More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0200 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0200  PfkB domain protein  100 
 
 		 318 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2001  ribokinase-like domain-containing protein  57.61 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0769014  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2935  PfkB domain protein  58.25 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1489  carbohydrate kinase  55.02 
 
 		 308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000020351  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0158  ribokinase-like domain-containing protein  44.41 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0849672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0487  ribokinase-like domain-containing protein  44.41 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.518253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0800  ribokinase-like domain-containing protein  46.01 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3562  PfkB domain protein  45.77 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3450  PfkB domain protein  44.66 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  42.54 
 
 		 318 aa  249  3e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  39.81 
 
 		 316 aa  245  6.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0171  carbohydrate kinase  43.37 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.150341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3935  PfkB  40.06 
 
 		 310 aa  238  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0713343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0209  PfkB  40.13 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3455  PfkB domain protein  40.13 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.327587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0047  carbohydrate kinase  40.58 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  40.06 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0173  PfkB domain protein  40.19 
 
 		 310 aa  228  8e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00145747  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0471  PfkB  39.55 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000138593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2067  Adenosine kinase  38.51 
 
 		 310 aa  226  3e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  38.46 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  41.94 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2784  ribokinase-like domain-containing protein  41.29 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.417689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  38.83 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0526  ribokinase-like domain-containing protein  40.97 
 
 		 312 aa  222  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.846303  normal  0.476119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  38.51 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  38.51 
 
 		 311 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1286  PfkB domain-containing protein  39.41 
 
 		 328 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.324688  normal  0.237222 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0530  carbohydrate kinase, PfkB family  42.26 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00148509  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0688  PfkB domain protein  42.26 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  unclonable  0.00000000405539  hitchhiker  0.000110738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0502  ribokinase-like domain-containing protein  40.65 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04263  sugar kinase  38.83 
 
 		 362 aa  218  7e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.383154  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3506  sugar kinase  41.14 
 
 		 312 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1286  putative ribokinase  41.14 
 
 		 312 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3470  PfkB family kinase  41.14 
 
 		 312 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375649  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3278  putative ribokinase  41.14 
 
 		 312 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3508  PfkB family kinase  41.14 
 
 		 312 aa  218  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0427  putative ribokinase  41.14 
 
 		 312 aa  218  7e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2548  carbohydrate kinase, PfkB  38.85 
 
 		 310 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.636589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1158  ribokinase, putative  40.82 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  40.97 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  40.97 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0600  adenosine kinase  40.97 
 
 		 312 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2634  ribokinase-like domain-containing protein  40.51 
 
 		 314 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.831919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3311  adenosine kinase  40 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.353965  normal  0.464112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3300  adenosine kinase  40 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3362  adenosine kinase  40 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0175719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0527  putative sugar kinase transferase, PfkB  40.71 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  38.36 
 
 		 319 aa  212  7e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  38.49 
 
 		 319 aa  212  9e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  40.71 
 
 		 312 aa  212  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3388  ribokinase-like domain-containing protein  39.66 
 
 		 307 aa  211  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.684995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2666  PfkB domain protein  36.16 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.56784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0955  ribokinase-like domain-containing protein  37.91 
 
 		 339 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.989352  normal  0.38603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0861  ribokinase-like domain-containing protein  40.68 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.035179  normal  0.0608327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2947  adenosine kinase  38.39 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1103  PfkB  38.93 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00948504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3635  ribokinase-like domain-containing protein  38.98 
 
 		 298 aa  206  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.151802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2945  PfkB domain protein  38.64 
 
 		 298 aa  205  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  36.86 
 
 		 325 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3566  adenosine kinase  37.18 
 
 		 323 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0415989  normal  0.0392481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3120  adenosine kinase  36.71 
 
 		 326 aa  203  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3081  PfkB domain protein  35.9 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00739756  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3210  putative sugar kinase transferase protein  39.2 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.258809  decreased coverage  0.003878 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3294  PfkB domain protein  36.22 
 
 		 325 aa  200  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3144  ribokinase-like domain-containing protein  36.31 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1665  Adenosine kinase  36.28 
 
 		 329 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0386  ribokinase-like domain-containing protein  38.54 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1498  ribokinase-like domain-containing protein  38.85 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0953  PfkB domain protein  37.97 
 
 		 300 aa  196  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.940655  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3063  PfkB domain protein  37.97 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.142988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27030  sugar kinase, ribokinase  35.71 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.364358 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4145  PfkB domain-containing protein  37.14 
 
 		 327 aa  193  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786211  decreased coverage  0.0063394 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1493  ribokinase-like domain-containing protein  38.64 
 
 		 298 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12230  carbohydrate kinase cbhK  36.57 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000530804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3303  ribokinase-like domain-containing protein  35.46 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.121546 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1012  putative carbohydrate kinase  36.31 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0637666  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3535  ribokinase-like domain-containing protein  36.1 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32323  decreased coverage  0.000219352 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2506  ribokinase, putative  40.07 
 
 		 283 aa  186  6e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.617052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3153  Adenosine kinase  35.67 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1531  PfkB domain protein  36.33 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0901719  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1798  adenosine kinase  34.5 
 
 		 326 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527553  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2903  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  30 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.859362  hitchhiker  0.00094244 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  28.17 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  27.82 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0967  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  31.48 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  28.83 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  27.84 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0077  PfkB  32.84 
 
 		 299 aa  105  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.273667  normal  0.451983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1080  PfkB domain protein  28.3 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  27.74 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  31.08 
 
 		 296 aa  93.2  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 294 aa  88.2  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1658  ribokinase-like domain-containing protein  28.91 
 
 		 298 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.468132  normal  0.0440332 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  33.33 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  28.44 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 		 307 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  28.9 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  28.3 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  28.03 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>