164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0094 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0094  regulatory protein, FmdB family  100 
 
 
113 aa  223  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1467  regulatory protein, FmdB family  54.67 
 
 
138 aa  93.2  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0427  FmdB family regulatory protein  45.83 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.953461  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3010  hypothetical protein  53.62 
 
 
97 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.794189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2465  regulatory protein, FmdB family  54.05 
 
 
106 aa  82.4  2e-15  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0532528  hitchhiker  0.00128388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3101  regulatory protein, FmdB family  50 
 
 
83 aa  79.3  2e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0034  type I antifreeze protein  41.41 
 
 
99 aa  72.8  2e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.080792  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1168  FmdB family regulatory protein  51.61 
 
 
82 aa  67.8  5e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  2.32466e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2229  FmdB family regulatory protein  50.72 
 
 
113 aa  65.1  3e-10  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1163  hypothetical protein  38.54 
 
 
83 aa  64.3  6e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.62411e-16  hitchhiker  0.00947496 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2539  hypothetical protein  44.19 
 
 
85 aa  63.9  7e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.36204e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2625  regulatory protein, FmdB family  41.56 
 
 
75 aa  63.5  8e-10  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.874466  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1843  hypothetical protein  41.03 
 
 
85 aa  62.4  2e-09  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00987876  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0548  FmdB family regulatory protein  39.53 
 
 
88 aa  62  2e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.45953e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1142  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 
95 aa  61.2  5e-09  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0863  hypothetical protein  39.58 
 
 
83 aa  60.1  1e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.574225  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0229  FmdB family regulatory protein  46.27 
 
 
99 aa  59.3  2e-08  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0509  regulatory protein, FmdB family  48.28 
 
 
73 aa  59.3  2e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  2.4131e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0912  hypothetical protein  44 
 
 
78 aa  58.5  3e-08  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.32009e-16  decreased coverage  8.81745e-08 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  42.39 
 
 
94 aa  58.5  3e-08  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1432  hypothetical protein  44.07 
 
 
104 aa  58.2  4e-08  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1552  hypothetical protein  44.07 
 
 
104 aa  58.2  4e-08  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0601  type I antifreeze protein  36.63 
 
 
97 aa  57.8  5e-08  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2303  regulatory protein, FmdB family  49.15 
 
 
109 aa  57.8  6e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0327558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4588  regulatory protein, FmdB family  46.55 
 
 
120 aa  57.4  6e-08  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.691856  normal  0.396421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2391  regulatory protein, FmdB family  49.15 
 
 
109 aa  57.8  6e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.873408  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0301  hypothetical protein  39.08 
 
 
108 aa  57.4  7e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.298186  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1561  hypothetical protein  47.46 
 
 
104 aa  56.6  1e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.266221  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  37.62 
 
 
92 aa  55.1  3e-07  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36740  regulatory protein, FmdB family  45.76 
 
 
88 aa  54.7  4e-07  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2782  FmdB family regulatory protein  45.76 
 
 
63 aa  53.5  8e-07  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155022  normal  0.0575706 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1172  regulatory protein, FmdB family  38.46 
 
 
87 aa  52.4  2e-06  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.884251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0219  regulatory protein, FmdB family  44.07 
 
 
91 aa  52.4  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530805  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0196  hypothetical protein  44.07 
 
 
91 aa  52.4  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0838449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0902  regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 
111 aa  52.8  2e-06  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.269923  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0208  regulatory protein, FmdB family  44.07 
 
 
91 aa  52.4  2e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1324  FmdB family regulatory protein  44.07 
 
 
114 aa  52.8  2e-06  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811436 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5267  regulatory protein, FmdB family  27.62 
 
 
118 aa  52.8  2e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.471797 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3821  FmdB family regulatory protein  35.23 
 
 
89 aa  52.8  2e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268528  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01549  putative regulatory protein, FmdB family  41.41 
 
 
97 aa  51.6  3e-06  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2036  hypothetical protein  42.19 
 
 
95 aa  52  3e-06  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  4.59423e-05  normal  0.717478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0213  FmdB family regulatory protein  36.63 
 
 
98 aa  51.6  4e-06  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.119501 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2386  hypothetical protein  40.68 
 
 
83 aa  50.8  5e-06  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.954945  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0864  hypothetical protein  42.62 
 
 
121 aa  50.8  6e-06  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1114  regulatory protein, FmdB family  39.34 
 
 
74 aa  50.8  6e-06  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00330778  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0626  regulatory protein, FmdB family  40.35 
 
 
101 aa  50.8  6e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1068  hypothetical protein  42.37 
 
 
128 aa  50.4  7e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.36361 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1038  FmdB family regulatory protein  41.38 
 
