More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0079 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0079  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
181 aa  374  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2797  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  58.56 
 
 
182 aa  202  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.51636  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1444  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  53.76 
 
 
181 aa  179  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.534784  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48740  hypothetical protein  45.6 
 
 
185 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127911 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4174  hypothetical protein  44.62 
 
 
186 aa  153  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.469146  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2685  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.33 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2190  NADPH-dependent FMN reductase  41.11 
 
 
189 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2073  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  39.13 
 
 
192 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.614853  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4645  NADPH-dependent FMN reductase  38.59 
 
 
220 aa  129  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.218505  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1159  NADPH-dependent FMN reductase  39.66 
 
 
189 aa  123  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.310294  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0735  flavoprotein  34.41 
 
 
189 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0947  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  40.85 
 
 
180 aa  122  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.787165  normal  0.0766584 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4789  NADPH-dependent FMN reductase  37.93 
 
 
180 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.165976  normal  0.0635371 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0023  NADPH-dependent FMN reductase  34.92 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.335563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4181  hypothetical protein  34.78 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4059  YieF  34.78 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.553888  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4238  hypothetical protein  34.78 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0673986  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4131  hypothetical protein  34.78 
 
 
188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7021  NADPH-dependent FMN reductase  35.84 
 
 
184 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0223037  hitchhiker  0.00000135463 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4074  YieF  34.78 
 
 
188 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.996766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4144  NADPH-dependent FMN reductase  34.57 
 
 
188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5170  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000106598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4547  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000635846  normal  0.888906 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5689  NADPH-dependent FMN reductase  36 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000053398  decreased coverage  0.000226287 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4031  NADPH-dependent FMN reductase  38.12 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4143  NADPH-dependent FMN reductase  38.12 
 
 
184 aa  114  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269863  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03597  chromate reductase, Class I, flavoprotein  34.24 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4254  NADPH-dependent FMN reductase  34.24 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5144  NADPH-dependent FMN reductase  34.24 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0905647 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4281  NADPH-dependent FMN reductase  34.24 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4222  NADPH-dependent FMN reductase  34.24 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03541  hypothetical protein  34.24 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4209  NADPH-dependent FMN reductase  34.24 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4080  NADPH-dependent FMN reductase  34.24 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.952282 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3927  NADPH-dependent FMN reductase  34.24 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3166  NADPH-dependent FMN reductase  35.23 
 
 
183 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000892563  normal  0.961569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3192  NADPH-dependent FMN reductase  38.67 
 
 
183 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.271184  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4146  NADPH-dependent FMN reductase  32.95 
 
 
183 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0009  NADPH-dependent FMN reductase  35.43 
 
 
184 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000508373  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0004  hypothetical protein  34.68 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000785497  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4960  NADPH-dependent FMN reductase  34.86 
 
 
184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000000098219  normal  0.0174202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0038  NADPH-dependent FMN reductase  39.56 
 
 
193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5513  NADPH-dependent FMN reductase  34.29 
 
 
184 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000000482376  normal  0.178166 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1480  NADPH-dependent FMN reductase  50.39 
 
 
179 aa  108  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.109308 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7777  putative NADPH-dependent FMN reductase  35.26 
 
 
182 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0234688  normal  0.192756 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2367  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
185 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000285806  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5357  NADPH-dependent FMN reductase  38.89 
 
 
185 aa  107  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3170  NADPH-dependent FMN reductase  34.66 
 
 
185 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.000548947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4595  NADPH-dependent FMN reductase  36.46 
 
 
182 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.970822  normal  0.947838 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2110  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.68 
 
 
185 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  unclonable  0.00000000601888  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1497  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.66 
 
 
185 aa  105  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.000000000255815  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1138  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.68 
 
 
185 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000288055  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2404  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.68 
 
 
185 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000721457  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1418  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.68 
 
 
185 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000169295  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03046  hypothetical protein  36.07 
 
