182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0057 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0057  phosphoesterase RecJ domain protein  100 
 
 
369 aa  749    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2435  phosphoesterase domain-containing protein  43.12 
 
 
333 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190071  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2511  phosphoesterase RecJ domain protein  43.26 
 
 
330 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3164  DHH family protein  40.75 
 
 
335 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0492  phosphoesterase RecJ domain protein  35.67 
 
 
330 aa  178  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2417  phosphoesterase RecJ domain protein  34.18 
 
 
320 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.163067  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1231  phosphoesterase domain-containing protein  35.14 
 
 
326 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1643  phosphoesterase domain-containing protein  29.87 
 
 
317 aa  165  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3674  phosphoesterase RecJ domain protein  30.77 
 
 
326 aa  153  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1437  phosphoesterase RecJ domain protein  34.24 
 
 
339 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46248  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1258  phosphoesterase domain-containing protein  31.51 
 
 
333 aa  146  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1903  phosphoesterase domain-containing protein  30.25 
 
 
316 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000370266  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1197  phosphoesterase domain-containing protein  29.39 
 
 
333 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0177078  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0265  phosphoesterase domain-containing protein  30.06 
 
 
332 aa  141  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1053  phosphoesterase RecJ domain protein  28.03 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135026  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4214  phosphoesterase, RecJ-like  31.07 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0130006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0459  phosphoesterase RecJ domain protein  27.67 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0574  phosphoesterase domain-containing protein  27.96 
 
 
335 aa  139  6e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07860  phosphoesterase RecJ domain protein  28.48 
 
 
324 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1955  phosphoesterase domain-containing protein  29.43 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0989  phosphoesterase, RecJ-like protein  28.85 
 
 
318 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1527  phosphoesterase domain-containing protein  28.97 
 
 
326 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.438361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3186  phosphoesterase RecJ domain protein  29.3 
 
 
326 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.500315  normal  0.376889 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1290  phosphoesterase, RecJ-like protein  32.13 
 
 
335 aa  129  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3032  phosphoesterase domain-containing protein  30.06 
 
 
325 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000448044  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0928  phosphoesterase domain-containing protein  30.82 
 
 
331 aa  129  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.353349  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1582  phosphoesterase RecJ domain protein  31.29 
 
 
339 aa  129  1.0000000000000001e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000783458  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0675  phosphoesterase domain-containing protein  32.23 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000812168 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0902  phosphoesterase, RecJ-like protein  29.52 
 
 
320 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1588  phosphoesterase, RecJ-like  29.54 
 
 
316 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000485827  normal  0.0878205 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1492  phosphoesterase RecJ domain protein  28.97 
 
 
330 aa  124  2e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.136328  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1656  DHH subfamily 1 protein  27.16 
 
 
317 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1938  DHH subfamily 1 protein  27.16 
 
 
317 aa  123  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2772  phosphoesterase domain-containing protein  28.29 
 
 
324 aa  123  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1671  phosphoesterase RecJ domain protein  29.79 
 
 
321 aa  122  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00108699  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1211  phosphoesterase RecJ domain protein  26.25 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.029721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3570  phosphoesterase RecJ domain protein  31.45 
 
 
330 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.672109  normal  0.13788 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0750  phosphoesterase RecJ domain protein  32.13 
 
 
337 aa  119  7e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1590  DHH domain-containing protein  31.12 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00964569  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0126  phosphoesterase RecJ domain protein  34.33 
 
 
330 aa  119  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.096959  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10698  hypothetical protein  27.98 
 
 
351 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1558  exopolyphosphatase related protein  30.77 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000120435  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0480  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  32.24 
 
 
325 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2979  phosphoesterase RecJ domain protein  27.46 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.90981e-25 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0611  phosphoesterase RecJ domain protein  27.76 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0230502  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1185  phosphoesterase domain-containing protein  31.7 
 
 
364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.991694  normal  0.383627 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3559  phosphoesterase, RecJ-like  31.74 
 
 
386 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0624488  normal  0.616422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0478  phosphoesterase domain-containing protein  32.7 
 
 
330 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1305  phosphoesterase RecJ domain protein  27.46 
 
 
322 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0017187  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0983  phosphoesterase RecJ domain protein  25.55 
 
