More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0271 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  100 
 
 
310 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  58.52 
 
 
313 aa  391  1e-108  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  58.28 
 
 
313 aa  384  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  53.27 
 
 
308 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  43.04 
 
 
334 aa  226  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  38.86 
 
 
323 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  53.44 
 
 
406 aa  206  4e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  37.11 
 
 
368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  36.12 
 
 
328 aa  194  2e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  38.04 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  35.52 
 
 
335 aa  179  4.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3855  DNA-cytosine methyltransferase  35.56 
 
 
313 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.45727e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  35.33 
 
 
345 aa  172  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  32.04 
 
 
370 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  36.19 
 
 
379 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  33.64 
 
 
423 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  33.74 
 
 
423 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  32.03 
 
 
362 aa  160  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  30.89 
 
 
361 aa  155  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0022  DNA-cytosine methyltransferase  32.22 
 
 
465 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0809764  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  30.52 
 
 
357 aa  149  6e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  30.21 
 
 
417 aa  145  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  34.1 
 
 
337 aa  143  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  31.11 
 
 
438 aa  142  6e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  30.29 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1155  DNA-cytosine methyltransferase  32.2 
 
 
317 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2869  DNA-cytosine methyltransferase  29.74 
 
 
409 aa  139  6e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000758151  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3399  DNA-cytosine methyltransferase  30.37 
 
 
356 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273087  hitchhiker  0.000000104958 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0206  DNA-cytosine methyltransferase  31.07 
 
 
398 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.711166  hitchhiker  0.00000436024 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  30.89 
 
 
305 aa  138  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1453  DNA-cytosine methyltransferase  30.92 
 
 
342 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1132  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 
395 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.53813  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  28.35 
 
 
328 aa  136  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0101  C-5 cytosine-specific DNA methylase  30.08 
 
 
431 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999272  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  32.37 
 
 
381 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  29.07 
 
 
416 aa  135  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2889  DNA-cytosine methyltransferase  30.98 
 
 
373 aa  134  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000172243  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04735  DNA (cytosine-5)-methyltransferase PliMCI  29.74 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.584322  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26030  DNA-methyltransferase Dcm  30.69 
 
 
431 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4319  DNA-cytosine methyltransferase family protein  31.46 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00165512 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3989  DNA-cytosine methyltransferase  30.93 
 
 
348 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.519304  normal  0.0147961 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1510  DNA-cytosine methyltransferase  30.31 
 
 
414 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3572  DNA-cytosine methyltransferase  29.82 
 
 
370 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  unclonable  0.0000000000674254  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1243  DNA-cytosine methyltransferase  30.84 
 
 
325 aa  132  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2522  transcriptional regulator, XRE family  30.7 
 
 
468 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153243  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1093  DNA-cytosine methyltransferase  32.27 
 
 
386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0931  DNA-cytosine methyltransferase  30.26 
 
 
474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0961  DNA-cytosine methyltransferase  31.45 
 
 
350 aa  130  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151605  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  27.99 
 
 
415 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0121  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.81 
 
 
395 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7069  DNA-cytosine methyltransferase  27.2 
 
 
393 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00000135592  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  28.44 
 
 
320 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4652  DNA-cytosine methyltransferase  34.96 
 
 
413 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.030739 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2012  DNA-cytosine methyltransferase  29.5 
 
 
398 aa  129  7.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  27.16 
 
 
329 aa  129  8.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.38 
 
 
405 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1183  hypothetical protein  31.53 
 
 
352 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.401368  normal  0.0474441 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1473  DNA-cytosine methyltransferase  29.61 
 
 
360 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0752  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2284  DNA-cytosine methyltransferase  28.46 
 
 
399 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0365  DNA-cytosine methyltransferase family protein  29.43 
 
 
350 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0503  putative C-5 cytosine-specific DNA methylase  30 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.181875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  29.57 
 
 
320 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
416 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0820  putative two-component sensor  37.36 
 
 
489 aa  125  8.000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0815134  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1529  DNA-cytosine methyltransferase  27.51 
 
 
402 aa  125  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000344499  unclonable  0.000000000227525 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4973  DNA-cytosine methyltransferase  29.21 
 
 
373 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2280  DNA-cytosine methyltransferase  30.5 
 
 
313 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.977909 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06638  C5 cytosine methyltransferase DmtAPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q876R1]  31.72 
 
 
615 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0121285  normal  0.227283 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8539  DNA-cytosine methyltransferase  28.24 
 
 
389 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000203506  hitchhiker  0.000040976 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3438  DNA modification cytosine-specific methyltransferase protein  28.78 
 
 
364 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1749  DNA-cytosine methyltransferase  31.56 
 
 
350 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000535565  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2535  DNA-cytosine methyltransferase  30.82 
 
 
400 aa  124  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3736  DNA-cytosine methyltransferase  28.5 
 
 
434 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.730052  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  27.78 
 
 
374 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1018  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
418 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.928901 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0989  DNA-cytosine methyltransferase  28.31 
 
 
418 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1847  DNA-cytosine methyltransferase  30.05 
 
 
446 aa  122  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  26.56 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  34.47 
 
 
362 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  35.71 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0819  modification methylase HaeIII (cytosine-specificmethyltransferase HaeIII; M.HaeIII)  28.02 
 
 
388 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.230352  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  35.64 
 
 
437 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  26.9 
 
 
727 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0531  DNA-cytosine methyltransferase  29.2 
 
 
421 aa  120  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.247848 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0080  DNA-cytosine methyltransferase  27.9 
 
 
371 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.35686  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1383  DNA-cytosine methyltransferase  29.38 
 
 
309 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  27.07 
 
 
324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1675  DNA-cytosine methyltransferase  27.49 
 
 
319 aa  119  7e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  37.2 
 
 
361 aa  119  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2797  DNA-cytosine methyltransferase  40.8 
 
 
399 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0617861  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0416  DNA-cytosine methyltransferase  27.7 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  28.44 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  26.23 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  26.67 
 
 
338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  27.94 
 
 
350 aa  117  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0378  DNA-cytosine methyltransferase  27.58 
 
 
686 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.853393  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1839  DNA-cytosine methyltransferase  27.59 
 
 
318 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.414211  normal  0.341933 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 
350 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  28.09 
 
 
417 aa  116  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>