48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0073 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  100 
 
 
225 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  46.02 
 
 
1128 aa  138  5e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  2.45096e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  43.93 
 
 
189 aa  131  9e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  44.58 
 
 
195 aa  127  1e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  43.43 
 
 
192 aa  127  2e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  43.43 
 
 
195 aa  124  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  41.71 
 
 
187 aa  122  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  43.78 
 
 
243 aa  122  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  50 
 
 
194 aa  119  5e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  40.35 
 
 
200 aa  117  1e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  38.37 
 
 
195 aa  114  9e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  33.52 
 
 
188 aa  114  1e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  33.7 
 
 
209 aa  112  4e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  34.52 
 
 
190 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  37.36 
 
 
196 aa  112  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  33.14 
 
 
185 aa  109  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.02664e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  32.58 
 
 
196 aa  108  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  32.54 
 
 
190 aa  106  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  33.14 
 
 
190 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  43.23 
 
 
235 aa  106  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  33.14 
 
 
190 aa  106  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  33.14 
 
 
190 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  33.73 
 
 
190 aa  105  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  32.54 
 
 
190 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  32.54 
 
 
190 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  32.54 
 
 
190 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  32.54 
 
 
190 aa  104  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  33.14 
 
 
190 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  37.93 
 
 
193 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  38.95 
 
 
200 aa  103  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  30.64 
 
 
191 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  31.28 
 
 
194 aa  102  6e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  31.95 
 
 
190 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  27.75 
 
 
188 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  30.18 
 
 
183 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  33.14 
 
 
182 aa  99.8  3e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  32.67 
 
 
211 aa  97.8  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  30.18 
 
 
183 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  40.32 
 
 
232 aa  95.5  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  28.16 
 
 
188 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  29.65 
 
 
187 aa  92.8  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  38.67 
 
 
196 aa  85.9  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  38.85 
 
 
201 aa  85.5  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  29.55 
 
 
187 aa  83.2  3e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  29.55 
 
 
187 aa  83.2  3e-15  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  29.55 
 
 
181 aa  75.5  6e-13  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  33.13 
 
 
475 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  31.25 
 
 
247 aa  45.4  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>