More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0067 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  100 
 
 
171 aa  347  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  45.78 
 
 
193 aa  160  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  41.46 
 
 
189 aa  136  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  42.86 
 
 
189 aa  133  1e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  39.02 
 
 
190 aa  132  2e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  42.94 
 
 
199 aa  131  4e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  37.65 
 
 
177 aa  125  3e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  39.31 
 
 
175 aa  123  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  34.62 
 
 
196 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  35.67 
 
 
182 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  35.47 
 
 
180 aa  117  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  34.88 
 
 
175 aa  117  8e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  36.99 
 
 
177 aa  116  1e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  36.26 
 
 
197 aa  117  1e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  36.26 
 
 
197 aa  117  1e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  35.58 
 
 
213 aa  115  2e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  35 
 
 
198 aa  115  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  37.79 
 
 
183 aa  115  4e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  35.76 
 
 
174 aa  114  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  36.36 
 
 
201 aa  114  6e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  37.79 
 
 
183 aa  114  8e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  38.95 
 
 
182 aa  113  1e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  36.36 
 
 
214 aa  113  1e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  37.79 
 
 
183 aa  111  4e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  33.12 
 
 
199 aa  110  1e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  37.79 
 
 
204 aa  110  1e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  1.52609e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  34.88 
 
 
177 aa  109  1e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  36.47 
 
 
176 aa  109  2e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  36.05 
 
 
182 aa  109  2e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  35.67 
 
 
175 aa  108  4e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  6.02513e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  33.73 
 
 
182 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  34.3 
 
 
187 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  34.91 
 
 
212 aa  107  6e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  34.68 
 
 
175 aa  107  7e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  32.56 
 
 
182 aa  106  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  33.75 
 
 
202 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  36.09 
 
 
179 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  35.5 
 
 
182 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  37.21 
 
 
201 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  37.43 
 
 
223 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  34.3 
 
 
174 aa  104  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  103  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  34.12 
 
 
177 aa  104  8e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  36.84 
 
 
201 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  37.95 
 
 
187 aa  103  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  33.53 
 
 
201 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  34.12 
 
 
195 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  1.27378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  31.87 
 
 
206 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  33.33 
 
 
225 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  32.35 
 
 
200 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  32.56 
 
 
187 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  36.75 
 
 
196 aa  100  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  32.94 
 
 
201 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  35.09 
 
 
182 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  35.09 
 
 
182 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  31.95 
 
 
201 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  35.09 
 
 
182 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  32.76 
 
 
201 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  32.56 
 
 
186 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  32.91 
 
 
205 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  34.71 
 
 
189 aa  99.4  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  31.76 
 
 
182 aa  99.4  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  31.4 
 
 
201 aa  98.6  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.60413e-15 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  31.18 
 
 
196 aa  98.2  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  30.91 
 
 
205 aa  97.8  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  31.98 
 
 
188 aa  97.8  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  31.52 
 
 
189 aa  97.4  8e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  2.5527e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0195  YceI family protein  33.33 
 
 
187 aa  97.1  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  32.16 
 
 
183 aa  97.1  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  37.21 
 
 
176 aa  96.3  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  28.75 
 
 
207 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0727  conserved hypothetical protein, YceI family  31.1 
 
 
190 aa  95.1  4e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0212414  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  32.56 
 
 
181 aa  95.1  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3229  hypothetical protein  33.93 
 
 
197 aa  95.1  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.474421  normal  0.780413 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  32.54 
 
 
188 aa  94.4  7e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  30.29 
 
 
213 aa  94  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  30.29 
 
 
213 aa  94  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  33.14 
 
 
181 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  32.75 
 
 
185 aa  93.6  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0890  YceI  29.88 
 
 
220 aa  93.2  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1831  YceI  32.12 
 
 
193 aa  94  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.033679  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  28.32 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  32.18 
 
 
194 aa  94  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  34.48 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  33.53 
 
 
181 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  36.99 
 
 
181 aa  92.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  33.93 
 
 
188 aa  92.4  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  34.57 
 
 
179 aa  92  3e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  35.86 
 
 
181 aa  92  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  32.94 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  33.73 
 
 
184 aa  91.7  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  28.9 
 
 
190 aa  91.7  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  32.94 
 
 
199 aa  91.3  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  35.09 
 
 
181 aa  91.3  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  30.64 
 
 
171 aa  91.3  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  30.64 
 
 
171 aa  91.3  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  1.57098e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  31.71 
 
 
216 aa  91.3  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  33.33 
 
 
190 aa  90.9  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.845742 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  28.24 
 
 
207 aa  90.9  8e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  5.43514e-06  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  32.76 
 
 
180 aa  90.1  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>