More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0099 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2871  aconitate hydratase domain protein  56.73 
 
 		 753 aa  853    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0798  hypothetical protein  56.73 
 
 		 761 aa  852    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0978109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1133  hypothetical protein  62.73 
 
 		 783 aa  943    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000753668  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0794  hypothetical protein  56.75 
 
 		 753 aa  851    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2458  hypothetical protein  58.25 
 
 		 763 aa  884    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0160078  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0875  hypothetical protein  56.68 
 
 		 753 aa  847    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2891  hypothetical protein  56.73 
 
 		 753 aa  853    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0493763 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21050  hypothetical protein  59.27 
 
 		 781 aa  920    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0825  hypothetical protein  56.73 
 
 		 761 aa  851    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.125653  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0099  hypothetical protein  100 
 
 		 768 aa  1573    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3383  aconitate hydratase  29.7 
 
 		 657 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1803  aconitate hydratase  30.01 
 
 		 657 aa  234  5e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1336  aconitate hydratase  29.74 
 
 		 656 aa  233  7.000000000000001e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0524  aconitate hydratase  27.82 
 
 		 643 aa  233  9e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000206753  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0416  aconitate hydratase  28.8 
 
 		 639 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0098  aconitate hydratase  29.18 
 
 		 661 aa  224  4e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0285  aconitate hydratase  28.32 
 
 		 646 aa  221  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0606  aconitate hydratase  26.68 
 
 		 655 aa  217  5.9999999999999996e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3767  aconitate hydratase  28.13 
 
 		 640 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0585  aconitate hydratase  30.79 
 
 		 645 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.674704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0423  aconitate hydratase  30.79 
 
 		 645 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.82263  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1930  aconitate hydratase  29.19 
 
 		 642 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221002  normal  0.0834672 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1406  aconitate hydratase  29.22 
 
 		 643 aa  213  7e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258962  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3021  aconitate hydratase  30.12 
 
 		 641 aa  211  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0908  aconitate hydratase  28.39 
 
 		 668 aa  209  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.410888  normal  0.460369 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0597  aconitate hydratase  29.46 
 
 		 658 aa  209  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.977117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3158  aconitate hydratase  28.44 
 
 		 642 aa  209  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107146  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2176  aconitate hydratase  28.86 
 
 		 642 aa  208  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0828952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1882  aconitate hydratase  30 
 
 		 641 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.111034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1771  aconitate hydratase  29.09 
 
 		 641 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2258  aconitate hydratase  26.99 
 
 		 648 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1966  aconitate hydratase  27.64 
 
 		 648 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2445  aconitate hydratase  27.42 
 
 		 645 aa  198  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.430041  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1102  aconitate hydratase  26.98 
 
 		 642 aa  198  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3193  aconitate hydratase  29.18 
 
 		 640 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.249489  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4177  aconitate hydratase  28.71 
 
 		 647 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13774  normal  0.304204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1265  aconitate hydratase  27.32 
 
 		 644 aa  196  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2763  aconitate hydratase  27.07 
 
 		 648 aa  196  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0020  aconitate hydratase  28.61 
 
 		 644 aa  195  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2153  aconitate hydratase  27.3 
 
 		 644 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2106  aconitate hydratase  27.57 
 
 		 645 aa  189  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.12781  normal  0.0131142 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1612  aconitate hydratase  27.38 
 
 		 646 aa  188  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2450  aconitate hydratase  28.29 
 
 		 644 aa  187  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3640  aconitate hydratase  28.45 
 
 		 656 aa  187  7e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.506746  normal  0.0138117 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2824  aconitate hydratase  27.06 
 
 		 660 aa  183  9.000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2707  aconitate hydratase  27.26 
 
 		 660 aa  182  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23930  aconitate hydratase  28.35 
 
 		 649 aa  181  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.161871  normal  0.0821905 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5705  aconitate hydratase  26.79 
 
 		 659 aa  174  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.762683  hitchhiker  0.0051974 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05770  aconitate hydratase  27.36 
 
