57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0052 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
158 aa  317  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  30.15 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  28.85 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  30.77 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  31.54 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  28.48 
 
 
142 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  29.81 
 
 
149 aa  57.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  25.17 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  28.78 
 
 
142 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  28.78 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  29.71 
 
 
147 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  27.27 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  32.45 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  34.04 
 
 
150 aa  55.1  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  30 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  26.62 
 
 
142 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  25.87 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  25.85 
 
 
143 aa  50.4  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  30.57 
 
 
151 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  28.57 
 
 
149 aa  48.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  25.19 
 
 
143 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  23.97 
 
 
153 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  26.03 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  28.29 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  22.3 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  30.92 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  24.65 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  25.35 
 
 
159 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0701  hypothetical protein  32 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  25.35 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  28.21 
 
 
144 aa  43.9  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  25.71 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  31.13 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  26.06 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  28.76 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  24.81 
 
 
144 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  27.85 
 
 
151 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  24.44 
 
 
143 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  24.65 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  24.65 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  26.06 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  26.06 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0068  hypothetical protein  40 
 
 
454 aa  42  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  24.2 
 
 
157 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  24.54 
 
 
156 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  25.53 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0871  protein of unknown function DUF107  40.43 
 
 
444 aa  41.2  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000176034  normal  0.0484156 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  25.53 
 
 
155 aa  40.8  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  28.08 
 
 
150 aa  40.8  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  25.69 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>