98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0081 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0081  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  100 
 
 
527 aa  1115  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.304883  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2385  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  62.45 
 
 
524 aa  659  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1490  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  68.99 
 
 
529 aa  751  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2333  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  68.79 
 
 
524 aa  730  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2097  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  61.93 
 
 
520 aa  646  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1374  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  53.04 
 
 
536 aa  499  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.661481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4234  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  39.69 
 
 
434 aa  306  4e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3631  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  37.25 
 
 
480 aa  272  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.40973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1521  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  33.98 
 
 
416 aa  249  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0701  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  35.87 
 
 
427 aa  243  6e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1101  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  31.35 
 
 
488 aa  218  3e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1892  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  33.72 
 
 
469 aa  217  3e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  6.6915e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1820  cytochrome c552  31.57 
 
 
498 aa  215  2e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0972  cytochrome c552  31.95 
 
 
466 aa  208  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0685  cytochrome c552  31.29 
 
 
467 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  1.62376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0831  cytochrome c552  30.72 
 
 
467 aa  204  3e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.01441  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0658  cytochrome c552  30.39 
 
 
473 aa  204  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.034848  normal  0.165673 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0648  cytochrome c552  31.6 
 
 
467 aa  203  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0169797  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3980  cytochrome c552  30.49 
 
 
467 aa  202  1e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0964  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  31.73 
 
 
515 aa  201  2e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142807  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0622  cytochrome c552  31.63 
 
 
463 aa  201  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  1.37875e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3834  cytochrome c552  30.61 
 
 
467 aa  200  4e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  6.34429e-07  normal  0.0322806 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3363  cytochrome c552  29.98 
 
 
473 aa  201  4e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.328864  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0659  cytochrome c552  29.98 
 
 
473 aa  201  4e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000892238  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3711  cytochrome c552  30.61 
 
 
467 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.31094e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0963  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  31.89 
 
 
490 aa  199  1e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3652  cytochrome c552  30.41 
 
 
467 aa  199  1e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00563536  hitchhiker  4.68517e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0794  cytochrome c552  30.41 
 
 
467 aa  199  1e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00711776  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0960  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  31.89 
 
 
490 aa  199  1e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.230878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0910  respiratory nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming) precursor  31.66 
 
 
490 aa  198  2e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0844  cytochrome c552  30.26 
 
 
466 aa  198  2e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000415815  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2432  cytochrome c552  32.33 
 
 
477 aa  198  2e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0931  cytochrome c552  30.89 
 
 
466 aa  198  2e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  1.09321e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2812  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  33.58 
 
 
466 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003114  cytochrome c552 precursor  30.38 
 
 
475 aa  196  8e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0955  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  31.97 
 
 
489 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02727  cytochrome c552  31.28 
 
 
469 aa  194  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1024  cytochrome c nitrite reductase, catalytic subunit NrfA  31.52 
 
 
605 aa  194  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.140418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2735  cytochrome c552  32.25 
 
 
472 aa  192  8e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5575  cytochrome c552  30.99 
 
 
478 aa  193  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3922  formate-dependent cytochrome c nitrite reductase, c552 subunit  30.99 
 
 
478 aa  191  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03902  hypothetical protein  30.99 
 
 
478 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3957  cytochrome c552  30.99 
 
 
478 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03942  nitrite reductase, formate-dependent, cytochrome  30.99 
 
 
478 aa  191  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4532  cytochrome c552  30.99 
 
 
478 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4626  cytochrome c552  30.99 
 
 
478 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4591  cytochrome c552  30.99 
 
 
478 aa  191  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4315  cytochrome c552  30.55 
 
 
478 aa  191  3e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0211  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  30.29 
 
 
483 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.24038e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0707  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  32.24 
 
 
515 aa  190  6e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  2.10974e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1980  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  29.33 
 
 
476 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.439301 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4671  cytochrome c552  30.86 
 
 
478 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4529  cytochrome c552  30.86 
 
 
478 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.895576 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4620  cytochrome c552  30.86 
 
 
478 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal  0.388303 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4622  cytochrome c552  30.86 
 
 
478 aa  187  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1997  cytochrome c552  31.85 
 
 
478 aa  187  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4536  cytochrome c552  30.86 
 
 
478 aa  187  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.490866  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2866  cytochrome c nitrite reductase  29.69 
 
 
478 aa  186  1e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3705  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  29.35 
 
 
513 aa  183  8e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0341  cytochrome c552  28.52 
 
 
610 aa  182  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0605023  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1244  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  29.08 
 
 
607 aa  180  4e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0296  respiratory nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming) precursor  31.08 
 
 
485 aa  180  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.71973e-09  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2398  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  28.85 
 
 
496 aa  179  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0529  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  31.98 
 
 
401 aa  177  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1359  cytochrome c552  30 
 
 
610 aa  177  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0294  respiratory nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming) precursor  30.81 
 
 
488 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.31436e-06  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1546  cytochrome c552  30 
 
 
610 aa  177  5e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.421407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3154  cytochrome c nitrite reductase, catalytic subunit NrfA, putative  30 
 
 
490 aa  176  1e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4608  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  28.63 
 
 
492 aa  176  1e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0665  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  30.81 
 
 
484 aa  174  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00225794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2929  cytochrome c552  31.18 
 
 
483 aa  172  9e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2070  cytochrome c552  32.2 
 
 
492 aa  172  1e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3092  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  26.2 
 
 
557 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2150  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  30.88 
 
 
492 aa  170  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1296  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  30.68 
 
 
483 aa  169  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.57773e-15 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2987  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  25.59 
 
 
557 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.1283  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2902  respiratory nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming) precursor  25.41 
 
 
556 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0151335  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0129  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  27.29 
 
 
557 aa  167  5e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1042  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  26.1 
 
 
482 aa  164  5e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0722076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0688  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  27.7 
 
 
464 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1200  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  30.25 
 
 
487 aa  159  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.849928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1228  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  26.04 
 
 
469 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0609624  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3036  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  26.04 
 
 
469 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.306753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3653  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  29.95 
 
 
517 aa  149  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0505  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  25.67 
 
 
452 aa  148  2e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2586  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  28.69 
 
 
445 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00414644  normal  0.0377964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3604  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  24.01 
 
 
469 aa  139  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.357303  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3744  nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  28.44 
 
 
573 aa  138  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0357  cytochrome c family protein  29.91 
 
 
533 aa  136  1e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.412865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1061  cytochrome c family protein  28.1 
 
 
541 aa  135  1e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.409799  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2363  cytochrome c552  25.42 
 
 
477 aa  135  2e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.78461e-07  hitchhiker  0.000909202 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4004  formate-dependent nitrite reductase periplasmic cytochrome c552 subunit-like protein  28.54 
 
 
536 aa  129  9e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00066664  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2999  cytochrome c family protein  27.1 
 
 
534 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0002503  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1277  Nitrite reductase (cytochrome; ammonia-forming)  27.85 
 
 
538 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2946  cytochrome c family protein  27.72 
 
 
538 aa  124  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13420  formate-dependent nitrite reductase, periplasmic cytochrome c552 subunit  25.45 
 
 
476 aa  120  8e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08100  formate-dependent nitrite reductase, periplasmic cytochrome c552 subunit  25.28 
 
 
485 aa  119  2e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  hitchhiker  7.73325e-08 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00460  hypothetical protein  22.11 
 
 
442 aa  64.7  4e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>