145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0076 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0076  Dyp-type peroxidase family  100 
 
 
310 aa  640  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4860  Dyp-type peroxidase family protein  53.97 
 
 
323 aa  330  2e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.445339  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3258  Dyp-type peroxidase  53.09 
 
 
316 aa  329  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1591  Dyp-type peroxidase family  52.46 
 
 
346 aa  324  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3201  Dyp-type peroxidase family  51.97 
 
 
340 aa  322  7e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5572  Dyp-type peroxidase  50.81 
 
 
315 aa  320  2e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3310  Dyp-type peroxidase family  51.16 
 
 
360 aa  317  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0157694 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7089  Dyp-type peroxidase family protein  50 
 
 
359 aa  316  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.264761  normal  0.129458 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6414  Dyp-type peroxidase family protein  51.35 
 
 
349 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285799  normal  0.19542 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5665  Dyp-type peroxidase family protein  51.35 
 
 
356 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7001  Dyp-type peroxidase  50.33 
 
 
353 aa  314  1e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6426  Dyp-type peroxidase family protein  49.67 
 
 
359 aa  314  1e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353753  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1403  Dyp-type peroxidase  49.67 
 
 
359 aa  314  1e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5122  Dyp-type peroxidase family protein  53.31 
 
 
341 aa  314  1e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.963646  normal  0.469662 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0389  Dyp-type peroxidase  50.98 
 
 
307 aa  313  2e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.442459  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1627  Dyp-type peroxidase family protein  52.19 
 
 
344 aa  310  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567886  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5473  Dyp-type peroxidase family protein  49.03 
 
 
352 aa  307  1e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.308432  normal  0.0526287 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5414  Dyp-type peroxidase family protein  50 
 
 
353 aa  306  2e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.872456  normal  0.0333574 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3833  Dyp-type peroxidase  49.03 
 
 
354 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.718236  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10814  hypothetical protein  49.51 
 
 
335 aa  305  5e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0249  Dyp-type peroxidase family  49.68 
 
 
308 aa  302  4e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.755486  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6187  Dyp-type peroxidase family  48.38 
 
 
368 aa  301  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4014  Dyp-type peroxidase family protein  50.68 
 
 
340 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881992  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1400  Dyp-type peroxidase  47.71 
 
 
307 aa  286  3e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0748056  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4562  Dyp-type peroxidase family  45.75 
 
 
335 aa  286  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4595  Dyp-type peroxidase family  46.53 
 
 
356 aa  275  6e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264848  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1546  Dyp-type peroxidase family protein  44.52 
 
 
314 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0147  Dyp-type peroxidase family  44.66 
 
 
324 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.956863  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5715  Dyp-type peroxidase family  44.66 
 
 
322 aa  258  6e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.93633  normal  0.777307 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2444  Dyp-type peroxidase family protein  42.91 
 
 
298 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1043  Dyp-type peroxidase family protein  39.2 
 
 
313 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.620298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0864  Dyp-type peroxidase family protein  34.34 
 
 
314 aa  201  1e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.746492  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3689  Dyp-type peroxidase family protein  33.97 
 
 
311 aa  198  8e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0605  Dyp-type peroxidase family protein  33.97 
 
 
311 aa  198  8e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3813  Dyp-type peroxidase family protein  33.97 
 
 
311 aa  198  8e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3631  Dyp-type peroxidase family  34.68 
 
 
306 aa  197  2e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0670  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  35.62 
 
 
311 aa  196  4e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0610  Dyp-type peroxidase family protein  34.19 
 
 
313 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3343  Dyp-type peroxidase family protein  34.19 
 
 
313 aa  195  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3513  Dyp-type peroxidase family protein  33.87 
 
 
313 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0949  Dyp-type peroxidase family protein  34.47 
 
 
312 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0639  Dyp-type peroxidase family protein  34.59 
 
 
312 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.969415  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0847  Dyp-type peroxidase family protein  33.56 
 
 
311 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1000  Dyp-type peroxidase family protein  35.49 
 
 
311 aa  190  3e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.212693  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2894  Dyp-type peroxidase  33.33 
 
 
312 aa  187  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3223  Dyp-type peroxidase family protein  33.33 
 
 
311 aa  186  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0740  melanin biosynthesis protein TyrA, putative  33.23 
 
 
311 aa  185  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3458  Dyp-type peroxidase family protein  34.56 
 
