More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0291 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0291  recombinase A  100 
 
 		 359 aa  725    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000893894  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  79.66 
 
 		 357 aa  587  1e-167  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0876  recombinase A  81.71 
 
 		 357 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  75.71 
 
 		 351 aa  565  1e-160  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0310  recombinase A  75.22 
 
 		 355 aa  548  1e-155  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3180  recombinase A  74.65 
 
 		 353 aa  522  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  66.57 
 
 		 379 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  62.76 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  63.11 
 
 		 365 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  63.44 
 
 		 364 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  61.49 
 
 		 363 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  61.49 
 
 		 363 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  60.91 
 
 		 350 aa  438  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  65.22 
 
 		 390 aa  438  9.999999999999999e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2082  recombinase A  61.49 
 
 		 347 aa  437  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  61.47 
 
 		 355 aa  435  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  62.17 
 
 		 362 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  59.77 
 
 		 362 aa  436  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  62.65 
 
 		 347 aa  436  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  61.45 
 
 		 364 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  65.34 
 
 		 357 aa  436  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  60.63 
 
 		 362 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  64.09 
 
 		 357 aa  435  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  60.92 
 
 		 363 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  61.85 
 
 		 378 aa  435  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  61.36 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2094  recombinase A  61.61 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  63.41 
 
 		 352 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  63.03 
 
 		 336 aa  434  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  63.19 
 
 		 343 aa  431  1e-120  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  64.06 
 
 		 343 aa  431  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  60.52 
 
 		 348 aa  433  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  60.52 
 
 		 348 aa  432  1e-120  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  61.76 
 
 		 341 aa  431  1e-120  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  62.97 
 
 		 358 aa  431  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  63.11 
 
 		 366 aa  433  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  60.58 
 
 		 362 aa  431  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  63.61 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  63.31 
 
 		 343 aa  431  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  64.13 
 
 		 356 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  64.13 
 
 		 356 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  64.13 
 
 		 356 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  63.31 
 
 		 343 aa  431  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  65.03 
 
 		 356 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  60.47 
 
 		 350 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  61.54 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  64.86 
 
 		 384 aa  431  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  62.88 
 
 		 361 aa  430  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0618  recA protein  63.98 
 
 		 347 aa  430  1e-119  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.186792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  64.44 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  64.62 
 
 		 349 aa  430  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  64.44 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  64.44 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  62.68 
 
 		 345 aa  427  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  63.81 
 
 		 359 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5979  recombinase A  64.13 
 
 		 348 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  64.44 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  62.77 
 
 		 376 aa  430  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2002  recombinase A  61.54 
 
 		 345 aa  430  1e-119  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  64.44 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  62.24 
 
 		 366 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  62.68 
 
 		 345 aa  427  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  61.56 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  61.3 
 
 		 358 aa  428  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  63 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0650  recombinase A  63.81 
 
 		 357 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  62.08 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  66.98 
 
 		 377 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  62.66 
 
 		 358 aa  428  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  59.94 
 
 		 347 aa  431  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  64.44 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  61.61 
 
 		 350 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  60.79 
 
 		 379 aa  429  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  63.81 
 
 		 359 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  62.39 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  62.76 
 
 		 343 aa  429  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  62.05 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  64.44 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  62.09 
 
 		 358 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  63.64 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  62.77 
 
 		 347 aa  427  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2047  recombinase A  62.01 
 
 		 343 aa  425  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.161674  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  61.75 
 
 		 347 aa  425  1e-118  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  61.23 
 
 		 345 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  63.91 
 
 		 342 aa  426  1e-118  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  63.64 
 
 		 338 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0019  recombinase A  64.99 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  62.12 
 
 		 368 aa  425  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  60.73 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  60.53 
 
 		 360 aa  425  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  59.36 
 
 		 418 aa  427  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  61.85 
 
 		 359 aa  427  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  60.73 
 
 		 358 aa  426  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  60.36 
 
 		 350 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  60.95 
 
 		 350 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1669  recombinase A  61.4 
 
 		 343 aa  423  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1845  recombinase A  61.4 
 
 		 343 aa  423  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  61.47 
 
 		 353 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  60.84 
 
 		 383 aa  423  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  62.15 
 
 		 347 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>