56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0097 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0097  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
822 aa  1648  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0424  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  52.94 
 
 
429 aa  330  5e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1470  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  53.56 
 
 
432 aa  330  7e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3013  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  49.34 
 
 
442 aa  297  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2461  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.71 
 
 
304 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0181605 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3104  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.66 
 
 
409 aa  164  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2318  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.05 
 
 
437 aa  100  8e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537187  hitchhiker  0.0010338 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0917  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.01 
 
 
431 aa  98.6  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0498  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.08 
 
 
404 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  4.10538e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1347  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.98 
 
 
414 aa  90.5  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2204  hypothetical protein  29.89 
 
 
466 aa  86.3  2e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1379  hypothetical protein  28.69 
 
 
321 aa  82.8  3e-14  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000144326  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3005  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  31.67 
 
 
415 aa  82  4e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0915  hypothetical protein  28.63 
 
 
325 aa  80.5  1e-13  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  3.55062e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0985  hypothetical protein  28.63 
 
 
325 aa  80.5  1e-13  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0906  hypothetical protein  28.63 
 
 
325 aa  80.5  1e-13  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000558879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4441  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.68 
 
 
374 aa  80.1  1e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1135  hypothetical protein  31.14 
 
 
323 aa  78.2  6e-13  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1582  putative periplasmic protein  26.42 
 
 
322 aa  75.1  5e-12  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1752  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.33 
 
 
375 aa  74.7  6e-12  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1883  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  25.55 
 
 
413 aa  74.3  8e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.04 
 
 
642 aa  73.6  1e-11  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2084  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.44 
 
 
499 aa  73.9  1e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0824261 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0370  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.11 
 
 
365 aa  69.3  3e-10  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3606  signal recognition particle-docking protein FtsY  41.43 
 
 
561 aa  62.4  3e-08  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00455766  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0873  60 kDa chaperonin (protein Cpn60; groEL protein)  34.62 
 
 
321 aa  60.1  2e-07  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0922  putative periplasmic protein  28.99 
 
 
321 aa  58.2  6e-07  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  1.7161e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3980  signal recognition particle-docking protein FtsY  44.09 
 
 
643 aa  57.8  8e-07  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00176908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3278  hypothetical protein  46.7 
 
 
966 aa  55.8  3e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0289  signal recognition particle-docking protein FtsY  45.61 
 
 
482 aa  54.7  7e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  6.44129e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0840  hypothetical protein  28.65 
 
 
187 aa  53.1  2e-05  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0623  signal recognition particle-docking protein FtsY  40 
 
 
453 aa  52.4  3e-05  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3227  hypothetical protein  40.97 
 
 
996 aa  50.4  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.640032  normal  0.507723 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2210  hypothetical protein  31.14 
 
 
171 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.40768 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2287  hypothetical protein  31.14 
 
 
171 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.147762  normal  0.376498 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0389  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.21 
 
 
241 aa  50.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0582  protein of unknown function DUF949  32.65 
 
 
244 aa  48.9  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.380158  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3004  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 
625 aa  49.3  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2420  hypothetical protein  30.54 
 
 
186 aa  48.9  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2183  hypothetical protein  30.59 
 
 
171 aa  47.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2113  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  28.57 
 
 
165 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.89 
 
 
188 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.110296  normal  0.290144 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1556  hypothetical protein  31.03 
 
 
171 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2528  hypothetical protein  29.89 
 
 
188 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2521  hypothetical protein  29.89 
 
 
188 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2641  hypothetical protein  31.02 
 
 
188 aa  47.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.749921  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0275  signal recognition particle-docking protein FtsY  38.84 
 
 
587 aa  47.4  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.125713  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.03 
 
 
194 aa  47  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4586  cell division protein FtsY  40.97 
 
 
510 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000854  hypothetical protein  29.75 
 
 
153 aa  47  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2376  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.64 
 
 
181 aa  46.6  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0581  conserved repeat domain protein  39.04 
 
 
880 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2159  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.37 
 
 
337 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2767  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.96 
 
 
179 aa  46.2  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0972774  normal  0.277101 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0926  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.64 
 
 
249 aa  45.4  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.7057  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1035  colicin/pyosin nuclease family protein  39.86 
 
 
459 aa  44.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>