More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0091 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0091  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  100 
 
 
259 aa  521  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.813637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2304  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  77.61 
 
 
259 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2694  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  76.45 
 
 
259 aa  404  1e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.617775 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3480  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  75.29 
 
 
259 aa  401  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1084  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  75.29 
 
 
259 aa  391  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.345161  normal  0.0584875 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0331  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  73.36 
 
 
259 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.695233  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0483  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  67.57 
 
 
259 aa  359  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0518313 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0783  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  64.48 
 
 
259 aa  345  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1622  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  60.47 
 
 
252 aa  305  6e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0317  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  60.31 
 
 
252 aa  301  8e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0814  imidazoleglycerol phosphate synthase, cyclase subunit  54.3 
 
 
252 aa  295  4e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2350  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  57.2 
 
 
252 aa  291  9e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00543573  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0254  imidazole glycerol phosphate synthase subunit hisF  55.86 
 
 
252 aa  289  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.172742  normal  0.0120893 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02240  imidazole glycerol phosphate synthase subunit hisF  56.81 
 
 
252 aa  289  3e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2753  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.91 
 
 
257 aa  287  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3379  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.09 
 
 
252 aa  287  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2286  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  55.64 
 
 
256 aa  286  3e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.596744  normal  0.0465393 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0516  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  56.25 
 
 
257 aa  286  3e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3054  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.12 
 
 
257 aa  285  4e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.929486  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0757  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  55.25 
 
 
252 aa  285  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3156  imidazole glycerol phosphate synthase subunit hisF  54.65 
 
 
258 aa  285  6e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  9.66301e-05 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4915  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  55.29 
 
 
256 aa  283  1e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3170  imidazoleglycerol phosphate synthase, cyclase subunit  56.08 
 
 
257 aa  283  2e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2068  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.85 
 
 
260 aa  283  3e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0318  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.9 
 
 
256 aa  283  3e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0490  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.69 
 
 
257 aa  282  3e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0327  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.51 
 
 
256 aa  282  4e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.397197 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0313  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.9 
 
 
256 aa  281  7e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.500455  normal  0.0126582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0293  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.9 
 
 
256 aa  281  7e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.842581  hitchhiker  0.000194447 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0158  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  55 
 
 
263 aa  281  9e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67880  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.9 
 
 
256 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.212449 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1708  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.92 
 
 
251 aa  281  1e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2775  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  55.64 
 
 
258 aa  280  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0404  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.34 
 
 
257 aa  280  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.937871 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1969  imidazoleglycerol phosphate synthase, cyclase subunit  53.12 
 
 
257 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.500643  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4893  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.9 
 
 
256 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0645  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  50.94 
 
 
268 aa  278  4e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00927658  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2829  imidazoleglycerol phosphate synthase, cyclase subunit  53.88 
 
 
261 aa  278  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5875  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.51 
 
 
256 aa  278  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3223  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.53 
 
 
258 aa  278  4e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2876  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.53 
 
 
258 aa  278  4e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.0177631 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1569  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.7 
 
 
252 aa  278  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2391  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.08 
 
 
260 aa  278  5e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.857465 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3529  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.12 
 
 
257 aa  278  5e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.622379  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5334  imidazoleglycerol phosphate synthase, cyclase subunit  54.9 
 
 
256 aa  278  5e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0112  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  51.55 
 
 
252 aa  278  7e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.203199  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2483  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  55.25 
 
 
258 aa  278  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0185597 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0431  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.73 
 
 
257 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.611276  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0410  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.73 
 
 
257 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0435225 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0358  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.73 
 
 
257 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.509366 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2676  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.73 
 
 
257 aa  277  1e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0349  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.73 
 
 
257 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2802  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.91 
 
 
254 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2552  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.86 
 
 
258 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4252  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.51 
 
 
256 aa  277  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3554  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  51.95 
 
 
257 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0958166  hitchhiker  0.000231442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2987  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.52 
 
 
257 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2888  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.09 
 
 
253 aa  276  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0111  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  51.94 
 
 
252 aa  276  3e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.580692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4053  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.53 
 
 
253 aa  275  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.543687  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0216  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.47 
 
 
256 aa  275  4e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0949  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  50 
 
 
272 aa  275  5e-73  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2031  imidazole glycerol phosphate synthase subunit hisF  52.92 
 
 
252 aa  275  6e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1530  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.7 
 
 
252 aa  275  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1573  imidazoleglycerol phosphate synthase, cyclase subunit  54.47 
 
 
263 aa  274  8e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0836  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.31 
 
 
253 aa  275  8e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.742885  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3660  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.52 
 
 
262 aa  274  1e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3687  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.52 
 
 
257 aa  274  1e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3718  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.52 
 
 
262 aa  274  1e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3095  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.53 
 
 
253 aa  273  2e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0334  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.73 
 
 
257 aa  273  2e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.135616  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1024  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  48.9 
 
 
272 aa  273  3e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1794  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.12 
 
 
262 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1332  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.92 
 
 
252 aa  273  3e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.828357  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2708  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.12 
 
 
257 aa  273  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3245  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.12 
 
 
262 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2759  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.12 
 
 
262 aa  272  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2946  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  51.36 
 
 
256 aa  272  4e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0471  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  56.03 
 
 
267 aa  272  4e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.482626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0128  imidazoleglycerol phosphate synthase, cyclase subunit  53.52 
 
 
263 aa  272  4e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1295  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.31 
 
 
252 aa  272  5e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0751  imidazoleglycerol phosphate synthase, cyclase subunit  53.52 
 
 
257 aa  272  5e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.330645  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1133  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.14 
 
 
252 aa  271  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1592  imidazoleglycerol phosphate synthase, cyclase subunit  52.31 
 
 
259 aa  271  7e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155094 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2041  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  54.47 
 
 
253 aa  271  8e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0389  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.53 
 
 
253 aa  271  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0997  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  48.9 
 
 
272 aa  271  9e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.752012  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1032  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.14 
 
 
252 aa  271  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1684  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  48.9 
 
 
272 aa  271  1e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1006  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  51.75 
 
 
253 aa  270  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2576  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.49 
 
 
253 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  hitchhiker  1.66233e-06 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3881  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.53 
 
 
252 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04630  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  53.33 
 
 
256 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3055  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.14 
 
 
253 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.487755  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2614  imidazole glycerol phosphate synthase subunit hisF  53.7 
 
 
265 aa  270  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.176341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3152  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  52.73 
 
 
252 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3795  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  51.75 
 
 
252 aa  270  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3242  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  50.97 
 
 
256 aa  269  3e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2951  imidazoleglycerol phosphate synthase, cyclase subunit  50.38 
 
 
266 aa  269  3e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.205264  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3105  imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF  50.97 
 
 
256 aa  269  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.209513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>