More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0096 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0096  orotate phosphoribosyltransferase  100 
 
 
193 aa  390  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0425  orotate phosphoribosyltransferase  75.14 
 
 
186 aa  298  4e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1469  orotate phosphoribosyltransferase  72.43 
 
 
186 aa  287  7e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.980339 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3012  orotate phosphoribosyltransferase  69.19 
 
 
186 aa  271  4e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.678971  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3103  orotate phosphoribosyltransferase  60.22 
 
 
187 aa  227  6e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2463  orotate phosphoribosyltransferase  62.16 
 
 
188 aa  218  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0081584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1637  orotate phosphoribosyltransferase  48.35 
 
 
182 aa  193  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2069  orotate phosphoribosyltransferase  48.35 
 
 
182 aa  187  6e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1938  orotate phosphoribosyltransferase  47.8 
 
 
182 aa  186  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1154  orotate phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
182 aa  184  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2703  orotate phosphoribosyltransferase  45.86 
 
 
183 aa  182  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1892  orotate phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
182 aa  177  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2328  orotate phosphoribosyltransferase  46.15 
 
 
182 aa  177  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1456  orotate phosphoribosyltransferase  45.9 
 
 
183 aa  169  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  3.51938e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1121  orotate phosphoribosyltransferase  42.33 
 
 
203 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5105  orotate phosphoribosyltransferase  48.81 
 
 
193 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.077972  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3708  orotate phosphoribosyltransferase  49.71 
 
 
190 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.684552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1325  orotate phosphoribosyltransferase  41.85 
 
 
185 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3634  orotate phosphoribosyltransferase  49.42 
 
 
189 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.274017  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3568  orotate phosphoribosyltransferase  48.84 
 
 
189 aa  152  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0180203  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0460  orotate phosphoribosyltransferase  44.21 
 
 
204 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.249088  normal  0.2022 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2462  orotate phosphoribosyltransferase  41.24 
 
 
208 aa  150  9e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03551  orotate phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
193 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1641  orotate phosphoribosyltransferase  45.51 
 
 
215 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2358  orotate phosphoribosyltransferase  42.37 
 
 
206 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0140374  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0231  orotate phosphoribosyltransferase  43.98 
 
 
190 aa  143  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2592  orotate phosphoribosyltransferase  46.39 
 
 
202 aa  143  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.989423 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0442  orotate phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 
184 aa  142  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.297345  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0277  orotate phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
186 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02991  orotate phosphoribosyltransferase  43.02 
 
 
186 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.734545  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3689  orotate phosphoribosyltransferase  42.27 
 
 
212 aa  140  1e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.477212  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1651  orotate phosphoribosyltransferase  44.44 
 
 
208 aa  140  1e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.394829  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2541  orotate phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
201 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.536465  normal  0.0846935 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3572  orotate phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
201 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2766  orotate phosphoribosyltransferase  41.53 
 
 
191 aa  138  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02981  orotate phosphoribosyltransferase  41.86 
 
 
186 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  41.44 
 
 
194 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  4.52779e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0260  orotate phosphoribosyltransferase  43.09 
 
 
194 aa  135  3e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1305  orotate phosphoribosyltransferase  46.67 
 
 
187 aa  135  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03081  orotate phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
192 aa  128  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.691934  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0955  orotate phosphoribosyltransferase  39.55 
 
 
187 aa  127  8e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0451  orotate phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 
213 aa  126  2e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5205  orotate phosphoribosyltransferase  40.11 
 
 
187 aa  126  2e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0847  orotate phosphoribosyltransferase  39.55 
 
 
187 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24961  orotate phosphoribosyltransferase  43.17 
 
 
196 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4858  orotate phosphoribosyltransferase  38.98 
 
 
187 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2110  orotate phosphoribosyltransferase  43.39 
 
 
189 aa  122  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.254535 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7360  orotate phosphoribosyltransferase  37.85 
 
