More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0171 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  100 
 
 		 371 aa  757    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  54.18 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  50.55 
 
 		 370 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  48.78 
 
 		 389 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  47.7 
 
 		 390 aa  361  1e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  47.97 
 
 		 386 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  47.7 
 
 		 386 aa  358  7e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  46.05 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  46.93 
 
 		 391 aa  356  2.9999999999999997e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  46.54 
 
 		 373 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  46.28 
 
 		 373 aa  350  3e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  45.7 
 
 		 373 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  46.4 
 
 		 373 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  45.68 
 
 		 377 aa  345  6e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  49.21 
 
 		 390 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  43.73 
 
 		 380 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  45.07 
 
 		 390 aa  333  2e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  44.39 
 
 		 388 aa  332  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  45.77 
 
 		 390 aa  328  7e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  45.53 
 
 		 389 aa  317  2e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  45.01 
 
 		 369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  42.67 
 
 		 391 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  42.4 
 
 		 391 aa  311  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  41.87 
 
 		 391 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  43.4 
 
 		 370 aa  311  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  41.18 
 
 		 398 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  42.13 
 
 		 408 aa  310  2e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  41.6 
 
 		 391 aa  310  2e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  45.8 
 
 		 380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  41.07 
 
 		 391 aa  309  4e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  41.33 
 
 		 391 aa  308  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  41.33 
 
 		 391 aa  308  8e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  41.07 
 
 		 391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  41.07 
 
 		 391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  45.21 
 
 		 384 aa  305  7e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  40.21 
 
 		 392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  46.76 
 
 		 380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  44.41 
 
 		 375 aa  298  9e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  42.36 
 
 		 379 aa  293  4e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  42.35 
 
 		 403 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  45.93 
 
 		 388 aa  290  2e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  43.28 
 
 		 433 aa  291  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  42.78 
 
 		 395 aa  285  7e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  42.4 
 
 		 380 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  41.69 
 
 		 403 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  42.67 
 
 		 441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  42.9 
 
 		 382 aa  282  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  40.44 
 
 		 378 aa  282  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  42.43 
 
 		 851 aa  282  7.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  42.09 
 
 		 395 aa  280  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  41.42 
 
 		 403 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  47.12 
 
 		 849 aa  279  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  40.05 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  41.46 
 
 		 393 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  41.67 
 
 		 387 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  42.52 
 
 		 384 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  41.22 
 
 		 434 aa  272  6e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  43.01 
 
 		 811 aa  272  7e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  41.18 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  40.32 
 
 		 364 aa  267  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  39.52 
 
 		 395 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  39.78 
 
 		 395 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  46.49 
 
 		 844 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  38.77 
 
 		 389 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  39.04 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  38.77 
 
 		 389 aa  266  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  38.99 
 
 		 389 aa  265  7e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  39.04 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  38.77 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  38.67 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  38.77 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  38.77 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  38.77 
 
 		 389 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  39.52 
 
 		 395 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  42.55 
 
 		 379 aa  263  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  38.77 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  38.77 
 
 		 389 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  42.55 
 
 		 379 aa  262  6.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6011  alanine racemase  44.44 
 
 		 380 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0222771  normal  0.167789 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  39.79 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  41.38 
 
 		 421 aa  259  4e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0990  alanine racemase  41.76 
 
 		 397 aa  259  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.876046  hitchhiker  0.00306709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0622  alanine racemase  42.55 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  39.3 
 
 		 369 aa  252  7e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  39.52 
 
 		 395 aa  252  9.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  39.95 
 
 		 376 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  41.46 
 
 		 376 aa  250  4e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  41.82 
 
 		 381 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  36.17 
 
 		 374 aa  243  3e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  37.53 
 
 		 375 aa  243  3.9999999999999997e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  38.16 
 
 		 387 aa  242  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  39.37 
 
 		 384 aa  240  2.9999999999999997e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0355  alanine racemase  40.43 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.488923  normal  0.111882 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  39.04 
 
 		 382 aa  236  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1141  Alanine racemase  40.7 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0759856  normal  0.485235 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  33.52 
 
 		 369 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  41.6 
 
 		 375 aa  233  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6556  alanine racemase  40.93 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3857  alanine racemase  40.16 
 
 		 372 aa  232  9e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.859951  normal  0.532248 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1635  alanine racemase region  37.67 
 
 		 366 aa  231  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>