More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0318 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0318  Chloride channel core  100 
 
 		 511 aa  1011    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000450379  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  30.69 
 
 		 519 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  30.42 
 
 		 519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.82 
 
 		 526 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1400  chloride channel protein  36.19 
 
 		 523 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.340394  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1662  voltage-gated chloride channel family protein  36.19 
 
 		 523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  31.94 
 
 		 510 aa  191  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1830  chloride channel protein EriC  34.15 
 
 		 512 aa  181  2e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.116382  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0757  Chloride channel core  35.07 
 
 		 528 aa  181  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.937422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1891  chloride channel protein EriC  30.53 
 
 		 534 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.85971e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  31.12 
 
 		 563 aa  168  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0386  chloride channel protein EriC  32.98 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000543407 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1107  voltage-gated chloride channel family protein  30 
 
 		 510 aa  163  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  27.36 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  32.52 
 
 		 533 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1147  chloride channel protein EriC  31.67 
 
 		 487 aa  154  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.433892  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2179  voltage-gated chloride channel  28.09 
 
 		 528 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  29.98 
 
 		 466 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  31.71 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  30.34 
 
 		 538 aa  147  6e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  29.66 
 
 		 473 aa  147  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  29.66 
 
 		 473 aa  146  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  29.66 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  29.66 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  29.66 
 
 		 473 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0391  chloride channel, core  30 
 
 		 516 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000201773  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  32.08 
 
 		 479 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0552  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.75 
 
 		 437 aa  139  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0845  chloride channel protein EriC  30.58 
 
 		 512 aa  136  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0189  chloride channel, core  26.02 
 
 		 445 aa  133  7.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0449  Chloride channel core  28.81 
 
 		 428 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0487186  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  29.4 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  29.4 
 
 		 478 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  29.4 
 
 		 478 aa  131  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  29.66 
 
 		 463 aa  130  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  30.21 
 
 		 569 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1346  chloride channel protein  35.51 
 
 		 527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  31.98 
 
 		 435 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  30.77 
 
 		 470 aa  128  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0118  chloride transporter, ClC family  32.86 
 
 		 455 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0459  chloride channel protein  30.65 
 
 		 468 aa  123  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.511438  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2176  chloride channel protein  28.81 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.462447  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000478  H(+)/Cl(-) exchange transporter ClcA  29.1 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.791443  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4719  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.63 
 
 		 439 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2366  Cl- channel voltage-gated family protein  26.14 
 
 		 416 aa  120  7.999999999999999e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.97 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  31.97 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  31.97 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2009  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.52 
 
 		 443 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  31.74 
 
 		 472 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1697  chloride channel protein  29.26 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1588  Cl- channel, voltage gated  32.21 
 
 		 539 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000108225  normal  0.782392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2460  chloride channel core  31.51 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11718  normal  0.460638 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1698  chloride channel protein  27.58 
 
 		 427 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4138  Chloride channel core  29.36 
 
 		 455 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0212  chloride channel protein  28.04 
 
 		 456 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06233  chloride channel protein  29.06 
 
 		 468 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5126  Chloride channel core  29.18 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.967493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3829  chloride channel core  28.64 
 
 		 455 aa  104  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00154  chloride channel protein  29.06 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0502549  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3447  Chloride channel core  29.06 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0160  chloride channel protein  29.06 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0165  chloride channel protein  29.06 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0159  chloride channel protein  28.83 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0147  chloride channel protein  28.6 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0167  chloride channel protein  29.06 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00153  hypothetical protein  29.06 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0410723  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3504  chloride channel protein  29.06 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.17992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  27.98 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.93 
 
 		 584 aa  98.6  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3026  chloride channel protein  32.98 
 
 		 436 aa  97.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.139269  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2509  chloride channel protein  31.44 
 
 		 455 aa  96.3  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0310  CBS  29.38 
 
 		 615 aa  94.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  29.46 
 
 		 440 aa  93.6  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6390  Chloride channel core  30.25 
 
 		 604 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.315587  normal  0.638262 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  28.82 
 
 		 436 aa  93.2  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4536  Chloride channel core  29.69 
 
 		 603 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5349  chloride channel core  30.13 
 
 		 605 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.791997 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2094  Chloride channel core  31.86 
 
 		 603 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0814  voltage-gated chloride channel  28.37 
 
 		 461 aa  87  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.802011  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0956  Chloride channel core  28.37 
 
 		 461 aa  87  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  29.92 
 
 		 444 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  30.69 
 
 		 449 aa  86.3  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  31 
 
 		 598 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  26.29 
 
 		 863 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0041  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.15 
 
 		 587 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3939  chloride channel core  32.02 
 
 		 600 aa  84.7  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.194745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.25 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0433  Cl- channel, voltage-gated family protein  30.26 
 
 		 575 aa  84.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.346865  normal  0.0128311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1327  chloride channel core  30.52 
 
 		 579 aa  83.6  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.775399  normal  0.325244 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0583  Chloride channel core  26.04 
 
 		 462 aa  83.6  0.000000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  27.3 
 
 		 859 aa  82.8  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0546  Cl- channel, voltage gated  27.11 
 
 		 559 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3181  chloride channel core  28.8 
 
 		 669 aa  82  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  30.08 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  28 
 
 		 863 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  30.24 
 
 		 451 aa  82  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2543  putative voltage-gated ClC-type chloride channel ClcB  27.01 
 
 		 591 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.232119  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  27.6 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5804  Chloride channel core  30.73 
 
 		 633 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>