More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0068 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0068  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
213 aa  420  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3569  hypothetical protein  48.35 
 
 
332 aa  161  5e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2810  class II aldolase/adducin family protein  50.54 
 
 
332 aa  156  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2472  class II aldolase/adducin family protein  43.35 
 
 
324 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.480175  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1965  class II aldolase/adducin family protein  52.87 
 
 
385 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  36.84 
 
 
207 aa  101  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  35.75 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  32.29 
 
 
215 aa  92.4  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  34.69 
 
 
210 aa  91.7  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0217  class II aldolase/adducin family protein  38.86 
 
 
323 aa  91.3  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311562  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  31.69 
 
 
181 aa  91.3  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
222 aa  89  5e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0929  class II aldolase/adducin family protein  32.62 
 
 
239 aa  88.6  6e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  32.11 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  34.55 
 
 
243 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  29.35 
 
 
190 aa  87  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  34.55 
 
 
231 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  28.26 
 
 
181 aa  84  2e-15  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  30.27 
 
 
180 aa  83.2  3e-15  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1346  class II aldolase/adducin family protein  33.86 
 
 
189 aa  81.6  8e-15  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0532237  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  35.6 
 
 
217 aa  81.6  8e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  35.2 
 
 
215 aa  79.3  4e-14  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  34.66 
 
 
218 aa  77.8  1e-13  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  34.43 
 
 
215 aa  77  2e-13  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  34.07 
 
 
225 aa  75.9  4e-13  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  34.09 
 
 
218 aa  75.5  6e-13  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2062  class II aldolase/adducin family protein  34.55 
 
 
219 aa  74.7  9e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.02268e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  29.67 
 
 
265 aa  73.2  3e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  28.57 
 
 
303 aa  73.2  3e-12  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1445  class II aldolase/adducin family protein  37.08 
 
 
208 aa  72.4  4e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0823  class II aldolase/adducin family protein  36.31 
 
 
196 aa  72.4  4e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.345059  normal  0.860622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  32.98 
 
 
212 aa  72.4  5e-12  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  32.98 
 
 
212 aa  72.4  5e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  32.98 
 
 
212 aa  72.4  5e-12  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  32.98 
 
 
212 aa  72.4  5e-12  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  32.98 
 
 
212 aa  72.4  5e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2023  class II aldolase/adducin family protein  37.08 
 
 
208 aa  72.4  5e-12  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  32.98 
 
 
212 aa  72.4  5e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  32.98 
 
 
212 aa  72.4  5e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1697  class II aldolase/adducin family protein  30.9 
 
 
188 aa  72  6e-12  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1553  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
204 aa  72  6e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  36.22 
 
 
215 aa  71.6  9e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0939  class II aldolase/adducin family protein  31.32 
 
 
185 aa  70.9  1e-11  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.100017 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  30.21 
 
 
220 aa  70.9  1e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  26.92 
 
 
214 aa  71.2  1e-11  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0814  class II aldolase/adducin family protein  36.67 
 
 
192 aa  70.5  2e-11  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.537097  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  35.26 
 
 
210 aa  70.5  2e-11  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  33.16 
 
 
212 aa  70.5  2e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  33.16 
 
 
212 aa  70.5  2e-11  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  33.33 
 
 
219 aa  69.7  3e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3764  class II aldolase/adducin family protein  31.05 
 
 
212 aa  69.7  3e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00716825  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  31.16 
 
 
226 aa  69.3  4e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  32.45 
 
 
220 aa  69.3  4e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2271  class II aldolase/adducin-like  30 
 
 
197 aa  69.3  4e-11  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.453989  hitchhiker  0.000307852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0310  class II aldolase/adducin domain protein  32.02 
 
 
260 aa  68.6  7e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  30.17 
 
 
398 aa  68.6  8e-11  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  29.84 
 
 
264 aa  68.6  8e-11  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  9.51199e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0799  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.15 
 
 
227 aa  68.2  9e-11  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540069  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  34.94 
 
 
235 aa  67.8  1e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  27.03 
 
 
216 aa  67.8  1e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.88741e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02740  class II aldolase/adducin domain protein  32.02 
 
 
260 aa  68.2  1e-10  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0288967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  33.73 
 
 
220 aa  67.8  1e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3182  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.33 
 
 
222 aa  67  2e-10  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3331  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.33 
 
 
222 aa  67  2e-10  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3321  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.33 
 
 
222 aa  67  2e-10  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1656  aminotransferase  27.5 
 
 
753 aa  67  2e-10  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12102  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1451  L-fuculose phosphate aldolase  31.64 
 
 
215 aa  66.2  3e-10  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1308  class II aldolase/adducin domain protein  31.09 
 
 
260 aa  66.2  3e-10  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0198  class II aldolase/adducin family protein  24.34 
 
 
180 aa  66.6  3e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0602846  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3303  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  33.66 
 
 
205 aa  66.6  3e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2940  L-fuculose phosphate aldolase  28.87 
 
 
215 aa  66.2  4e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0887911  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  33.94 
 
 
235 aa  65.9  4e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3384  class II aldolase/adducin family protein  29.83 
 
 
213 aa  65.5  5e-10  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2623  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  32.39 
 
 
207 aa  65.9  5e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3215  class II aldolase/adducin family protein  26.06 
 
 
216 aa  65.9  5e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.549465  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  28.04 
 
 
271 aa  65.5  6e-10  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4089  class II aldolase/adducin family protein  33.71 
 
 
234 aa  65.5  6e-10  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117914 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2944  L-fuculose phosphate aldolase  29.57 
 
 
215 aa  65.1  7e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.818387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3105  L-fuculose phosphate aldolase  29.57 
 
 
215 aa  65.1  7e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0609222  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0912  L-fuculose phosphate aldolase  29.57 
 
 
215 aa  65.1  7e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4064  L-fuculose phosphate aldolase  29.57 
 
 
215 aa  65.1  8e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  32.39 
 
 
220 aa  65.1  8e-10  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  25.52 
 
 
214 aa  64.7  9e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0650  class II aldolase/adducin family protein  28.42 
 
 
222 aa  64.7  9e-10  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.249121  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  25.91 
 
 
214 aa  64.7  1e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0414  class II aldolase/adducin family protein  31.03 
 
 
214 aa  64.3  1e-09  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0882  class II aldolase/adducin domain protein  31.38 
 
 
259 aa  64.3  1e-09  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3297  L-fuculose phosphate aldolase  28.87 
 
 
215 aa  63.5  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3117  L-fuculose phosphate aldolase  28.87 
 
 
215 aa  63.5  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0963126  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1861  class II aldolase/adducin family protein  28.65 
 
 
212 aa  63.5  2e-09  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00424065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3197  L-fuculose phosphate aldolase  28.87 
 
 
215 aa  63.5  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  33.33 
 
 
235 aa  63.9  2e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3182  L-fuculose phosphate aldolase  28.87 
 
 
215 aa  63.5  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.259088  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1514  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  22.96 
 
 
203 aa  63.9  2e-09  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.430865  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3134  L-fuculose phosphate aldolase  28.87 
 
 
215 aa  63.9  2e-09  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.248467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2157  class II aldolase/adducin family protein  31.82 
 
 
222 aa  63.2  3e-09  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.257803  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  27.37 
 
 
428 aa  63.2  3e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4303  class II aldolase/adducin domain protein  29.69 
 
 
262 aa  63.2  3e-09  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.891034  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  27.93 
 
 
214 aa  63.2  3e-09  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1143  methylthioribulose-1-phosphate dehydratase  28.85 
 
 
204 aa  62.4  4e-09  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>