More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0083 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0083  Hpt sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
874 aa  1765  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146368  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2335  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
831 aa  395  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00162679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1492  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 
1029 aa  338  4e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2430  histidine kinase  34.78 
 
 
629 aa  226  1e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.73405  normal  0.136698 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1009  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.14 
 
 
655 aa  212  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.55 
 
 
1305 aa  205  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.89 
 
 
1436 aa  204  8e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 
1287 aa  202  2e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
1260 aa  201  4e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
1255 aa  201  4e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2151  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 
963 aa  201  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.614764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 
962 aa  199  2e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  30.3 
 
 
1177 aa  197  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0738  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 
925 aa  196  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 
1195 aa  196  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
816 aa  193  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2324  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 
1162 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 
790 aa  191  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.9 
 
 
745 aa  191  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  28.44 
 
 
1021 aa  191  6e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3079  composite two component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  33.93 
 
 
994 aa  188  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0449118  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  26.85 
 
 
932 aa  187  9e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2176  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 
1007 aa  186  1e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3358  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 
1436 aa  185  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.504651  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  28.8 
 
 
1122 aa  184  7e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3238  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.41 
 
 
918 aa  184  7e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.943664  normal  0.0194611 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.67 
 
 
927 aa  183  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3040  histidine kinase  30.94 
 
 
1053 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0526469  normal  0.364658 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0813  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.05 
 
 
922 aa  182  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325502  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
1499 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0736  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 
1074 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
631 aa  182  3e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
947 aa  182  3e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2483  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
1071 aa  180  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  30.6 
 
 
914 aa  179  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.89 
 
 
932 aa  179  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3038  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 
936 aa  179  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0749319  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 
1002 aa  179  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3895  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
920 aa  178  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.750763  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0358  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
1485 aa  178  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 
1064 aa  178  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.4 
 
 
1127 aa  178  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.46 
 
 
1442 aa  177  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.82 
 
 
937 aa  177  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0718  sensory box histidine kinase/response regulator  29.55 
 
 
589 aa  177  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.97168  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 
782 aa  177  1e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 
827 aa  177  1e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.74 
 
 
863 aa  176  2e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1497  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 
880 aa  176  2e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 
1313 aa  176  2e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0915  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 
822 aa  176  2e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59780  putative kinase sensor protein  32.18 
 
 
1084 aa  175  3e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  3.0188e-05  hitchhiker  3.75506e-17 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0507  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.15 
 
 
1045 aa  175  4e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3017  RcsC  30.08 
 
 
1083 aa  175  4e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
1075 aa  174  5e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.77 
 
 
1369 aa  174  9e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5346  PAS  29.81 
 
 
1060 aa  173  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 
657 aa  173  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 
1055 aa  173  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0790  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.01 
 
 
906 aa  173  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.437862  normal  0.397369 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
915 aa  173  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.08 
 
 
1310 aa  172  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07851  hybrid sensory kinase  27.62 
 
 
730 aa  172  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1040  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  29.64 
 
 
934 aa  172  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.301921  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.74 
 
 
1069 aa  172  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2930  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.02 
 
 
918 aa  171  4e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577629  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02593  hypothetical protein  36.02 
 
 
918 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0926  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.02 
 
 
918 aa  171  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0352487  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02631  hybrid sensory histidine kinase, in two-component regulatory system with UvrY  36.02 
 
 
918 aa  171  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.228632  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3087  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.02 
 
 
918 aa  171  4e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000144797  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0902  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
918 aa  171  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.594186  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2924  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.02 
 
 
918 aa  171  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301465  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4046  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.02 
 
 
918 aa  171  4e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0239535  normal  0.782421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3090  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.02 
 
 
918 aa  171  4e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000398111  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.86 
 
 
990 aa  171  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4255  PAS/PAC sensor, hybrid histidine kinase  30.1 
 
 
1418 aa  171  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377123  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0847  hybrid sensory histidine kinase BarA  25.43 
 
 
918 aa  171  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0185431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00069  two component sensor-regulator hybrid protein RpfC  28.5 
 
 
718 aa  171  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.397596  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3117  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.12 
 
 
918 aa  170  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.306406  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3180  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.12 
 
 
918 aa  170  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.359202 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3164  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.12 
 
 
918 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0703153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3099  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.12 
 
 
918 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.528607  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 
780 aa  170  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01579  Response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like protein  28.85 
 
 
891 aa  170  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2241  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
956 aa  170  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87793  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3278  hybrid sensory histidine kinase BarA  36.12 
 
 
918 aa  170  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.225719 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 
1303 aa  169  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0141  two-component system sensor protein  27.48 
 
 
952 aa  169  3e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0666  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 
1400 aa  169  3e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.982341 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1346  PAS sensor protein  30.79 
 
 
803 aa  168  3e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  42.21 
 
 
661 aa  168  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0401  sensor histidine kinase/response regulator  31.39 
 
 
1392 aa  168  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1285  hybrid sensory histidine kinase BarA  26.21 
 
 
937 aa  168  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  2.42189e-10 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 
1193 aa  168  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
1101 aa  168  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.95 
 
 
1964 aa  168  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.370442 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15460  membrane sensor hybrid histidine protein kinase  30.5 
 
 
772 aa  167  6e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.361903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2986  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.31 
 
 
1228 aa  167  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.387618 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2644  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
1303 aa  167  1e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.229306  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3332  sensor histidine kinase/response regulator  40.75 
 
 
819 aa  167  1e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>