More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0304 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  47.18 
 
 		 757 aa  665    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  47.91 
 
 		 768 aa  685    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  44.86 
 
 		 765 aa  659    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2652  DNA topoisomerase I  45.45 
 
 		 759 aa  654    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2522  DNA topoisomerase I  45.45 
 
 		 759 aa  653    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2711  DNA topoisomerase I  44.77 
 
 		 779 aa  635    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000391579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  49.53 
 
 		 836 aa  694    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  47.54 
 
 		 693 aa  636    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  68.65 
 
 		 760 aa  1086    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  64.05 
 
 		 746 aa  986    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  46.86 
 
 		 841 aa  674    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  60.75 
 
 		 751 aa  948    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  45.31 
 
 		 702 aa  640    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0891  DNA topoisomerase I  47.05 
 
 		 758 aa  675    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000570299  decreased coverage  1.1513e-16 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  66.93 
 
 		 747 aa  1056    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  100 
 
 		 748 aa  1545    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  49.14 
 
 		 758 aa  730    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2699  DNA topoisomerase  50.13 
 
 		 831 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.737668  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4389  DNA topoisomerase I  46.36 
 
 		 793 aa  638    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00166014  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2885  DNA topoisomerase I  49.61 
 
 		 831 aa  738    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106774  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  44.99 
 
 		 765 aa  661    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  47.44 
 
 		 851 aa  680    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  47.44 
 
 		 851 aa  680    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  45.96 
 
 		 853 aa  688    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  49.32 
 
 		 789 aa  690    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2693  DNA topoisomerase I  50.59 
 
 		 813 aa  755    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305019  normal  0.0402807 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  69.36 
 
 		 758 aa  1063    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  49.19 
 
 		 780 aa  671    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3266  DNA topoisomerase I  46.69 
 
 		 758 aa  649    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000837338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  49.28 
 
 		 767 aa  735    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  45.49 
 
 		 783 aa  660    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2792  DNA topoisomerase I  49.74 
 
 		 831 aa  741    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0208029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  46.04 
 
 		 756 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  46 
 
 		 776 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  50.98 
 
 		 894 aa  724    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  44.25 
 
 		 710 aa  635    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  45.81 
 
 		 697 aa  633  1e-180  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1529  DNA topoisomerase I  44.77 
 
 		 779 aa  633  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.23259e-34 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  48.06 
 
 		 711 aa  635  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  46.91 
 
 		 691 aa  629  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  48.29 
 
 		 696 aa  627  1e-178  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  43.47 
 
 		 693 aa  622  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  45.47 
 
 		 695 aa  617  1e-175  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  44.12 
 
 		 686 aa  615  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  46.85 
 
 		 692 aa  613  9.999999999999999e-175  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  44.95 
 
 		 697 aa  610  1e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  47.28 
 
 		 692 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  47.13 
 
 		 692 aa  609  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  47.28 
 
 		 692 aa  609  1e-173  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  47.28 
 
 		 692 aa  609  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  43.89 
 
 		 706 aa  609  1e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  47.28 
 
 		 692 aa  609  1e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  47.13 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  47.28 
 
 		 692 aa  607  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  47.13 
 
 		 692 aa  606  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  46.99 
 
 		 692 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  47.28 
 
 		 692 aa  608  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  42.91 
 
 		 694 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  44.76 
 
 		 693 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  43.38 
 
 		 711 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  44.71 
 
 		 696 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  43.73 
 
 		 706 aa  599  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  45.28 
 
 		 691 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  44.69 
 
 		 836 aa  600  1e-170  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  45.28 
 
 		 691 aa  599  1e-170  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  45.33 
 
 		 700 aa  599  1e-170  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  45.42 
 
 		 700 aa  601  1e-170  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  44.51 
 
 		 689 aa  594  1e-168  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  45.62 
 
 		 691 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  45.05 
 
 		 859 aa  595  1e-168  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  43.62 
 
 		 715 aa  593  1e-168  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0012  DNA topoisomerase I/SWI domain fusion protein  44.41 
 
 		 865 aa  587  1e-166  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.25431  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  42.51 
 
 		 743 aa  587  1e-166  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  42.66 
 
 		 706 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  44.71 
 
 		 703 aa  584  1.0000000000000001e-165  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  43.32 
 
 		 714 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  45.55 
 
 		 691 aa  580  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  42.55 
 
 		 684 aa  582  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  44.2 
 
 		 703 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0158  DNA topoisomerase I  42.84 
 
 		 765 aa  576  1.0000000000000001e-163  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  44.44 
 
 		 696 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  44.1 
 
 		 703 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  42.4 
 
 		 708 aa  576  1.0000000000000001e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  45.62 
 
 		 694 aa  572  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  47.09 
 
 		 845 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  43.76 
 
 		 694 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  42.82 
 
 		 721 aa  562  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  42.05 
 
 		 798 aa  560  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  42.29 
 
 		 804 aa  556  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  44.61 
 
 		 708 aa  555  1e-157  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  42.04 
 
 		 798 aa  555  1e-157  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  44.34 
 
 		 669 aa  555  1e-157  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  42.08 
 
 		 870 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0932  DNA topoisomerase I  44.51 
 
 		 914 aa  555  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.231933  normal  0.891499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  43.66 
 
 		 690 aa  552  1e-156  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  42.37 
 
 		 798 aa  554  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  44.27 
 
 		 694 aa  552  1e-156  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  41.82 
 
 		 869 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0075  DNA topoisomerase I  44.28 
 
 		 798 aa  548  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  42.29 
 
 		 868 aa  547  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>