More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0059 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4217  translation initiation factor 2  50.78 
 
 
1011 aa  649  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726068  normal  0.0540264 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  55.28 
 
 
921 aa  770  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  100 
 
 
997 aa  1979  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0961  translation initiation factor IF-2  52.92 
 
 
882 aa  662  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875845  normal  0.117843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3348  translation initiation factor IF-2  54.07 
 
 
848 aa  640  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0346308  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  59.44 
 
 
1079 aa  1147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3383  translation initiation factor IF-2  54.46 
 
 
943 aa  657  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.121659  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2011  translation initiation factor IF-2  53.78 
 
 
992 aa  645  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577771  normal  0.890025 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2561  translation initiation factor IF-2  55.23 
 
 
943 aa  647  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.334789  normal  0.0201615 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  52.62 
 
 
971 aa  687  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 
975 aa  660  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2513  translation initiation factor IF-2  80.78 
 
 
1079 aa  1028  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  52.54 
 
 
894 aa  654  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  1.80014e-06 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1921  translation initiation factor IF-2  54.79 
 
 
948 aa  639  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0602032 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 
975 aa  660  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1230  translation initiation factor IF-2  55.96 
 
 
951 aa  657  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0683246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1030  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 
889 aa  668  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  9.67139e-05 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 
971 aa  656  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1210  translation initiation factor IF-2  51.58 
 
 
964 aa  641  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 
971 aa  656  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1695  translation initiation factor IF-2  53.32 
 
 
869 aa  643  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 
975 aa  662  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  59.48 
 
 
732 aa  689  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.74472e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2748  translation initiation factor IF-2  55.89 
 
 
984 aa  660  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1026  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 
885 aa  668  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.748082  hitchhiker  4.1871e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1091  translation initiation factor IF-2  55.14 
 
 
885 aa  668  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.193665  normal  0.0905739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  54.99 
 
 
881 aa  666  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  43.03 
 
 
882 aa  687  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1382  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 
971 aa  662  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350038  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1051  translation initiation factor IF-2  57 
 
 
845 aa  647  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  2.51511e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1247  translation initiation factor IF-2  55.4 
 
 
943 aa  649  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0182707  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  55.67 
 
 
1161 aa  680  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3239  translation initiation factor IF-2  54.3 
 
 
880 aa  658  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.432211  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 
975 aa  662  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  54.41 
 
 
894 aa  658  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  52.37 
 
 
896 aa  661  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0489  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 
895 aa  652  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.160314 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  54.48 
 
 
896 aa  654  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3035  translation initiation factor IF-2  58.03 
 
 
884 aa  676  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.19789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3417  translation initiation factor IF-2  54.3 
 
 
880 aa  658  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0572462  hitchhiker  0.00115564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2990  translation initiation factor IF-2  54.55 
 
 
953 aa  642  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292743  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1755  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 
969 aa  659  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.718536  normal  0.0607148 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  53.71 
 
 
949 aa  736  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  56.35 
 
 
692 aa  667  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1117  translation initiation factor IF-2  52.88 
 
 
964 aa  641  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.988321  normal  0.615167 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  50.75 
 
 
888 aa  664  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1632  translation initiation factor IF-2  54.44 
 
 
986 aa  659  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141337 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1729  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 
965 aa  652  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.381605  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01760  translation initiation factor IF-2  54.59 
 
 
868 aa  645  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1162  translation initiation factor IF-2  55.96 
 
 
946 aa  656  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  57.99 
 
 
986 aa  755  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 
975 aa  660  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1128  translation initiation factor IF-2  54.3 
 
 
880 aa  658  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.247429  unclonable  1.85319e-11 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  53.32 
 
 
885 aa  660  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  52.42 
 
 
985 aa  692  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2834  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 
880 aa  664  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  53.69 
 
 
898 aa  650  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  55.72 
 
 
882 aa  757  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1692  translation initiation factor IF-2  50.07 
 
 
968 aa  648  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.258602  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3860  translation initiation factor IF-2  53.55 
 
 
686 aa  637  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.41928e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1422  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 
972 aa  660  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1027  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 
854 aa  640  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.295152  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3280  translation initiation factor IF-2  54.3 
 
 
880 aa  658  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2465  translation initiation factor IF-2  56.77 
 
 
689 aa  641  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  9.66946e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1141  translation initiation factor IF-2  50 
 
 
970 aa  682  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0110968 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  53.45 
 
 
971 aa  656  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 
975 aa  662  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  67.28 
 
 
892 aa  906  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  51.53 
 
 
1029 aa  682  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.40569e-05  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  48.36 
 
 
860 aa  636  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  52.87 
 
 
902 aa  646  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  60 
 
 
903 aa  702  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  1.07022e-07  unclonable  3.03018e-08 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  54.44 
 
 
976 aa  662  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1102  translation initiation factor IF-2  49.31 
 
 
950 aa  642  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.397412  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  54.61 
 
 
975 aa  660  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.37 
 
 
822 aa  669  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  70.09 
 
 
984 aa  1026  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  62.23 
 
 
884 aa  764  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  45.4 
 
 
947 aa  733  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.82401e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1467  translation initiation factor IF-2  53.95 
 
 
897 aa  643  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.382295  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  52.8 
 
 
972 aa  651  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  53.3 
 
 
922 aa  649  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  58.93 
 
 
924 aa  682  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  60 
 
 
739 aa  692  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0747  translation initiation factor IF-2  46.5 
 
 
964 aa  638  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152188  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2028  translation initiation factor IF-2  56.32 
 
 
966 aa  644  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  55.28 
 
 
940 aa  946  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1204  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 
885 aa  669  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2820  translation initiation factor IF-2  54.77 
 
 
989 aa  660  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0105621  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2203  translation initiation factor IF-2  54.02 
 
 
889 aa  656  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3851  translation initiation factor IF-2  53.55 
 
 
686 aa  637  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.970916  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1289  translation initiation factor IF-2  53.99 
 
 
964 aa  652  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.772813 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  54.15 
 
 
884 aa  651  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0836  translation initiation factor IF-2  54.97 
 
 
720 aa  644  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  54.73 
 
 
843 aa  645  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50.75 
 
 
896 aa  668  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  62.46 
 
 
883 aa  759  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  47.18 
 
 
1008 aa  646  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2031  translation initiation factor IF-2  53.18 
 
 
979 aa  662  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00715867 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  52.07 
 
 
907 aa  665  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>