 
314 aa  112  8.000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3224  phosphoesterase RecJ domain protein  28.15 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1808  phosphoesterase RecJ domain protein  32.29 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.270612  normal  0.187391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2119  exopolyphosphatase-like protein  31.97 
 
 
332 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1479  DHH superfamily protein, subfamily 1  27.15 
 
 
333 aa  109  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0422  phosphoesterase RecJ domain protein  28.43 
 
 
341 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.788368  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1052  phosphoesterase, RecJ-like  30.15 
 
 
322 aa  107  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287381  hitchhiker  0.000000192246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0965  phosphoesterase domain-containing protein  26.45 
 
 
319 aa  106  6e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0127219  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0990  phosphoesterase DHHA1  26.95 
 
 
330 aa  106  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00349102  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3328  phosphoesterase RecJ domain protein  29.52 
 
 
350 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.506881  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1091  DHH subfamily 1 protein  28.75 
 
 
331 aa  105  1e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.302124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1660  phosphoesterase RecJ domain protein  27.76 
 
 
332 aa  102  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08020  exopolyphosphatase-like enzyme  29.33 
 
 
334 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.371885 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2395  hypothetical protein  26.54 
 
 
336 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5468  phosphoesterase RecJ domain protein  28.27 
 
 
334 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.296573  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1718  phosphoesterase RecJ domain protein  28.34 
 
 
314 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.073164  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0241  phosphoesterase RecJ domain protein  28.62 
 
 
314 aa  102  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.126472  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1275  phosphoesterase RecJ domain protein  29.22 
 
 
353 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000587589  normal  0.191981 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1711  phosphoesterase RecJ domain protein  28.48 
 
 
366 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.041209  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0953  DHH family protein  26.27 
 
 
355 aa  98.2  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.307691 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1446  phosphoesterase RecJ domain protein  24.22 
 
 
326 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000307129  normal  0.170666 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1506  phosphoesterase RecJ domain protein  28.19 
 
 
352 aa  97.4  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0682991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6028  phosphoesterase RecJ domain protein  27.97 
 
 
343 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2816  phosphoesterase domain-containing protein  28.68 
 
 
338 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.231763  hitchhiker  0.00239161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1373  phosphoesterase domain-containing protein  29.03 
 
 
348 aa  96.3  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.796357  normal  0.138678 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2615  phosphoesterase RecJ domain protein  24.05 
 
 
331 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00112794  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0998  phosphoesterase RecJ domain protein  26.3 
 
 
358 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5831  phosphoesterase RecJ domain protein  29.93 
 
 
336 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0452248  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1064  phosphoesterase RecJ domain-containing protein  29.93 
 
 
342 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  0.0224811 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0539  phosphoesterase RecJ domain protein  29.04 
 
 
336 aa  91.3  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000146173 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0601  hypothetical protein  27.07 
 
 
336 aa  90.5  4e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09380  exopolyphosphatase-like enzyme  30.23 
 
 
336 aa  89.4  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.91305  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2370  phosphoesterase domain-containing protein  23.72 
 
 
334 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1129  phosphoesterase domain-containing protein  27.97 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1856  phosphoesterase RecJ domain protein  22.9 
 
 
335 aa  86.7  6e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.766478  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3962  phosphoesterase RecJ domain protein  31.58 
 
 
357 aa  86.7  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf830  DHH family phosphoesterase  26.07 
 
 
329 aa  86.3  8e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1412  phosphoesterase RecJ domain protein  25.69 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.595012  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1414  phosphoesterase, RecJ-like protein  31.08 
 
 
322 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2210  phosphoesterase RecJ domain protein  31.01 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00226161  decreased coverage  0.000527664 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0637  DHH family protein  23.75 
 
 
320 aa  81.3  0.00000000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.000263818  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1538  phosphoesterase domain-containing protein  26.33 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.490087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0520  DHH subfamily 1 protein  26.53 
 
 
356 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4717  DHH subfamily 1 protein  26.53 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1760  phosphoesterase domain-containing protein  23.53 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.619947  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1794  phosphoesterase domain-containing protein  23.53 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0318  phosphoesterase RecJ domain protein  23.3 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4437  phosphoesterase domain-containing protein  26.53 
 
 
310 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4734  DHH subfamily 1 protein  26.28 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0824  DHH family protein  25.96 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.534288  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2693  phosphoesterase RecJ domain protein  27.21 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>