More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0074 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0074  agmatinase  100 
 
 
294 aa  598  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2513  putative agmatinase  57.8 
 
 
290 aa  329  4e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0574  agmatinase, putative  54.24 
 
 
299 aa  288  6e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3780  putative agmatinase  37.85 
 
 
303 aa  187  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.547694 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1414  agmatinase  37.45 
 
 
295 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  2.44509e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3564  putative agmatinase  37.2 
 
 
296 aa  180  3e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263603  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2696  agmatinase  36.48 
 
 
305 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1538  agmatinase  33.95 
 
 
289 aa  170  3e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.04187  unclonable  1.26381e-19 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0838  agmatinase  37.28 
 
 
293 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0733  agmatinase  36.73 
 
 
293 aa  169  4e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.983963  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4857  putative agmatinase  38.01 
 
 
300 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00520  arginase  35.32 
 
 
316 aa  166  3e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.960091  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0721  putative agmatinase  37.37 
 
 
307 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1609  agmatinase  35.54 
 
 
291 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0169673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.14 
 
 
341 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.704538  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3076  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.62 
 
 
367 aa  141  2e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.504729 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1264  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.33 
 
 
341 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1365  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.23 
 
 
341 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2261  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.99 
 
 
346 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1275  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.03 
 
 
343 aa  136  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1313  agmatinase  36.82 
 
 
293 aa  136  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501351  normal  0.021834 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  34.1 
 
 
293 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  32.17 
 
 
294 aa  131  1e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1151  hypothetical protein  31.15 
 
 
347 aa  128  9e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  32.95 
 
 
293 aa  126  4e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  32.13 
 
 
280 aa  126  5e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2044  agmatinase  28.94 
 
 
301 aa  125  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.661997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  29.59 
 
 
285 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  33.33 
 
 
293 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  37.36 
 
 
295 aa  123  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  31.46 
 
 
291 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  30.11 
 
 
289 aa  122  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  34.44 
 
 
291 aa  121  1e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  35.25 
 
 
288 aa  120  2e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  32.43 
 
 
304 aa  120  2e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  29.89 
 
 
297 aa  120  3e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  29.72 
 
 
290 aa  119  4e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  34.11 
 
 
285 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.00631e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  33.33 
 
 
287 aa  119  8e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0127  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.7 
 
 
346 aa  118  1e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  30.32 
 
 
283 aa  116  4e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  29.89 
 
 
299 aa  115  1e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  33.2 
 
 
290 aa  113  4e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  32.35 
 
 
296 aa  113  4e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  33.98 
 
 
290 aa  112  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  32.39 
 
 
289 aa  113  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  32.83 
 
 
290 aa  112  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  32.58 
 
 
290 aa  112  8e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  32.58 
 
 
290 aa  112  8e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  32.58 
 
 
290 aa  112  8e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  32.58 
 
 
290 aa  112  8e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  32.58 
 
 
290 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  32.58 
 
 
290 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  32.58 
 
 
290 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  32.58 
 
 
290 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  32.58 
 
 
290 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  28.57 
 
 
282 aa  111  2e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  29.07 
 
 
279 aa  110  2e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  31.01 
 
 
293 aa  110  4e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  3.52659e-06 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  31.71 
 
 
288 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  30.88 
 
 
287 aa  109  7e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  27.6 
 
 
282 aa  109  7e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  30.12 
 
 
285 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  30.12 
 
 
285 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  31.8 
 
 
284 aa  108  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  27.6 
 
 
282 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  32.67 
 
 
288 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  5.93846e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  31.07 
 
 
294 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5116  putative agmatinase  33.08 
 
 
322 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.971195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  34.43 
 
 
296 aa  105  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.39855e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  30.43 
 
 
299 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  32.59 
 
 
291 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2759  agmatinase  28.62 
 
 
333 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  35.27 
 
 
250 aa  100  2e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  32.17 
 
 
283 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2290  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.43 
 
 
312 aa  100  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  31.37 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  29.17 
 
 
327 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  31.1 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  29.43 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0292  arginase  27.56 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  31.18 
 
 
320 aa  96.7  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1230  arginase  27.65 
 
 
308 aa  96.7  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  30.99 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  28.46 
 
 
283 aa  95.9  6e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  29.69 
 
 
287 aa  96.3  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  29.79 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.39 
 
 
305 aa  95.1  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1578  agmatinase  27.74 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  30.69 
 
 
317 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0851  agmatinase  27.66 
 
 
378 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2278  agmatinase  31.82 
 
 
310 aa  93.2  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  2.67205e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  29.66 
 
 
322 aa  92.8  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0967  agmatinase  28.37 
 
 
354 aa  92.4  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2950  agmatinase  27.56 
 
 
324 aa  92  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00201595  hitchhiker  0.00051665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1009  agmatinase  30.5 
 
 
318 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0925  putative agmatinase  27.17 
 
 
291 aa  91.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  30.18 
 
 
321 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5122  agmatinase  26.96 
 
 
356 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.34 
 
 
311 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>