More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0133 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0133  domain of unknown function DUF1731  100 
 
 
316 aa  644    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1459  domain of unknown function DUF1731  49.68 
 
 
318 aa  263  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.812014 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0435  hypothetical protein  45.57 
 
 
308 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3001  hypothetical protein  43.38 
 
 
317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1261  domain of unknown function DUF1731  40.25 
 
 
302 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179162  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4516  domain of unknown function DUF1731  38.68 
 
 
307 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0231327 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4780  hypothetical protein  38.44 
 
 
306 aa  205  8e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5571  hypothetical protein  40.26 
 
 
464 aa  205  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2477  hypothetical protein  41.64 
 
 
298 aa  203  3e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.775796  hitchhiker  0.0000277687 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0429  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  34.81 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0518  cell division inhibitor-like protein  34.49 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.87387  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0496  cell division inhibitor-like protein  34.81 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1739  domain of unknown function DUF1731  39.25 
 
 
306 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.599325  normal  0.399114 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0570  cell division inhibitor-like protein  35.13 
 
 
301 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0571  cell division inhibitor-like protein  34.81 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0486  cell division inhibitor-like protein  34.81 
 
 
301 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0515  cell division inhibitor-like protein  34.81 
 
 
301 aa  199  5e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2579  hypothetical protein  38.73 
 
 
297 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.173891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2491  hypothetical protein  38.41 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.133788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0087  hypothetical protein  38.92 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0091  domain of unknown function DUF1731  36.59 
 
 
313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2591  hypothetical protein  38.41 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2537  hypothetical protein  38.41 
 
 
297 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.158224  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0425  epimerase, NAD dependent epimerase family protein  34.18 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0496  hypothetical protein  40.44 
 
 
300 aa  197  3e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0126  domain of unknown function DUF1731  38.61 
 
 
312 aa  196  4.0000000000000005e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0187314  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0432  hypothetical protein  34.92 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2675  hypothetical protein  37.54 
 
 
313 aa  196  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.422838  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0724  hypothetical protein  40.32 
 
 
297 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00362096  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2118  hypothetical protein  39.05 
 
 
310 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1751  hypothetical protein  37.66 
 
 
311 aa  195  9e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.888541  normal  0.757585 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2700  hypothetical protein  38.1 
 
 
297 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.473742  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0103  domain of unknown function DUF1731  38.61 
 
 
312 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0206  hypothetical protein  36.56 
 
 
306 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.886073  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26261  putative cell division inhibitor  40.62 
 
 
313 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.566516 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3322  hypothetical protein  39.05 
 
 
304 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00834384  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3948  hypothetical protein  34.58 
 
 
307 aa  192  8e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750895  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1333  domain of unknown function DUF1731  36.83 
 
 
305 aa  192  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0459  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40 
 
 
321 aa  191  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4805  cell division inhibitor-like protein  34.18 
 
 
301 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383251  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2454  NAD-binding domain-containing protein  37.78 
 
 
297 aa  189  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000318682  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0004  hypothetical protein  36.71 
 
 
313 aa  189  5e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02229  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  37.78 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.210862  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1352  domain of unknown function DUF1731  37.78 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0231042  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1348  hypothetical protein  37.78 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.303624  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02189  hypothetical protein  37.78 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.257838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3444  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.3 
 
 
297 aa  189  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0131327  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2598  NAD-binding domain-containing protein  37.46 
 
 
297 aa  189  7e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00110077  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3578  domain of unknown function DUF1731  35.31 
 
 
307 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2683  hypothetical protein  37.85 
 
 
297 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.126988  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2535  domain of unknown function DUF1731  35.31 
 
 
307 aa  188  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.18148 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2780  hypothetical protein  37.85 
 
 
297 aa  188  9e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.346145  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2460  NAD-binding domain-containing protein  37.62 
 
 
297 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.040859  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2704  hypothetical protein  38.17 
 
 
297 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.148152  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0202  hypothetical protein  38.66 
 
 
499 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.532052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1683  domain of unknown function DUF1731  37.85 
 
 
297 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0603665  normal  0.0256156 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.34 
 
 
304 aa  187  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14574  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2680  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.14 
 
 
297 aa  186  4e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0182151  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0084  domain of unknown function DUF1731  36.65 
 
 
313 aa  186  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2559  hypothetical protein  36.98 
 
 
299 aa  186  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2853  hypothetical protein  37.3 
 
 
297 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.257081 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1380  domain of unknown function DUF1731  38.92 
 
 
302 aa  186  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.189159  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2564  domain of unknown function DUF1731  37.78 
 
 
301 aa  185  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0342272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2922  hypothetical protein  39.43 
 
 
296 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2362  hypothetical protein  36.51 
 
 
297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0532  domain of unknown function DUF1731  38.73 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1488  hypothetical protein  39.37 
 
 
295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.246079  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1467  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.55 
 
 
297 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1483  hypothetical protein  39.69 
 
 
296 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274067  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1542  hypothetical protein  39.69 
 
 
296 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.582377  normal  0.132975 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0064  hypothetical protein  32.8 
 
 
303 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4820  hypothetical protein  37.5 
 
 
499 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.153477  normal  0.681323 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5412  hypothetical protein  37.5 
 
 
499 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5449  hypothetical protein  37.5 
 
 
499 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.792139 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0330  hypothetical protein  37.5 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0349  hypothetical protein  37.54 
 
 
302 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000136273  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1542  hypothetical protein  37.54 
 
 
302 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.450686  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01351  putative cell division inhibitor  35.28 
 
 
310 aa  179  4e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.366171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1432  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  37.54 
 
 
302 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000441102  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1325  domain of unknown function DUF1731  34.38 
 
 
302 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.492061  normal  0.369891 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01371  putative cell division inhibitor  34.47 
 
 
308 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0269314  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2388  hypothetical protein  37.11 
 
 
297 aa  178  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.926114  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1548  hypothetical protein  39.38 
 
 
296 aa  177  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.07586  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01381  putative cell division inhibitor  34.16 
 
 
308 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.384424  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3066  hypothetical protein  36.59 
 
 
462 aa  176  5e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000836111  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3719  domain of unknown function DUF1731  34.5 
 
 
304 aa  176  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0123  putative cell division inhibitor  33.85 
 
 
308 aa  176  6e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01341  putative cell division inhibitor  33.54 
 
 
310 aa  175  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.174061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2895  hypothetical protein  35.01 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.804761  hitchhiker  0.000214273 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3849  hypothetical protein  38.66 
 
 
489 aa  174  9.999999999999999e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.622933 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3614  sugar nucleotide epimerase  32.26 
 
 
300 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4896  hypothetical protein  38.34 
 
 
478 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.66 
 
 
501 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2494  domain of unknown function DUF1731  39.37 
 
 
288 aa  172  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000945208  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2243  hypothetical protein  36.71 
 
 
309 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.0000861994  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2400  hypothetical protein  36.34 
 
 
309 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0470445  normal  0.720429 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2786  domain of unknown function DUF1731  36.83 
 
 
301 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00697723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3700  hypothetical protein  38.73 
 
 
299 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01921  putative cell division inhibitor  33.94 
 
 
309 aa  170  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38921  predicted protein  36.45 
 
 
373 aa  169  4e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.0770912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>