More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0364 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0364  riboflavin biosynthesis protein RibF  100 
 
 
313 aa  624  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000221325  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3505  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  46.35 
 
 
314 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2451  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.99 
 
 
313 aa  236  4e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2972  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.33 
 
 
314 aa  236  4e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1762  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.76 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1388  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  42.26 
 
 
322 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.47229  normal  0.722394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2599  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.87 
 
 
323 aa  229  6e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1312  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.04 
 
 
312 aa  224  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.152669  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2517  riboflavin biosynthesis protein RibF  43 
 
 
325 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.24857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2686  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.73 
 
 
320 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000517202  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2486  riboflavin biosynthesis protein RibF  46.98 
 
 
314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0979  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.31 
 
 
306 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2304  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  43.31 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2151  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.71 
 
 
330 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1641  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  35.39 
 
 
316 aa  210  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1627  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.19 
 
 
323 aa  209  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1487  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.16 
 
 
322 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.038683  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0907  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.94 
 
 
324 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3662  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.59 
 
 
309 aa  206  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3756  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.1 
 
 
310 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000159125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1127  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.35 
 
 
311 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.823338  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5827  riboflavin biosynthesis protein RibF  46.21 
 
 
310 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3184  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.78 
 
 
311 aa  201  9e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.516481 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2437  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.29 
 
 
325 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237793  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1733  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.14 
 
 
320 aa  199  7e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.155632  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2348  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  42.48 
 
 
324 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400291  hitchhiker  0.00462783 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0577  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  42.57 
 
 
305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1649  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.83 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0602  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.89 
 
 
305 aa  197  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00769126  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3769  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.16 
 
 
311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2214  riboflavin biosynthesis protein RibF  45.08 
 
 
313 aa  196  6e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00156337  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2035  FMN adenylyltransferase, riboflavin kinase  39.87 
 
 
310 aa  195  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2209  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  39.19 
 
 
306 aa  194  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3182  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.46 
 
 
312 aa  195  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.260327  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0245  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.25 
 
 
314 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.694964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1439  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.37 
 
 
325 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_542  FAD synthase  41.22 
 
 
305 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0794866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2196  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.26 
 
 
306 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1375  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.31 
 
 
308 aa  193  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3672  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.25 
 
 
318 aa  192  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000331825  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1054  riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase  43.58 
 
 
320 aa  192  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000197835  hitchhiker  0.0000124783 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2927  riboflavin biosynthesis protein  40.41 
 
 
317 aa  192  7e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0456269 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4025  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.83 
 
 
307 aa  192  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0934279 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14650  FMN adenylyltransferase /riboflavin kinase  42.86 
 
 
313 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0844225  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1187  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  42.76 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1953  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.59 
 
 
311 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1247  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.04 
 
 
308 aa  189  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.856402  normal  0.320696 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1837  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.69 
 
 
311 aa  188  9e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2161  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.72 
 
 
323 aa  188  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0689935  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1782  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.36 
 
 
312 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0330041  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2071  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  38.44 
 
 
310 aa  186  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.275327  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0790  riboflavin biosynthesis protein RibF  34.71 
 
 
309 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.604563 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6523  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.71 
 
 
311 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.782335  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3215  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.27 
 
 
308 aa  186  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2051  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.42 
 
 
328 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12799  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.64 
 
 
331 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1516  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.26 
 
 
336 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2234  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.87 
 
 
317 aa  186  6e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5114  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.23 
 
 
314 aa  185  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.2195  normal  0.077817 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3047  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  41.01 
 
 
306 aa  185  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0533296 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04030  Riboflavin kinase / FAD synthetase  35.66 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1448  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.37 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000276726  normal  0.276932 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1412  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.24 
 
 
315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1337  riboflavin biosynthesis protein RibF  46.28 
 
 
309 aa  183  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107929  hitchhiker  0.00108968 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0930  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.82 
 
 
308 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0321744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0904  riboflavin biosynthesis protein RibF  37.78 
 
 
319 aa  182  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2129  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.48 
 
 
317 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0714  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.1 
 
 
369 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07880  FMN adenylyltransferase;riboflavin kinase  36.36 
 
 
307 aa  181  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2965  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  39.93 
 
 
317 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0760879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1379  riboflavin biosynthesis protein RibF  44.59 
 
 
309 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.672568  normal  0.471041 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0200  riboflavin biosynthesis protein RibF  40.54 
 
 
313 aa  181  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2252  riboflavin biosynthesis protein RibF  42.61 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0853928  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1856  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  37.18 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1843  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.25 
 
 
316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18679  normal  0.346708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3326  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.81 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0873807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0303  riboflavin biosynthesis protein RibF  39.25 
 
 
321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000000735935  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4052  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.78 
 
 
313 aa  179  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.949701  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3365  FMN adenylyltransferase / riboflavin kinase  40.07 
 
 
307 aa  179  4e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3585  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.39 
 
 
315 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.964763  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0839  putative riboflavin kinase/FAD synthase  36.91 
 
 
317 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.123466  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0799  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.25 
 
 
310 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1658  riboflavin biosynthesis protein RibF  41.22 
 
 
319 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2653  riboflavin biosynthesis protein RibF  36.93 
 
 
335 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16921  putative riboflavin kinase/FAD synthase  36.58 
 
 
317 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0709  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40.48 
 
 
314 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0648  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.37 
 
 
322 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0693294 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2457  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  37.1 
 
 
332 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2081  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  42.76 
 
 
333 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.770077  normal  0.190506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2098  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  42.76 
 
 
333 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1082  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.03 
 
 
311 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.134006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1066  riboflavin biosynthesis protein RibF  43.22 
 
 
315 aa  175  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54804  normal  0.0219323 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2144  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  42.76 
 
 
333 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0479663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0643  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  41.37 
 
 
322 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.149232 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1273  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.99 
 
 
296 aa  175  8e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.609723  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0370  riboflavin biosynthesis protein RibF  38.49 
 
 
321 aa  175  8e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.125476  normal  0.302876 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3549  riboflavin biosynthesis protein RibF  32.68 
 
 
311 aa  175  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0201  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40 
 
 
315 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1098  riboflavin biosynthesis protein RibF  35.62 
 
 
311 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0105422  normal  0.148942 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0180  bifunctional riboflavin kinase/FMN adenylyltransferase  40 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.01321  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>