More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0046 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  100 
 
 
495 aa  983  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  42.28 
 
 
506 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  41.34 
 
 
506 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  43.58 
 
 
480 aa  403  1e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56631e-10 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  37.87 
 
 
467 aa  322  9e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  37.87 
 
 
467 aa  321  2e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  35.89 
 
 
464 aa  313  5e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  36.33 
 
 
494 aa  313  6e-84  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  35.68 
 
 
464 aa  313  6e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  35.42 
 
 
474 aa  301  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  35.08 
 
 
499 aa  300  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  35.17 
 
 
473 aa  299  7e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  35.89 
 
 
508 aa  291  2e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  37 
 
 
469 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  36.25 
 
 
490 aa  286  7e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  35.67 
 
 
474 aa  281  1e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  35.67 
 
 
474 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  32.85 
 
 
476 aa  272  8e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  32.85 
 
 
470 aa  272  1e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  35.09 
 
 
495 aa  267  3e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  31.88 
 
 
466 aa  250  5e-65  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  34.51 
 
 
473 aa  246  6e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  34.51 
 
 
473 aa  236  1e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.32 
 
 
511 aa  216  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.32 
 
 
511 aa  216  1e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.32 
 
 
511 aa  216  1e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.32 
 
 
511 aa  215  1e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  30.32 
 
 
511 aa  216  1e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  30.32 
 
 
511 aa  216  1e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  30.32 
 
 
511 aa  216  1e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  30.32 
 
 
511 aa  216  1e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  30.32 
 
 
511 aa  216  1e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  28.13 
 
 
472 aa  204  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  27.35 
 
 
472 aa  199  1e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  29.44 
 
 
503 aa  193  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1507  glutamate:gamma-aminobutyrate antiporter family protein  28.84 
 
 
485 aa  192  8e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0581388  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  28.57 
 
 
473 aa  193  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  27.99 
 
 
473 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  27.99 
 
 
473 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  27.99 
 
 
473 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  27.99 
 
 
473 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1297  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  28.84 
 
 
485 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00362427  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  28.64 
 
 
475 aa  184  3e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  28.34 
 
 
475 aa  184  5e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0883  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  26.5 
 
 
511 aa  169  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0148  amino acid permease-associated region  28.78 
 
 
720 aa  160  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1629  hypothetical protein  27.66 
 
 
445 aa  154  3e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1623  hypothetical protein  27.45 
 
 
445 aa  153  6e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0047  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  25.68 
 
 
494 aa  152  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  29.84 
 
 
472 aa  152  2e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  27.32 
 
 
464 aa  128  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 
497 aa  120  5e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  27.81 
 
 
455 aa  116  1e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  27.08 
 
 
481 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  25.72 
 
 
489 aa  110  7e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  3.67074e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  28.12 
 
 
500 aa  109  9e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  1.96904e-05 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  27.2 
 
 
500 aa  106  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  24.72 
 
 
489 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  26.48 
 
 
465 aa  104  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  23.46 
 
 
476 aa  101  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0155  amino acid permease  23.99 
 
 
495 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0159  amino acid permease family protein  23.75 
 
 
495 aa  93.2  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  25 
 
 
467 aa  87.4  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 
504 aa  77.4  5e-13  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 
504 aa  77.4  5e-13  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  25.25 
 
 
504 aa  77.4  5e-13  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  28.14 
 
 
444 aa  77.4  6e-13  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  28.14 
 
 
444 aa  77.4  6e-13  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  28.14 
 
 
444 aa  77  7e-13  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  22.88 
 
 
473 aa  77  8e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  22.88 
 
 
473 aa  77  8e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  22.88 
 
 
473 aa  77  8e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  22.88 
 
 
473 aa  77  8e-13  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  22.88 
 
 
473 aa  76.6  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1975  amino acid permease-associated region  22.89 
 
 
496 aa  75.5  2e-12  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0141312 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3260  amino acid permease family protein  23.87 
 
 
477 aa  74.3  4e-12  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02947  predicted transporter  23.87 
 
 
477 aa  74.3  4e-12  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3372  amino acid permease family protein  23.87 
 
 
477 aa  74.3  4e-12  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3036  amino acid transporter  28.09 
 
 
464 aa  74.3  4e-12  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0805799  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0622  amino acid permease-associated region  23.87 
 
 
477 aa  74.7  4e-12  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4392  amino acid permease family protein  23.87 
 
 
477 aa  74.3  4e-12  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0217  amino acid antiporter  22.84 
 
 
782 aa  74.3  5e-12  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3545  amino acid permease family protein  23.41 
 
 
477 aa  73.9  6e-12  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1034  amino acid permease family protein  20.89 
 
 
540 aa  73.6  9e-12  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.696759  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0623  amino acid permease-associated region  23.82 
 
 
477 aa  72.8  1e-11  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03339  hypothetical protein  23.72 
 
 
476 aa  72  2e-11  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1930  amino acid permease-associated region  26.38 
 
 
489 aa  71.6  3e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1217  amino acid permease family protein  20.1 
 
 
540 aa  71.2  4e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0249423  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1226  amino acid permease-associated region  24.22 
 
 
497 aa  70.9  5e-11  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  22.35 
 
 
476 aa  69.7  1e-10  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  22.35 
 
 
476 aa  69.7  1e-10  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  22.35 
 
 
540 aa  69.7  1e-10  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  22.35 
 
 
476 aa  69.7  1e-10  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  22.35 
 
 
540 aa  69.7  1e-10  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  22.35 
 
 
476 aa  69.3  1e-10  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.52526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  24.16 
 
 
438 aa  69.3  1e-10  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  22.35 
 
 
476 aa  69.7  1e-10  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1880  amino acid transporter  20.68 
 
 
492 aa  69.7  1e-10  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.14764e-05  hitchhiker  7.09791e-10 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  22.35 
 
 
476 aa  69.7  1e-10  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  25.17 
 
 
503 aa  68.6  3e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.291041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>