More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0064 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0064  A/G-specific adenine glycosylase  100 
 
 
435 aa  898  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2698  A/G-specific adenine glycosylase  58.68 
 
 
396 aa  452  1e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.265639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1921  A/G-specific adenine glycosylase  57.88 
 
 
434 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0892  A/G-specific adenine glycosylase  58.26 
 
 
373 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.243357  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0212  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  56.78 
 
 
368 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.880726  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  51.13 
 
 
360 aa  377  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2733  A/G-specific adenine glycosylase  45.95 
 
 
388 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.610696  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  41.14 
 
 
383 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1519  A/G-specific adenine glycosylase  42.44 
 
 
360 aa  259  6e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.570552  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0322  A/G-specific adenine glycosylase  39.77 
 
 
352 aa  259  9e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.37419e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.4 
 
 
360 aa  255  1e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  37.3 
 
 
386 aa  247  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3062  A/G-specific adenine glycosylase  34.88 
 
 
352 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3059  A/G-specific adenine glycosylase  34.6 
 
 
352 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4529  A/G-specific adenine glycosylase  35.15 
 
 
363 aa  239  6e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593144 
 
 
-
 
NC_002620  TC0383  A/G-specific adenine glycosylase  34.42 
 
 
371 aa  234  3e-60  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3349  A/G-specific adenine glycosylase  35.33 
 
 
381 aa  232  9e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.574146  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0430  A/G-specific adenine glycosylase  35.46 
 
 
365 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  4.40987e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0439  A/G-specific adenine glycosylase  35.36 
 
 
365 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  7.18891e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0503  A/G-specific adenine glycosylase  35.18 
 
 
365 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0578  A/G-specific adenine glycosylase  35.18 
 
 
365 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  6.08246e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0491  A/G-specific adenine glycosylase  35.18 
 
 
365 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  1.44393e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0522  A/G-specific adenine glycosylase  35.18 
 
 
365 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0115272  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0577  A/G-specific adenine glycosylase  35.46 
 
 
365 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.93741e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1345  A/G-specific adenine glycosylase  36.16 
 
 
366 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0434  A/G-specific adenine glycosylase  35.18 
 
 
365 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.07824e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0525  A/G-specific adenine glycosylase  34.9 
 
 
365 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.61286e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4799  A/G-specific adenine glycosylase  34.9 
 
 
365 aa  224  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  3.70724e-09  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0937  A/G-specific adenine glycosylase  40.55 
 
 
354 aa  223  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2808  A/G-specific adenine glycosylase  35.09 
 
 
368 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2797  A/G-specific adenine glycosylase  35.09 
 
 
368 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2183  A/G-specific adenine glycosylase  35.09 
 
 
368 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602702  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0443  A/G-specific adenine glycosylase  37.3 
 
 
364 aa  219  8e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5342  A/G-specific adenine glycosylase  43.02 
 
 
355 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0480  A/G-specific adenine glycosylase  35.54 
 
 
368 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5884  A/G-specific adenine glycosylase  44.02 
 
 
355 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4901  A/G-specific adenine glycosylase MutY  43.02 
 
 
355 aa  217  3e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0903  A/G-specific adenine glycosylase  39.08 
 
 
386 aa  217  3e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.98471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3368  A/G-specific adenine glycosylase  33.79 
 
 
365 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1251  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.51 
 
 
372 aa  216  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000556638  normal  0.540816 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0522  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.89 
 
 
353 aa  215  1e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000130755  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6127  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  36.03 
 
 
368 aa  215  1e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201611  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0518  A/G-specific adenine glycosylase  35.47 
 
 
370 aa  214  2e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.851283  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1181  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.24 
 
 
372 aa  214  2e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  1.1452e-06  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0468  A/G-specific adenine glycosylase  33.88 
 
 
366 aa  214  3e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  7.36881e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1378  A/G-specific adenine glycosylase  39.35 
 
 
407 aa  213  4e-54  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0309494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2321  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  37.68 
 
 
367 aa  213  4e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0078  A/G-specific adenine glycosylase  35.15 
 
 
383 aa  213  5e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.99857  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1180  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.52 
 
 
372 aa  212  9e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  2.36828e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0120  A/G-specific adenine glycosylase  34.81 
 
