109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0357 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
420 aa  822    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  79.76 
 
 
415 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  80 
 
 
415 aa  585  1e-166  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  75.18 
 
 
417 aa  579  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  57.83 
 
 
426 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  58.55 
 
 
428 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  56.04 
 
 
415 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  55.66 
 
 
427 aa  456  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  55.9 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  31.48 
 
 
352 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  30.65 
 
 
349 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  30.98 
 
 
356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  32.14 
 
 
356 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  30.57 
 
 
360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  31.43 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  31.36 
 
 
305 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  32.84 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  31.45 
 
 
296 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  31.1 
 
 
346 aa  113  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  30.48 
 
 
345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  34.33 
 
 
312 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  29.08 
 
 
361 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  31.05 
 
 
307 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  29.93 
 
 
308 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  30.88 
 
 
305 aa  103  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  32.98 
 
 
394 aa  101  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  27.85 
 
 
350 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  29.47 
 
 
307 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  30.77 
 
 
356 aa  99.4  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  29.47 
 
 
307 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  27.22 
 
 
350 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  34.77 
 
 
339 aa  97.8  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  29.93 
 
 
343 aa  95.9  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  31 
 
 
306 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  33.33 
 
 
303 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  27.92 
 
 
354 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  29.6 
 
 
330 aa  94.4  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  30.63 
 
 
306 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  30.82 
 
 
306 aa  90.5  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  31.2 
 
 
310 aa  90.1  7e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  28.72 
 
 
307 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  32.47 
 
 
306 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.98 
 
 
307 aa  89.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  27.3 
 
 
308 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  30.36 
 
 
329 aa  87.8  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  29.08 
 
 
320 aa  88.2  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  29.59 
 
 
307 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  29.08 
 
 
307 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  28.72 
 
 
308 aa  85.9  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  30.04 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  29.43 
 
 
355 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  28.42 
 
 
316 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  31.31 
 
 
307 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  28.06 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  28.42 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  26.28 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  30.59 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  34.53 
 
 
2798 aa  69.3  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  27.52 
 
 
346 aa  68.6  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  30.28 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  27.98 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  29.25 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  26.6 
 
 
304 aa  66.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  27.17 
 
 
304 aa  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  27.91 
 
 
307 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  30.19 
 
 
307 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  26.21 
 
 
348 aa  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  25.17 
 
 
255 aa  59.7  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  27.59 
 
 
300 aa  57.4  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  29.43 
 
 
323 aa  56.6  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  26.29 
 
 
307 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  28.77 
 
 
260 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  23.04 
 
 
342 aa  52  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  38.55 
 
 
253 aa  51.2  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  38.1 
 
 
267 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  28.98 
 
 
277 aa  50.8  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  36.26 
 
 
262 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  36.26 
 
 
262 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  25.26 
 
 
313 aa  49.7  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  36.26 
 
 
139 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  26.34 
 
 
257 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  44.44 
 
 
260 aa  47.4  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  35.14 
 
 
291 aa  47  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  26.12 
 
 
325 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  30.61 
 
 
260 aa  47  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4544  hypothetical protein  37.84 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  24.71 
 
 
257 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1576  hypothetical protein  30.69 
 
 
251 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0534124  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  38.36 
 
 
264 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4222  hypothetical protein  39.44 
 
 
261 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2291  hypothetical protein  28.78 
 
 
266 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.734365  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  37.23 
 
 
291 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0286  protein of unknown function DUF81  30.17 
 
 
254 aa  45.8  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  37.23 
 
 
291 aa  45.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3780  hypothetical protein  27.76 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609948  hitchhiker  0.00315087 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  39.73 
 
 
119 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1803  protein of unknown function DUF81  45.71 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173371  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1991  protein of unknown function DUF81  50 
 
 
262 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.808685  hitchhiker  0.00550419 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11828  hypothetical protein  38.37 
 
 
266 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>