 		 647 aa  169  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.295611  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4768  aconitate hydratase  28.22 
 
 		 674 aa  168  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.682164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2774  aconitate hydratase  26.25 
 
 		 661 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4932  aconitate hydratase  29 
 
 		 652 aa  164  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.450299  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05300  aconitate hydratase, putative (Eurofung)  24.26 
 
 		 798 aa  130  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.29403  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05525  Aconitase Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J267]  27.16 
 
 		 783 aa  129  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.842678 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1482  aconitate hydratase  24.23 
 
 		 754 aa  129  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03894  aconitate hydratase, mitochondrial, putative (Eurofung)  25.99 
 
 		 796 aa  126  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.26439  normal  0.611037 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85181  Aconitase, mitochondrial  26.11 
 
 		 780 aa  126  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.154992  normal  0.331758 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01590  aconitate hydratase, putative  25.88 
 
 		 770 aa  125  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02620  aconitase, putative  26.37 
 
 		 792 aa  124  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1100  3-isopropylmalate dehydratase  29.77 
 
 		 418 aa  122  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2016  aconitate hydratase  26.29 
 
 		 757 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00964954 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1704  homoaconitate hydratase family protein  27.87 
 
 		 419 aa  119  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0634  3-isopropylmalate dehydratase  28.43 
 
 		 403 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0544933  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1466  homoaconitate hydratase family protein  27.4 
 
 		 429 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0167474  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0660  aconitate hydratase  27.63 
 
 		 758 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1408  aconitate hydratase  27.29 
 
 		 755 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0971  aconitate hydratase  24.65 
 
 		 760 aa  116  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0402  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  28.05 
 
 		 418 aa  116  2.0000000000000002e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.344506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2025  aconitate hydratase  27.13 
 
 		 755 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00945  aconitate hydratase  27.76 
 
 		 755 aa  115  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.181334  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1630  3-isopropylmalate dehydratase  25.88 
 
 		 418 aa  114  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1208  aconitate hydratase  23.84 
 
 		 756 aa  114  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.2348  normal  0.0471939 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0646  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  26.54 
 
 		 418 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00455068  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0621  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  26.54 
 
 		 418 aa  114  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0188797  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1952  aconitate hydratase  26.33 
 
 		 765 aa  112  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2702  aconitate hydratase  25.35 
 
 		 751 aa  112  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3516  3-isopropylmalate dehydratase  28.31 
 
 		 410 aa  112  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1458  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.6 
 
 		 419 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.888399  normal  0.260054 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0383  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  28.53 
 
 		 417 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0126  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  27.48 
 
 		 419 aa  111  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0596  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  27.9 
 
 		 420 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000659262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2254  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  26.82 
 
 		 421 aa  109  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2159  3-isopropylmalate dehydratase  27.32 
 
 		 398 aa  109  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.219475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3159  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  27.95 
 
 		 431 aa  108  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000477252  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0366  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  28.21 
 
 		 417 aa  108  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1588  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  25.98 
 
 		 419 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0448  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  27.79 
 
 		 417 aa  108  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2194  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  26.09 
 
 		 421 aa  108  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.454447  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0233  hypothetical protein  28.57 
 
 		 417 aa  107  8e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3219  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  27.13 
 
 		 418 aa  107  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0227  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  28.75 
 
 		 421 aa  107  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0390  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  29.77 
 
 		 419 aa  106  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2101  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  26.43 
 
 		 429 aa  106  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0493977  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_390  aconitase/homoaconitase/3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  27.51 
 
 		 417 aa  105  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0788  3-isopropylmalate dehydratase  28.7 
 
 		 382 aa  105  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10870  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  27.24 
 
 		 420 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0195  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  25.69 
 
 		 421 aa  105  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3356  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  27.71 
 
 		 421 aa  105  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM01770  aconitate hydratase, putative  24.95 
 
 		 787 aa  105  4e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00912812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1742  3-isopropylmalate dehydratase large subunit  27 
 
 		 420 aa  105  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.482523  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>