 
 
 
727 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0333  glycosyl transferase family protein  28.22 
 
 
277 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0642645  decreased coverage  0.00000584386 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  34.43 
 
 
334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3103  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
338 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66110  putative glycosyl transferase  32.6 
 
 
294 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0985  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
289 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 
373 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55180  glycosyl transferase  32.87 
 
 
299 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.678126  hitchhiker  0.00000000000937683 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  30.99 
 
 
386 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 
380 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  34.1 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  37.79 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  28.38 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  32.7 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  26.76 
 
 
581 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.72 
 
 
294 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
364 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  35.71 
 
 
336 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1306  glycosyl transferase family 2  30.54 
 
 
283 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0848  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
330 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0711944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2413  glycosyl transferase family polysaccharide deacetylase  29.36 
 
 
672 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.944476  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  32.24 
 
 
333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1408  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
930 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.370987  normal  0.266781 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  28.16 
 
 
332 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  29.72 
 
 
689 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
324 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
314 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  35.5 
 
 
334 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
294 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1741  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
275 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.675758 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1720  N-acetylgalactosaminyl-proteoglycan 3-beta-glucuronosyltransferase  33.48 
 
 
255 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.674928  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 
333 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
597 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1013  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
812 aa  108  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2378  glycosyl transferase family protein  32.68 
 
 
331 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.38 
 
 
312 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0590  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 
294 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1644  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
256 aa  107  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
1177 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 
1177 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0843  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  34.29 
 
 
321 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
1035 aa  106  5e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3348  glycosyl transferase family protein  31.68 
 
 
315 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  28.78 
 
 
318 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  28.17 
 
 
233 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
307 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  28.64 
 
 
283 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
302 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  32.12 
 
 
1015 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>