 
299 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1399  Dyp-type peroxidase family protein  33.89 
 
 
299 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.55791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1292  Dyp-type peroxidase family protein  33.89 
 
 
299 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.465558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2777  hypothetical protein  33.56 
 
 
299 aa  174  1e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0764  Dyp-type peroxidase family  36.15 
 
 
299 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1730  Dyp-type peroxidase family protein  34.97 
 
 
308 aa  172  6e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104157  normal  0.0665076 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2360  putative Dyp-type peroxidase  38.37 
 
 
301 aa  169  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00056138  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4479  putative melanin biosynthesis protein TyrA  30.74 
 
 
309 aa  167  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0493  Dyp-type peroxidase family protein  31.21 
 
 
306 aa  167  3e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3278  Dyp-type peroxidase family  33.78 
 
 
299 aa  166  6e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000160029  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3200  Dyp-type peroxidase family  33.45 
 
 
299 aa  165  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.447852  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1001  Dyp-type peroxidase family  32.99 
 
 
299 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.153616  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03177  hypothetical protein  35.19 
 
 
300 aa  157  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1729  tyrA protein  33.56 
 
 
302 aa  155  6e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00482  putative melanin biosynthesis protein TyrA  28.62 
 
 
308 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002803  predicted iron-dependent peroxidase  32.73 
 
 
300 aa  147  2e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2568  dyp-type peroxidase family protein  33.22 
 
 
299 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2952  Dyp-type peroxidase family protein  34.34 
 
 
299 aa  145  8e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1230  Dyp-type peroxidase family  33.46 
 
 
299 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2717  dyp-type peroxidase family protein  33.22 
 
 
299 aa  144  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1248  Dyp-type peroxidase family protein  33.22 
 
 
299 aa  144  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.62141 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2803  dyp-type peroxidase family protein  33.22 
 
 
299 aa  144  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02331  hypothetical protein  33.22 
 
 
299 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2586  dyp-type peroxidase family protein  33.22 
 
 
299 aa  144  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02293  hypothetical protein  33.22 
 
 
299 aa  144  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3661  dyp-type peroxidase family protein  33.46 
 
 
299 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2812  Dyp-type peroxidase family protein  33.58 
 
 
299 aa  140  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2706  Dyp-type peroxidase family  33.58 
 
 
299 aa  140  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2682  Dyp-type peroxidase family  33.58 
 
 
299 aa  140  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2640  Dyp-type peroxidase family  33.58 
 
 
299 aa  140  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2591  dyp-type peroxidase family protein  33.58 
 
 
299 aa  140  2e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4299  Dyp-type peroxidase family  33.85 
 
 
300 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.193498  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0143  Dyp-type peroxidase  31.72 
 
 
300 aa  117  4e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.641407  hitchhiker  0.00262856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5441  Dyp-type peroxidase family protein  31.56 
 
 
301 aa  115  7e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2298  Dyp-type peroxidase  32.26 
 
 
293 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.427507  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4938  Dyp-type peroxidase family protein  31.45 
 
 
293 aa  105  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.769038 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3688  Dyp-type peroxidase family protein  30 
 
 
293 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.793167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3726  Dyp-type peroxidase family protein  31.2 
 
 
293 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.747974  normal  0.228519 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4565  Dyp-type peroxidase  31.2 
 
 
293 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3798  Dyp-type peroxidase family protein  31.2 
 
 
293 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.262927  normal  0.114512 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5524  Dyp-type peroxidase family protein  31.45 
 
 
293 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00060  Dyp-type peroxidase protein  28.12 
 
 
293 aa  100  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0235  dyp-type peroxidase family protein  30.93 
 
 
396 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0952  dyp-type peroxidase family protein  30.93 
 
 
414 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0271  dyp-type peroxidase family protein  30.93 
 
 
417 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1613  dyp-type peroxidase family protein  30.51 
 
 
293 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1418  dyp-type peroxidase family protein  30.51 
 
 
293 aa  99.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2663  dyp-type peroxidase family protein  30.51 
 
 
293 aa  99.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2522  dyp-type peroxidase family protein  30.51 
 
 
293 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0516  dyp-type peroxidase family protein  30.08 
 
 
485 aa  96.7  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0473  Dyp-type peroxidase  33.13 
 
 
307 aa  92.4  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28340  hypothetical protein  31.9 
 
 
299 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.569252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2468  hypothetical protein  30.95 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>