More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0372 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0372  alanine racemase domain protein  100 
 
 		 237 aa  474  1e-133  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  56.3 
 
 		 272 aa  241  9e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  59 
 
 		 242 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3590  hypothetical protein  55.6 
 
 		 248 aa  214  9e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  53.25 
 
 		 231 aa  210  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  48.5 
 
 		 235 aa  202  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  43.78 
 
 		 227 aa  182  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  49.53 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  44.92 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  38.1 
 
 		 224 aa  176  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  48.89 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  45.98 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  39.83 
 
 		 235 aa  170  2e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  39.47 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  48.08 
 
 		 231 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  42.55 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  42.49 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  42.13 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  42.55 
 
 		 230 aa  162  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1536  hypothetical protein  44.49 
 
 		 229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3054  hypothetical protein  47.53 
 
 		 235 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.281414  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  42.55 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3003  hypothetical protein  44.49 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  43.78 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0341  hypothetical protein  45.92 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  41.87 
 
 		 248 aa  158  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3628  alanine racemase domain-containing protein  44.44 
 
 		 234 aa  158  8e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0245801  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  42.86 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  43.84 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0945  alanine racemase domain-containing protein  45.26 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1344  alanine racemase domain protein  37.5 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000474178  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1630  alanine racemase domain-containing protein  46.29 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00531953 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2415  alanine racemase domain protein  44.59 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  43.11 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  45.58 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5094  alanine racemase domain protein  44.39 
 
 		 228 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.699197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5319  hypothetical protein  44.64 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213827 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  39.15 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5144  alanine racemase domain-containing protein  44.81 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4967  alanine racemase domain-containing protein  43.93 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  44.66 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  45.41 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  45.41 
 
 		 223 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3759  hypothetical protein  45.22 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.125293  normal  0.217424 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  44.4 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0703  alanine racemase domain-containing protein  39.91 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0335  alanine racemase domain protein  43.04 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00537658 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  46.67 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  40.41 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0371  alanine racemase domain-containing protein  41.63 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2071  alanine racemase domain protein  39.04 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  43.1 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1840  alanine racemase domain protein  39.15 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  36.48 
 
 		 235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  42.79 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3981  hypothetical protein  43.1 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.409738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  39.13 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1659  alanine racemase domain protein  40.09 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0477  hypothetical protein  41.89 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3884  hypothetical protein  43.23 
 
 		 229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.508799  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3663  hypothetical protein  36.29 
 
 		 239 aa  145  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152819  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0536  alanine racemase domain-containing protein  39.58 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  42.6 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2919  alanine racemase domain protein  43.35 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.489919  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2732  hypothetical protein  38.97 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.688712  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  39.91 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  39.42 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  32.54 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3263  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  41.85 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5046  hypothetical protein  42.34 
 
 		 228 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.166269  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3443  pyridoxal phosphate enzyme, YggS family  41.85 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0820315 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3347  alanine racemase family  41.85 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.144225 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3339  alanine racemase family protein  41.85 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.519694 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3274  alanine racemase family  41.85 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0475278 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1315  alanine racemase domain protein  31.56 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000152977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3641  hypothetical protein  40.61 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2860  hypothetical protein  37.55 
 
 		 228 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00719508  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  41.56 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  33.19 
 
 		 231 aa  142  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  45.75 
 
 		 227 aa  142  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1215  hypothetical protein  35.47 
 
 		 231 aa  142  6e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.157009  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3879  hypothetical protein  40.77 
 
 		 239 aa  141  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.145132  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0699  alanine racemase domain-containing protein  47.34 
 
 		 232 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.239195  normal  0.289763 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0247  hypothetical protein  47.34 
 
 		 239 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0731  hypothetical protein  47.34 
 
 		 239 aa  141  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18938  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  44.49 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2502  alanine racemase domain-containing protein  44.76 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.936846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3134  alanine racemase domain protein  43.42 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2477  hypothetical protein  40.69 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2801  hypothetical protein  44.34 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  37.66 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1784  alanine racemase domain-containing protein  39.92 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3197  alanine racemase domain-containing protein  39.91 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  34.62 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0830  hypothetical protein  38.91 
 
 		 232 aa  139  6e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3817  hypothetical protein  45.06 
 
 		 257 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.101482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0668  hypothetical protein  41.7 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.208135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1352  alanine racemase domain protein  44.44 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  33.62 
 
 		 234 aa  138  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0621  hypothetical protein  48.36 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>