95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0089 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0089  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
317 aa  634    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2091  protein of unknown function DUF81  54.57 
 
 
305 aa  287  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.796449  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2200  hypothetical protein  55.87 
 
 
343 aa  281  9e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2812  protein of unknown function DUF81  54.35 
 
 
317 aa  281  1e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2891  hypothetical protein  53.04 
 
 
299 aa  279  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0197559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0309  hypothetical protein  49.85 
 
 
319 aa  269  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0424  hypothetical protein  43.93 
 
 
323 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000598243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0392  protein of unknown function DUF81  46.44 
 
 
320 aa  229  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000026561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0981  protein of unknown function DUF81  42.9 
 
 
322 aa  222  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00042255  normal  0.0386618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2926  protein of unknown function DUF81  29.15 
 
 
318 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1264  hypothetical protein  26.65 
 
 
317 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.194519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3156  protein of unknown function DUF81  25.47 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0555  protein of unknown function DUF81  26.43 
 
 
408 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.589078 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  26.49 
 
 
343 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  24.92 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  25.41 
 
 
307 aa  66.2  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0598  hypothetical protein  23.02 
 
 
404 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  24.76 
 
 
308 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  25.25 
 
 
307 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2192  protein of unknown function DUF81  23.1 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  23.59 
 
 
320 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1654  protein of unknown function DUF81  23.78 
 
 
416 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2726  hypothetical protein  22.49 
 
 
381 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.792978  normal  0.146494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  24.61 
 
 
305 aa  62.8  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  24.72 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5209  hypothetical protein  34.59 
 
 
275 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  24.52 
 
 
296 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  21.89 
 
 
306 aa  56.6  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2440  protein of unknown function DUF81  26.47 
 
 
567 aa  56.6  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  22.4 
 
 
306 aa  56.2  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  23.81 
 
 
315 aa  55.8  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  24.29 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  21.43 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  21.89 
 
 
306 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0683  protein of unknown function DUF81  24.45 
 
 
413 aa  53.9  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  34.23 
 
 
119 aa  53.5  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  32.54 
 
 
246 aa  53.1  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  25.4 
 
 
312 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  22.76 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  23.32 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  24.13 
 
 
304 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1378  hypothetical protein  32.43 
 
 
121 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3289  permeases-like  28.57 
 
 
439 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  22.12 
 
 
307 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  22.41 
 
 
309 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  22.44 
 
 
306 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  23.05 
 
 
308 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  25.24 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2123  hypothetical protein  34.51 
 
 
261 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.575182  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  27.03 
 
 
261 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  27.7 
 
 
261 aa  47  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 
302 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  25.53 
 
 
139 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2230  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 
257 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0553  protein of unknown function DUF81  31.09 
 
 
250 aa  46.2  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  27.82 
 
 
255 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  28.57 
 
 
260 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  23.42 
 
 
303 aa  45.8  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  30.7 
 
 
246 aa  46.2  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  24.82 
 
 
266 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  26.4 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  28.93 
 
 
259 aa  45.8  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  26.4 
 
 
262 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2817  hypothetical protein  27.97 
 
 
257 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  31.13 
 
 
250 aa  45.4  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  26.4 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  26.28 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  26.4 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.4 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1215  permease  30.25 
 
 
123 aa  45.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  26.4 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  28 
 
 
266 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  26.35 
 
 
261 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  28.32 
 
 
255 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  27.5 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1137  hypothetical protein  30.97 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0347  hypothetical protein  31.67 
 
 
247 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0306416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  26.32 
 
 
286 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  27.56 
 
 
255 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  21.71 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  30.48 
 
 
271 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01140  predicted permease  31.3 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  25.93 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  28 
 
 
261 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2426  hypothetical protein  29.37 
 
 
253 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  29.91 
 
 
2798 aa  43.5  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1722  hypothetical protein  34.43 
 
 
261 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1725  protein of unknown function DUF81  24.63 
 
 
242 aa  43.1  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5534  protein of unknown function DUF81  32.53 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.511417 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  28.97 
 
 
354 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  21.54 
 
 
307 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0348  hypothetical protein  25.35 
 
 
242 aa  43.1  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.01487  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  25.42 
 
 
275 aa  42.7  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  21.93 
 
 
316 aa  42.4  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  31.82 
 
 
254 aa  42.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>