 
184 aa  105  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443536  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2403  NADPH-dependent FMN reductase  36.57 
 
 
185 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.420707  normal  0.039915 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3283  NADPH-dependent FMN reductase domain-containing protein  34.68 
 
 
185 aa  104  6e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000258349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2505  NADPH-dependent FMN reductase  35.2 
 
 
186 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2349  NADPH-dependent FMN reductase  39.24 
 
 
186 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1114  NADPH-dependent FMN reductase  31.03 
 
 
184 aa  101  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2966  NADPH-dependent FMN reductase  36.67 
 
 
185 aa  101  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.267455  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3796  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 
185 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0636316  normal  0.371173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1574  NADPH-dependent FMN reductase  34.1 
 
 
184 aa  99.4  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1677  NADPH-dependent FMN reductase  37.25 
 
 
180 aa  99.4  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0263  NADPH-dependent FMN reductase  31.14 
 
 
202 aa  99  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.478273  normal  0.331111 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1820  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
185 aa  98.6  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.229066  normal  0.662003 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04797  NADPH-dependent fmn reductase  37.74 
 
 
184 aa  98.6  5e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0156  NADPH-dependent FMN reductase  33.72 
 
 
188 aa  98.6  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0262  NADPH-dependent FMN reductase  33.54 
 
 
403 aa  98.2  6e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.33413  normal  0.3753 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1747  NADPH-dependent FMN reductase  33.52 
 
 
185 aa  97.8  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3069  NADPH-dependent FMN reductase  37.71 
 
 
185 aa  97.1  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255478  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2487  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
185 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.36944 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4056  NADPH-dependent FMN reductase  33.72 
 
 
184 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1180  NADPH-dependent FMN reductase  34.62 
 
 
183 aa  95.5  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3495  NADPH-dependent FMN reductase  35.36 
 
 
183 aa  95.1  5e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2540  NADPH-dependent FMN reductase  34.07 
 
 
184 aa  94.4  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0212443  normal  0.0814771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2371  NADPH-dependent FMN reductase  32.22 
 
 
183 aa  93.6  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.74887  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3367  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0879  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
184 aa  93.6  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000234882 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2773  NADPH-dependent FMN reductase  32.2 
 
 
185 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1466  NADPH-dependent FMN reductase  34.25 
 
 
183 aa  93.2  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2192  NADPH-dependent FMN reductase  31.67 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2368  NADPH-dependent FMN reductase  33.7 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2021  NADPH-dependent FMN reductase  33.92 
 
 
186 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.09968 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4569  NADPH-dependent FMN reductase  37.5 
 
 
186 aa  92.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.561148  normal  0.29894 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1516  NADPH-dependent FMN reductase  35.22 
 
 
183 aa  92  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2341  NADPH-dependent FMN reductase  35.22 
 
 
183 aa  92  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.189805  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1082  hypothetical protein  32.08 
 
 
200 aa  91.7  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.137626  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  29.82 
 
 
187 aa  91.3  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5720  NADPH-dependent FMN reductase  40.31 
 
 
197 aa  90.1  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1539  NADPH-dependent FMN reductase  32.04 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.740647  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1083  hypothetical protein  33.33 
 
 
411 aa  89  4e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0200825  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1473  NADPH-dependent FMN reductase  36.2 
 
 
187 aa  88.2  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0876  flavoprotein  32.18 
 
 
180 aa  88.2  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000003424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1767  NADPH-dependent FMN reductase  32.37 
 
 
189 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2638  NADPH-dependent FMN reductase  34.34 
 
 
186 aa  88.2  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.334684 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0875  flavoprotein  31.85 
 
 
185 aa  88.2  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0295346  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0090  NADPH-dependent FMN reductase  29.03 
 
 
203 aa  87.8  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000795412  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5184  NADPH-dependent FMN reductase  30.64 
 
 
190 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  0.194966 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1727  NADPH-dependent FMN reductase  31.85 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.267087  normal  0.569907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>