 
350 aa  212  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  5.58564e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0857  A/G-specific adenine glycosylase  43.08 
 
 
353 aa  212  1e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3053  A/G-specific adenine glycosylase  35.87 
 
 
363 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000966997  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3196  A/G-specific adenine glycosylase  35.87 
 
 
363 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000131734  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0320  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.09 
 
 
355 aa  211  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0253407  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1325  A/G-specific adenine glycosylase  35.87 
 
 
363 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00655288  hitchhiker  0.00812067 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4368  A/G-specific adenine glycosylase  37.39 
 
 
371 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.357853  normal  0.0220919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0337  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  40.76 
 
 
355 aa  210  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.625053  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0320  A/G-specific adenine glycosylase  34.41 
 
 
369 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0151  adenine DNA glycosylase  36.77 
 
 
372 aa  210  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.523345  hitchhiker  7.64149e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2700  A/G-specific adenine glycosylase  35.87 
 
 
362 aa  210  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.469189  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20801  adenine glycosylase  34.38 
 
 
384 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2695  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  38.32 
 
 
361 aa  209  6e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.375064 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1535  A/G-specific adenine glycosylase  40.86 
 
 
344 aa  209  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233456  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04530  A/G-specific adenine glycosylase  43.36 
 
 
362 aa  209  8e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0819  adenine DNA glycosylase  36.77 
 
 
371 aa  209  9e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0155  A/G-specific adenine glycosylase  39.47 
 
 
373 aa  208  1e-52  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3039  A/G-specific adenine glycosylase  35.56 
 
 
363 aa  209  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  4.95773e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1928  A/G-specific adenine glycosylase  38.54 
 
 
399 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0820  adenine DNA glycosylase  36.45 
 
 
419 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.746728  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4259  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.72 
 
 
355 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  4.89397e-09 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2525  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  41.89 
 
 
368 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2490  A/G-specific adenine glycosylase  32.6 
 
 
368 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.646812  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2013  A/G-specific adenine glycosylase  39 
 
 
401 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0930  hypothetical protein  35.33 
 
 
355 aa  207  3e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1133  A/G-specific adenine DNA glycosylase  35.97 
 
 
354 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.893564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0306  A/G-specific adenine glycosylase  38.44 
 
 
355 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4428  A/G-specific adenine glycosylase  40.83 
 
 
401 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000382334  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1003  A/G-specific adenine glycosylase  35.97 
 
 
354 aa  207  3e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0662317  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4922  A/G-specific adenine glycosylase  42.47 
 
 
355 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  2.08141e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0076  A/G-specific adenine glycosylase  35.35 
 
 
354 aa  206  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0099  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  34.49 
 
 
396 aa  206  6e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0722569  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0286  A/G-specific adenine glycosylase  38.11 
 
 
355 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160369 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1205  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  33.42 
 
 
384 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4043  adenine DNA glycosylase  37.87 
 
 
381 aa  206  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0975151 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0759  A/G-specific adenine glycosylase  37.66 
 
 
368 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0882  adenine DNA glycosylase  37.18 
 
 
368 aa  205  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3114  A/G-specific adenine glycosylase  39.37 
 
 
368 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2936  A/G-specific adenine glycosylase  39.37 
 
 
368 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1508  A/G-specific adenine glycosylase  39.37 
 
 
368 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.198974  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0591  A/G-specific adenine glycosylase  39.37 
 
 
368 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0575  A/G-specific adenine glycosylase  39.37 
 
 
368 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.424229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0117  A/G-specific adenine glycosylase  39.62 
 
 
367 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.571395  normal  0.180189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1466  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  39.62 
 
 
367 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0082  A/G-specific adenine glycosylase  39.37 
 
 
368 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1545  A/G-specific adenine glycosylase  35.62 
 
 
374 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151581  normal  0.696978 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1406  A/G-specific adenine glycosylase  38.52 
 
 
347 aa  204  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1922  A/G-specific adenine glycosylase  38.52 
 
 
345 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1956  A/G-specific adenine glycosylase  38.52 
 
 
345 aa  203  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0311  A/G-specific adenine glycosylase  37.79 
 
 
355 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354771  normal  0.798997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0423  A/G-specific adenine glycosylase  40.3 
 
 
382 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>