178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0048 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0048  glutaminase  100 
 
 
310 aa  640  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0524  glutaminase  72.7 
 
 
310 aa  475  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00436  predicted glutaminase  72.04 
 
 
310 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0528  glutaminase  72.04 
 
 
310 aa  472  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0578  glutaminase  72.04 
 
 
310 aa  471  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3131  glutaminase  72.04 
 
 
310 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0971481  hitchhiker  8.72807e-05 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00441  hypothetical protein  72.04 
 
 
310 aa  472  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0420  glutaminase  72.04 
 
 
310 aa  472  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3125  Glutaminase  72.04 
 
 
310 aa  472  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.28972  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0564  glutaminase  72.04 
 
 
310 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0340  glutaminase  60.86 
 
 
317 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0038  glutaminase  50 
 
 
313 aa  315  6e-85  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.744531 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3760  glutaminase  45.13 
 
 
332 aa  279  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1503  Glutaminase  43.83 
 
 
330 aa  272  4e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4729  glutaminase  43.38 
 
 
311 aa  269  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37730  L-glutaminase  43.18 
 
 
338 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.89769  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2143  glutaminase  41.56 
 
 
335 aa  265  9e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2254  glutaminase  41.56 
 
 
335 aa  265  9e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2130  glutaminase  41.56 
 
 
335 aa  265  9e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0295591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0966  glutaminase  42.86 
 
 
334 aa  255  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1407  glutaminase  40.26 
 
 
331 aa  254  2e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.883492 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1640  cyclic nucleotide-binding protein  40.66 
 
 
624 aa  237  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.346806 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1969  Glutaminase  39.87 
 
 
318 aa  236  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.677797 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0555  anti-sigma-factor antagonist  40.74 
 
 
601 aa  233  3e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2670  Glutaminase  38.49 
 
 
343 aa  227  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.987694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3446  Glutaminase  38.16 
 
 
343 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0296  cyclic nucleotide-binding protein  38.54 
 
 
624 aa  221  2e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.339618 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0795  Glutaminase  40.67 
 
 
306 aa  218  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1319  Glutaminase  39.58 
 
 
331 aa  216  3e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2961  glutaminase  40.48 
 
 
308 aa  216  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0557  glutaminase  40.48 
 
 
307 aa  214  1e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0571  glutaminase  40.48 
 
 
307 aa  214  2e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2331  glutaminase  38.28 
 
 
425 aa  212  5e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370553  normal  0.322979 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2044  glutaminase  39.39 
 
 
307 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3926  cyclic nucleotide-binding protein  36.18 
 
 
608 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1963  glutaminase  38.68 
 
 
305 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2251  glutaminase  38.68 
 
 
305 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0446  Glutaminase  40.85 
 
 
412 aa  208  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1550  cyclic nucleotide-binding protein  37.92 
 
 
613 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0305  Glutaminase  37.63 
 
 
309 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0006  glutaminase  39.16 
 
 
316 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.110164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0553  glutaminase  39.24 
 
 
309 aa  204  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00275922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0499  glutaminase  39.24 
 
 
309 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0044437  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0471  glutaminase  39.24 
 
 
309 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.233073  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4820  glutaminase  39.24 
 
 
309 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404932  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0410  glutaminase  39.24 
 
 
309 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.11216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0555  glutaminase  39.24 
 
 
309 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  6.37393e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0480  glutaminase  39.24 
 
 
309 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4040  glutaminase  37.76 
 
 
307 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0235597 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0414  glutaminase  39.24 
 
 
309 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.5535e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0502  glutaminase  38.89 
 
 
309 aa  202  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00198512  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2799  Glutaminase  36.52 
 
 
343 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.095609 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3570  putative glutaminase  36.93 
 
 
620 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.615084 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0822  glutaminase  38.11 
 
 
308 aa  201  1e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0823  glutaminase  38.11 
 
 
308 aa  201  2e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.963027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0147  glutaminase  38.11 
 
 
308 aa  201  2e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0290294  hitchhiker  3.4467e-07 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0426  glutaminase  39.24 
 
 
309 aa  201  2e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  6.93628e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1513  glutaminase  39.34 
 
 
315 aa  200  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.696873  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0536  glutaminase  38.46 
 
 
306 aa  199  4e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0416  glutaminase  39.45 
 
 
309 aa  199  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00235106  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1928  glutaminase  39.02 
 
 
308 aa  197  2e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1946  glutaminase  39.02 
 
 
309 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.790671  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1541  glutaminase  40.07 
 
 
309 aa  196  5e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345343  normal  0.210861 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2134  glutaminase  38.11 
 
 
308 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2122  Glutaminase  38.11 
 
 
308 aa  196  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0470209  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2137  glutaminase  38.11 
 
 
308 aa  196  6e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.200055  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1648  glutaminase  38.11 
 
 
308 aa  196  6e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1606  glutaminase  38.11 
 
 
308 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.188036  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01481  predicted glutaminase  38.11 
 
 
308 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1724  glutaminase  38.11 
 
 
308 aa  196  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.334681  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01492  hypothetical protein  38.11 
 
 
308 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1682  glutaminase  38.11 
 
 
308 aa  196  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.670417  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2155  glutaminase  39.02 
 
 
309 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.948088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1945  Glutaminase  37.2 
 
 
483 aa  195  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.59569  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3676  glutaminase  36.48 
 
 
304 aa  195  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.471921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2048  glutaminase  38.36 
 
 
306 aa  192  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5532  glutaminase  37.89 
 
 
304 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.25618 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4940  glutaminase  38.46 
 
 
304 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  unclonable  1.8103e-05 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0751  glutaminase  36.09 
 
 
304 aa  191  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.010977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1403  glutaminase  41.32 
 
 
311 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.208624  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5348  glutaminase  38.46 
 
 
304 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.336875  normal  0.201751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4370  glutaminase  35.28 
 
 
333 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00679253  normal  0.0112972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3529  glutaminase  38.14 
 
 
309 aa  190  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03588  glutaminase  37.06 
 
 
306 aa  190  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4692  glutaminase  38.96 
 
 
311 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25660  L-glutaminase  36.18 
 
 
333 aa  190  3e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1330  glutaminase  37.05 
 
 
306 aa  190  3e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.957887  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4887  glutaminase  36.16 
 
 
304 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  6.32239e-07 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002449  glutaminase  37.06 
 
 
306 aa  189  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3428  glutaminase  38.11 
 
 
304 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2189  glutaminase  37.46 
 
 
304 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2796  glutaminase  37.25 
 
 
318 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.394459 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0842  glutaminase  37.46 
 
 
304 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0029  glutaminase  39.03 
 
 
304 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.359819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0934  glutaminase  39.03 
 
 
304 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1594  glutaminase  39.03 
 
 
304 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4570  glutaminase  39.02 
 
 
309 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0814  glutaminase  39.03 
 
 
304 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.650659  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1127  glutaminase  39.03 
 
 
304 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2695  glutaminase  37.06 
 
 
304 aa  186  5e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.135832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>