172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0062 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0062  protein of unknown function DUF150  100 
 
 		 258 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2516  hypothetical protein  35.11 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2430  hypothetical protein  39.73 
 
 		 172 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.838305 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2411  protein of unknown function DUF150  30.67 
 
 		 162 aa  92.4  7e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3160  hypothetical protein  29.55 
 
 		 173 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000242539  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0819  hypothetical protein  30.29 
 
 		 153 aa  85.1  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0498  protein of unknown function DUF150  26.85 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2710  hypothetical protein  29.17 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.955868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2817  hypothetical protein  28.97 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62780  hypothetical protein  31.03 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5464  hypothetical protein  31.03 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.220559  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0067  hypothetical protein  27.66 
 
 		 166 aa  68.2  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3730  hypothetical protein  32 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.233176  normal  0.972926 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0155  hypothetical protein  27.92 
 
 		 166 aa  67.8  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0072  hypothetical protein  27.13 
 
 		 166 aa  67  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.301721 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1025  hypothetical protein  27.54 
 
 		 153 aa  67  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0701268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1202  hypothetical protein  30.15 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1028  hypothetical protein  30.15 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0162582  hitchhiker  0.000040041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2836  hypothetical protein  30.34 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113989  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1024  hypothetical protein  30.15 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675581  hitchhiker  0.000125098 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1089  hypothetical protein  30.15 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00297736  normal  0.0584009 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01758  hypothetical protein  27.22 
 
 		 165 aa  65.5  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.632823  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1666  hypothetical protein  26.73 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1693  hypothetical protein  34.26 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3563  hypothetical protein  27.78 
 
 		 151 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.380474  hitchhiker  0.00000509959 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0573  protein of unknown function DUF150  30.83 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.300735  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3610  hypothetical protein  27.78 
 
 		 152 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0719  hypothetical protein  28.4 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1121  hypothetical protein  26.71 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0959  hypothetical protein  30.99 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0670206  normal  0.152595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0815  hypothetical protein  25.71 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329343 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3062  hypothetical protein  26.86 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525096  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42840  hypothetical protein  28.03 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4714  hypothetical protein  27.78 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3076  hypothetical protein  27.11 
 
 		 153 aa  62  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0988  hypothetical protein  30.15 
 
 		 165 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00512206  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4714  hypothetical protein  27.16 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109953  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1552  hypothetical protein  33.06 
 
 		 162 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175864  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1126  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00017917  unclonable  0.00000000000392786 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3241  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000301073  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2829  hypothetical protein  26.54 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000100799  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4579  hypothetical protein  27.16 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3282  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000111408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3419  hypothetical protein  29.37 
 
 		 151 aa  60.8  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324963  decreased coverage  0.0000990075 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2201  hypothetical protein  23.63 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0777  hypothetical protein  28.66 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000034015  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1005  hypothetical protein  30.15 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0545714  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0723  protein of unknown function DUF150  26.47 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.244111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1001  protein of unknown function DUF150  26.53 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2822  hypothetical protein  23.43 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0561  hypothetical protein  26.32 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3391  hypothetical protein  28.21 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000810372  hitchhiker  0.000625033 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0177  hypothetical protein  24.31 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.020604  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2691  hypothetical protein  23.43 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1898  hypothetical protein  26.24 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000581162  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0553  protein of unknown function DUF150  40.86 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.169356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4182  hypothetical protein  25.93 
 
 		 158 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.844103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0234  hypothetical protein  33.9 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0443  hypothetical protein  36.52 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0389  lipoprotein, putative  40.86 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.281265  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2988  hypothetical protein  35.96 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.390443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0201  hypothetical protein  23.98 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0967046  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2162  hypothetical protein  28.74 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.213663  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01301  hypothetical protein  29.49 
 
 		 176 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.463213  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1469  protein of unknown function DUF150  28.78 
 
 		 166 aa  57  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000542376  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2074  hypothetical protein  28.74 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0717176  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1602  hypothetical protein  26.35 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.781407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3856  protein of unknown function DUF150  29.14 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113765  normal  0.0726856 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4492  hypothetical protein  26.11 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3350  hypothetical protein  27.11 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.223242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3607  hypothetical protein  34.31 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0237098  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1138  hypothetical protein  34.35 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0279371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0806  protein of unknown function DUF150  33.33 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0296  hypothetical protein  31.5 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.299993  normal  0.029017 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0041  hypothetical protein  38.82 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0597  hypothetical protein  34.75 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2563  hypothetical protein  27.81 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  hitchhiker  0.00397879 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2088  protein of unknown function DUF150  38.2 
 
 		 154 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1950  hypothetical protein  23.26 
 
 		 176 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.197995  normal  0.0512088 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4491  hypothetical protein  30.67 
 
 		 154 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3466  hypothetical protein  30.67 
 
 		 154 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.155297  normal  0.925377 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03037  hypothetical protein  34.31 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0535  protein of unknown function DUF150  34.31 
 
 		 140 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02988  hypothetical protein  34.31 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3601  hypothetical protein  34.31 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.948868  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0528  hypothetical protein  34.31 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3991  hypothetical protein  34.65 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000106744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0960  hypothetical protein  27.98 
 
 		 161 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3732  hypothetical protein  34.65 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0172  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  54.3  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137373  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3438  hypothetical protein  35.87 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3598  hypothetical protein  34.65 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000374705  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3362  hypothetical protein  34.31 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3655  hypothetical protein  34.31 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162114  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0021  hypothetical protein  39.13 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0581916 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3467  protein of unknown function DUF150  34.65 
 
 		 154 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 191 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0750  hypothetical protein  27.91 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2746  hypothetical protein  35 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1245  hypothetical protein  36.25 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.172116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>