45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0058 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0058  protein of unknown function DUF503  100 
 
 
105 aa  216  8e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2434  hypothetical protein  72.92 
 
 
96 aa  147  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.211063  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2512  protein of unknown function DUF503  66.67 
 
 
102 aa  136  9e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3163  hypothetical protein  61.46 
 
 
116 aa  127  4e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0494  protein of unknown function DUF503  44.68 
 
 
95 aa  92  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.750456  normal  0.915938 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2415  protein of unknown function DUF503  44.21 
 
 
95 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1275  hypothetical protein  32.61 
 
 
93 aa  60.8  6e-09  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1704  Adenosylcobinamide-phosphate guanylyltransferase  36.47 
 
 
280 aa  55.5  2e-07  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1260  protein of unknown function DUF503  29.03 
 
 
93 aa  55.1  3e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873275  normal  0.807487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1229  hypothetical protein  32.53 
 
 
90 aa  55.1  3e-07  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.172595  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0887  hypothetical protein  31.52 
 
 
93 aa  49.7  1e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1209  protein of unknown function DUF503  29.35 
 
 
93 aa  49.3  2e-05  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00247478  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1142  hypothetical protein  33.78 
 
 
136 aa  49.3  2e-05  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0433815 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3591  protein of unknown function DUF503  30.14 
 
 
98 aa  47.8  5e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127573  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1556  hypothetical protein  29.35 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.78609e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4216  hypothetical protein  38.57 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.472071  normal  0.0308507 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0884  hypothetical protein  29.17 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.577222  hitchhiker  0.00486437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0859  protein of unknown function DUF503  29.89 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3583  hypothetical protein  26.58 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1705  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  3.31281e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15590  hypothetical protein  30.26 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1163  protein of unknown function DUF503  32.43 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.517252  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1231  protein of unknown function DUF503  32.43 
 
 
151 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0180533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3965  protein of unknown function DUF503  28.77 
 
 
98 aa  43.9  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1334  hypothetical protein  24.73 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0659089  hitchhiker  0.00140554 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3571  hypothetical protein  24.73 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3553  hypothetical protein  24.73 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3663  hypothetical protein  24.73 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.394752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3850  hypothetical protein  24.73 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3949  hypothetical protein  24.73 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3859  hypothetical protein  24.73 
 
 
93 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.76858e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4087  hypothetical protein  28.12 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.283841 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1514  hypothetical protein  31.51 
 
 
99 aa  42.7  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0528922  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0584  hypothetical protein  28.72 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3603  protein of unknown function DUF503  26.88 
 
 
93 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1881  hypothetical protein  35.38 
 
 
96 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.40284e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3726  hypothetical protein  29 
 
 
97 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.40241  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3330  protein of unknown function DUF503  25.77 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.157533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3634  hypothetical protein  29.51 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0542706  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3910  hypothetical protein  29.51 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.359011  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1103  hypothetical protein  31.08 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3034  hypothetical protein  23.53 
 
 
104 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00080988  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0968  hypothetical protein  32.26 
 
 
98 aa  40.4  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14580  hypothetical protein  26.8 
 
 
97 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00790789  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2320  protein of unknown function DUF503  25.3 
 
 
94 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0422608 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>