 
185 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0006  orotate phosphoribosyltransferase  38.37 
 
 
198 aa  117  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.292815  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10387  orotate phosphoribosyltransferase  38.73 
 
 
179 aa  114  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.32666e-16  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0153  orotate phosphoribosyltransferase  35.71 
 
 
187 aa  114  1e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0503  orotate phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 
187 aa  112  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  37.99 
 
 
177 aa  111  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  38.67 
 
 
188 aa  110  1e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3515  orotate phosphoribosyltransferase  37.72 
 
 
187 aa  110  1e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.066849  normal  0.969303 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  40.24 
 
 
192 aa  109  2e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3177  orotate phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 
184 aa  109  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1170  orotate phosphoribosyltransferase  38.04 
 
 
166 aa  109  3e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 
178 aa  108  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4186  orotate phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 
191 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 
194 aa  107  7e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1176  orotate phosphoribosyltransferase  36.76 
 
 
195 aa  108  7e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1455  orotate phosphoribosyltransferase  42.14 
 
 
185 aa  107  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  38.55 
 
 
194 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  38.55 
 
 
195 aa  105  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0736  orotate phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 
185 aa  104  8e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.555923 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1052  orotate phosphoribosyltransferase  38.65 
 
 
182 aa  104  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25780  orotate phosphoribosyltransferase  34.41 
 
 
199 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  35.2 
 
 
178 aa  103  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  36.31 
 
 
177 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0085  orotate phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 
185 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1182  orotate phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 
185 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.382161  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0561  orotate phosphoribosyltransferase  36.36 
 
 
179 aa  100  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.643948  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  36.11 
 
 
191 aa  100  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05620  orotate phosphoribosyltransferase  37.65 
 
 
185 aa  99.8  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0920693  normal  0.821582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  35.93 
 
 
178 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38490  orotate phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 
189 aa  95.9  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  36.65 
 
 
174 aa  95.1  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4069  orotate phosphoribosyltransferase  39.74 
 
 
191 aa  94.7  7e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.269841  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0849  orotate phosphoribosyltransferase  37.28 
 
 
186 aa  94  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.198231  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0584  orotate phosphoribosyltransferase  35.68 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.306687 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2302  orotate phosphoribosyltransferase  38.04 
 
 
178 aa  93.2  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.875367  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8390  orotate phosphoribosyltransferase  37.11 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.353067 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6936  orotate phosphoribosyltransferase  37.2 
 
 
184 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.824462  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3147  orotate phosphoribosyltransferase  35.45 
 
 
192 aa  90.9  9e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4786  orotate phosphoribosyltransferase  38.64 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288171  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0801  orotate phosphoribosyltransferase  34.92 
 
 
185 aa  89  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0130  orotate phosphoribosyltransferase  35.14 
 
 
179 aa  87  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  2.51206e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0125  orotate phosphoribosyltransferase  34.46 
 
 
179 aa  87  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6071  orotate phosphoribosyltransferase  37.06 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1693  orotate phosphoribosyltransferase  33.71 
 
 
192 aa  84.7  7e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.165076  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0559  orotate phosphoribosyltransferase  38.95 
 
 
178 aa  84.7  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1784  orotate phosphoribosyltransferase  36.26 
 
 
215 aa  84.7  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.474409  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0565  orotate phosphoribosyltransferase  34.29 
 
 
181 aa  84.7  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00922313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0750  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
180 aa  82  5e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0317  orotate phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
169 aa  81.6  7e-15  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2123  orotate phosphoribosyltransferase  37.3 
 
 
196 aa  81.3  9e-15  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1001  orotate phosphoribosyltransferase  37.14 
 
 
170 aa  81.3  9e-15  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.106165  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1965  orotate phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
191 aa  80.5  1e-14  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35310  orotate phosphoribosyltransferase  34.81 
 
 
197 aa  80.5  1e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.238269  normal  0.306388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>