More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0055 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  100 
 
 
89 aa  180  5e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  86.52 
 
 
89 aa  156  8e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  84.27 
 
 
89 aa  154  4e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  75.28 
 
 
89 aa  141  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  73.03 
 
 
89 aa  128  2e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1438  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  123  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24827e-10 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  122  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1433  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  121  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0572737  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  66.29 
 
 
89 aa  120  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  119  2e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  119  2e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2812  30S ribosomal protein S15  69.66 
 
 
86 aa  117  4e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789885  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  62.92 
 
 
89 aa  117  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 
88 aa  116  8e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  3.22002e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  116  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
87 aa  116  9e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 
87 aa  116  9e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  115  1e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  62.5 
 
 
90 aa  115  2e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  115  2e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1945  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  115  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0262342 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  114  4e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  65.17 
 
 
89 aa  114  4e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  58.43 
 
 
89 aa  114  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  6.90643e-12  hitchhiker  8.6131e-06 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
88 aa  114  6e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2449  SSU ribosomal protein S15P  62.92 
 
 
89 aa  113  7e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0751959  normal  0.780373 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  114  7e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  113  7e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  60.92 
 
 
88 aa  113  8e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  63.64 
 
 
88 aa  113  8e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  6.46106e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  113  9e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  113  9e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  113  9e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  113  9e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  113  9e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  113  9e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  113  9e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  113  9e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  62.07 
 
 
88 aa  112  1e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  60.92 
 
 
100 aa  112  1e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  65.85 
 
 
87 aa  113  1e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1582  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  112  1e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.844449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  112  1e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  61.63 
 
 
91 aa  112  1e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  113  1e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  112  2e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
88 aa  112  2e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  112  2e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  112  2e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  65.85 
 
 
87 aa  112  2e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  112  2e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  112  2e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  112  2e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01306  30S ribosomal protein S15  69.05 
 
 
86 aa  112  2e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.154774  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
88 aa  112  2e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0694  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 
89 aa  112  2e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.108476  normal  0.216291 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  64.04 
 
 
89 aa  112  2e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
88 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.49248e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  111  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
88 aa  111  4e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  4.33754e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
88 aa  111  4e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.17407e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
88 aa  110  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  2.47174e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1310  ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  110  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
88 aa  110  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.49892e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2554  30S ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  110  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.382305  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  61.8 
 
 
89 aa  110  8e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  109  1e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
90 aa  109  1e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 
89 aa  109  1e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  61.36 
 
 
90 aa  109  1e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0728  ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  109  1e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165942  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
88 aa  108  2e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  3.55811e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0956  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  108  2e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  2e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
90 aa  108  2e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  108  2e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  2e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  2e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  1.29722e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  60.67 
 
 
89 aa  108  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0867  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
88 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.350166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  61.8 
 
 
89 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  56.18 
 
 
89 aa  108  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0952  30S ribosomal protein S15  60.23 
 
 
88 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  3.71083e-05 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 
89 aa  108  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  63.41 
 
 
88 aa  108  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  107  4e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  59.55 
 
 
89 aa  107  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1056  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 
89 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1128  ribosomal protein S15  62.5 
 
 
88 aa  107  6e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0289  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.043506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5185  30S ribosomal protein S15  59.09 
 
 
88 aa  107  6e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2206  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 
89 aa  107  7e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442595  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  107  8e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2818  30S ribosomal protein S15  64.63 
 
 
88 aa  107  8e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.219702 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 
89 aa  107  8e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0206  30S ribosomal protein S15  65.43 
 
 
86 aa  106  8e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>