More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0077 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.38 
 
 
972 aa  764  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.18 
 
 
962 aa  802  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  60.98 
 
 
986 aa  960  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
1086 aa  2205  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.65 
 
 
1198 aa  1272  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.35 
 
 
973 aa  645  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.18 
 
 
959 aa  804  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.06 
 
 
1053 aa  1291  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  38.74 
 
 
912 aa  560  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_840  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  37.91 
 
 
764 aa  529  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0967  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.78 
 
 
764 aa  528  1e-148  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.131419  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0858  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.41 
 
 
764 aa  527  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00289553  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0511  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.37 
 
 
739 aa  511  1e-143  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.814841  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.02 
 
 
762 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5571  Protein of unknown function DUF1998  39.37 
 
 
761 aa  501  1e-140  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0313  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.85 
 
 
815 aa  495  1e-138  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0278  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.22 
 
 
773 aa  496  1e-138  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.235091  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.14 
 
 
941 aa  491  1e-137  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4301  DEAD/DEAH box helicase-like  40.4 
 
 
804 aa  483  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1162  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.51 
 
 
764 aa  476  1e-133  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2730  DEAD/DEAH box helicase-like  35.43 
 
 
751 aa  474  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0601  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.25 
 
 
848 aa  472  1e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.502776  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26090  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  39.64 
 
 
833 aa  466  1e-130  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00586248  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3367  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.89 
 
 
804 aa  469  1e-130  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3881  Protein of unknown function DUF1998  37.4 
 
 
795 aa  468  1e-130  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.911773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0518  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.39 
 
 
763 aa  468  1e-130  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2984  helicase superfamily protein  35.49 
 
 
862 aa  468  1e-130  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000404432  hitchhiker  0.00167683 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0370  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.71 
 
 
778 aa  467  1e-130  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0213184  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0283  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.95 
 
 
807 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.926162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35840  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  38.48 
 
 
798 aa  465  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0109244  normal  0.0530492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2253  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.5 
 
 
753 aa  465  1e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.295208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.08 
 
 
758 aa  462  1e-128  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  37.14 
 
 
797 aa  459  1e-127  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.14 
 
 
751 aa  456  1e-127  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.06515e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0493  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.3 
 
 
815 aa  459  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4829  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.9 
 
 
807 aa  453  1e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.83 
 
 
752 aa  456  1e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3155  Helicase superfamily 1 and 2 ATP-binding  36.75 
 
 
795 aa  456  1e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.36643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.05 
 
 
868 aa  455  1e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  9.44502e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18140  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  36.87 
 
 
865 aa  446  1e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.15 
 
 
764 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1732  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.22 
 
 
768 aa  444  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.199645  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0572  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.88 
 
 
775 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0735  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.09 
 
 
790 aa  434  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773858  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.26 
 
 
781 aa  434  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036578  normal  0.532638 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0432  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.46 
 
 
759 aa  434  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0673  NADPH-dependent FMN reductase  34.47 
 
 
738 aa  432  1e-119  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13678  helicase  38.74 
 
 
771 aa  431  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00132558  normal  0.157688 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0123  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.47 
 
 
761 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0336832  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.05 
 
 
790 aa  430  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2218  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.15 
 
 
861 aa  432  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.344745 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0482  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.84 
 
 
812 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.016003  hitchhiker  0.00542226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4414  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.22 
 
 
824 aa  429  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.25 
 
 
807 aa  426  1e-117  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.02 
 
 
806 aa  422  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2271  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.58 
 
 
789 aa  418  1e-115  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.7 
 
 
808 aa  414  1e-114  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25230  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  34.69 
 
 
780 aa  409  1e-112  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5185  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.99 
 
 
775 aa  409  1e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159348 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4799  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.83 
 
 
775 aa  409  1e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0625  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.78 
 
 
803 aa  407  1e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4885  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.83 
 
 
775 aa  409  1e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60576  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5399  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.51 
 
 
782 aa  405  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.265021  normal  0.178291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0733  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.57 
 
 
805 aa  398  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  33.01 
 
 
831 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.09 
 
 
829 aa  387  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3559  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.39 
 
 
896 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.450676  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40984  predicted protein  32.63 
 
 
815 aa  382  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.954801  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0330  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.88 
 
 
868 aa  376  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.879636  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.55 
 
 
803 aa  369  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.11055e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.51 
 
 
855 aa  357  9e-97  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.92 
 
 
685 aa  356  1e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.4 
 
 
744 aa  336  2e-90  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  30 
 
 
1210 aa  335  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.97 
 
 
744 aa  328  3e-88  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2771  Protein of unknown function DUF1998  36.53 
 
 
866 aa  315  3e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00683804  hitchhiker  2.5981e-05 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33220  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  35.06 
 
 
891 aa  310  7e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442514  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  30.18 
 
 
758 aa  309  2e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.13 
 
 
744 aa  307  6e-82  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  30.3 
 
 
931 aa  306  1e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0220  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.1 
 
 
902 aa  305  3e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1303  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.56 
 
 
756 aa  301  6e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  3.1195e-05  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2983  Protein of unknown function DUF1998  29.57 
 
 
948 aa  300  1e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4033  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.22 
 
 
802 aa  299  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.338213  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1650  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.25 
 
 
751 aa  292  2e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2258  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.73 
 
 
897 aa  287  7e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22294  normal  0.971461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  25.95 
 
 
905 aa  278  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1460  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.17 
 
 
766 aa  275  4e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.801207  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.08 
 
 
739 aa  270  1e-70  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62134  predicted protein  26.97 
 
 
1178 aa  247  7e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.85 
 
 
815 aa  237  8e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  7.20865e-12 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1976  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.58 
 
 
838 aa  224  5e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.09 
 
 
744 aa  215  3e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.22 
 
 
740 aa  214  9e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0060  DEAD/DEAH box helicase-like  23.94 
 
 
906 aa  207  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0763729  normal  0.477512 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5502  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.57 
 
 
914 aa  201  7e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.445906 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0390  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.88 
 
 
876 aa  193  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0312  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.24 
 
 
879 aa  175  3e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.52 
 
 
911 aa  176  3e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48177  predicted protein  24.85 
 
 
1321 aa  154  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>