 
90 aa  50.4  8e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  6.17496e-07  unclonable  8.27491e-06 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0428  hypothetical protein  44.07 
 
 
91 aa  50.1  1e-05  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.575896  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1745  FmdB family regulatory protein  44.07 
 
 
91 aa  50.1  1e-05  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.195874  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2798  regulatory protein, FmdB family  44.26 
 
 
88 aa  50.1  1e-05  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.821801  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0872  FmdB family regulatory protein  39.06 
 
 
105 aa  49.7  1e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.616078  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0464  hypothetical protein  37.97 
 
 
112 aa  49.7  1e-05  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0379  FmdB family regulatory protein  36.59 
 
 
114 aa  49.7  1e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42078 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4645  regulatory protein, FmdB family  36.84 
 
 
119 aa  49.3  2e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0686  FmdB family regulatory protein  38.6 
 
 
128 aa  49.3  2e-05  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0437  hypothetical protein  40.98 
 
 
157 aa  48.9  2e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0787  FmdB family regulatory protein  36.84 
 
 
93 aa  49.3  2e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1241  FmdB family regulatory protein  40.68 
 
 
73 aa  48.9  2e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292209  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0354  regulatory protein, FmdB family  42.37 
 
 
113 aa  48.9  2e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379758  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4011  FmdB family regulatory protein  44.07 
 
 
108 aa  49.3  2e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.61768e-06 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0673  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  48.9  2e-05  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.295597  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5455  FmdB family regulatory protein  40.68 
 
 
105 aa  48.5  3e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1212  hypothetical protein  40.68 
 
 
73 aa  48.1  3e-05  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4206  FmdB family regulatory protein  40.68 
 
 
73 aa  48.5  3e-05  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.384212  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4003  FmdB family regulatory protein  38.81 
 
 
73 aa  48.9  3e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2404  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  48.9  3e-05  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0850  regulatory protein  38.46 
 
 
113 aa  48.9  3e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172615  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2324  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  48.9  3e-05  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2754  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  48.9  3e-05  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.82151  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0339  regulatory protein, FmdB family  42.37 
 
 
113 aa  48.9  3e-05  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0689  hypothetical protein  38.46 
 
 
113 aa  48.9  3e-05  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.471349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3106  FmdB family regulatory protein  36.84 
 
 
108 aa  48.1  4e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000220195  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0785  FmdB family regulatory protein  38.98 
 
 
120 aa  48.1  4e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03040  putative regulatory protein, FmdB family  42.11 
 
 
71 aa  47.8  5e-05  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0801  regulatory protein, FmdB family  40.32 
 
 
90 aa  47.8  5e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13090  putative regulatory protein, FmdB family  36.21 
 
 
113 aa  47.8  5e-05  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0657763  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0204  regulatory protein, FmdB family  41.67 
 
 
81 aa  47.8  5e-05  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0297929 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0440  hypothetical protein  38.37 
 
 
86 aa  47.8  5e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3639  FmdB family regulatory protein  40.68 
 
 
105 aa  47.8  5e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0742  FmdB family regulatory protein  35.09 
 
 
132 aa  47.8  5e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.105899  normal  0.441026 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2923  regulatory protein, FmdB family  38.81 
 
 
108 aa  47.4  6e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0376  hypothetical protein  34.57 
 
 
109 aa  47.4  6e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.271939 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0654  regulatory protein, FmdB family  34.41 
 
 
125 aa  47.4  6e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257627  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0558  hypothetical protein  36.96 
 
 
112 aa  47.4  7e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0834  regulatory protein, FmdB family  36.84 
 
 
117 aa  47.4  7e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166433  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2482  FmdB family regulatory protein  47.73 
 
 
65 aa  47.4  7e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416517  normal  0.0908176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4378  FmdB family regulatory protein  35.09 
 
 
110 aa  47  8e-05  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.530419  normal  0.589955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4292  FmdB transcriptional regulator  35.09 
 
 
110 aa  47  8e-05  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0195  regulatory protein, FmdB family  40.98 
 
 
81 aa  47  8e-05  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1295  hypothetical protein  38.98 
 
 
113 aa  47  9e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.30554  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6054  hypothetical protein  35.8 
 
 
115 aa  47  9e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4045  hypothetical protein  35.63 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.859174  normal  0.576471 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  36.56 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  36.56 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2392  regulatory protein, FmdB family  43.33 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1411  regulatory protein, FmdB family  33.33 
 
 
126 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4124  regulatory protein, FmdB family  41.18 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4670  FmdB family regulatory protein  35.09 
 
 
113 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0329006  normal  0.590525 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3694  putative regulatory protein, FmdB family  36.84 
 
 
118 aa  46.2  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  5.06128e-05  normal  0.846133 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>