More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0040 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
307 aa  617  1e-176  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  65.57 
 
 
307 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  63.23 
 
 
312 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  60.2 
 
 
348 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2302  transcriptional regulator, ArsR family  49.16 
 
 
309 aa  283  3e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2305  transcriptional regulator, ArsR family  49.18 
 
 
311 aa  260  2e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  44.98 
 
 
305 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  43.14 
 
 
310 aa  221  1e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0356  ArsR family transcriptional regulator  43.89 
 
 
304 aa  215  8e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.208931  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 
309 aa  202  6e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 
307 aa  194  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  39.79 
 
 
306 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.16904e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  41.39 
 
 
305 aa  191  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  37.89 
 
 
354 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  37.89 
 
 
349 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
339 aa  146  4e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  36.36 
 
 
328 aa  146  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
327 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  36.18 
 
 
342 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0160  methyltransferase type 11  39.17 
 
 
322 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0747842 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
317 aa  139  7e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  35.58 
 
 
340 aa  139  8e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
330 aa  138  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  35.74 
 
 
335 aa  135  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
312 aa  135  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
337 aa  135  1e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0808  transcriptional regulator, ArsR family  33.79 
 
 
324 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.203378 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  31.19 
 
 
305 aa  130  2e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
341 aa  131  2e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
341 aa  130  2e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0173  transcriptional regulator, ArsR family  38.64 
 
 
326 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  34.32 
 
 
329 aa  129  8e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0162  transcriptional regulator, ArsR family  37.86 
 
 
326 aa  127  2e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0155  ArsR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
326 aa  127  2e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2619  transcriptional regulator, ArsR family  31.62 
 
 
341 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.38929  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  31.23 
 
 
341 aa  126  4e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1529  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
337 aa  125  8e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5268  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
331 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.149036  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2926  transcriptional regulator ArsR family  31.2 
 
 
341 aa  124  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.276584  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  34.73 
 
 
349 aa  123  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2116  methyltransferase type 11  33.46 
 
 
340 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.126777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2879  transcriptional regulator, ArsR family  30.71 
 
 
341 aa  122  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07110  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
333 aa  122  1e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  33.44 
 
 
341 aa  120  2e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05540  ArsR family regulatory protein  32.14 
 
 
336 aa  119  8e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0650  putative transcriptional regulator  31.23 
 
 
329 aa  119  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2402  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
323 aa  118  1e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  31.99 
 
 
328 aa  118  2e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0455  ArsR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
334 aa  114  2e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0500  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
330 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4966  ArsR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
330 aa  112  8e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4839  ArsR family transcriptional regulator  31.69 
 
 
330 aa  112  8e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5015  ArsR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
330 aa  108  8e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.1667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0384  transcriptional regulator, ArsR family  30.36 
 
 
331 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3041  methyltransferase type 11  30.91 
 
 
333 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1198  SAM-dependent methyltransferase  31.11 
 
 
206 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0471  ArsR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
335 aa  102  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.421006  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4793  regulatory protein, ArsR  30.85 
 
 
331 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0119403 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1224  methyltransferase type 11  31.11 
 
 
206 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.43 
 
 
207 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2245  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
212 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.810534 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2610  transcriptional regulator, ArsR family  28.29 
 
 
309 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.184924 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.94 
 
 
207 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  28.29 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  27.96 
 
 
331 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  29.65 
 
 
355 aa  84.7  2e-15  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  31.08 
 
 
219 aa  80.9  3e-14  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  27.8 
 
 
210 aa  73.6  4e-12  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  26.7 
 
 
420 aa  71.2  2e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3781  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 
110 aa  71.6  2e-11  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00283923  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2332  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.3 
 
 
245 aa  70.9  3e-11  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  35.2 
 
 
213 aa  70.5  3e-11  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  50.79 
 
 
117 aa  70.5  3e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0938  Methyltransferase type 11  27.49 
 
 
218 aa  69.3  8e-11  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1112  ArsR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
132 aa  68.6  1e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2350  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 
112 aa  68.6  1e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.917554  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 
218 aa  67.8  2e-10  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1872  transcriptional regulator, ArsR family  43.48 
 
 
112 aa  68.2  2e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  59.09 
 
 
114 aa  67.4  3e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1731  arsenical resistance operon repressor  50 
 
 
105 aa  67  4e-10  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0861085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  52.38 
 
 
115 aa  67  4e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3367  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.35 
 
 
235 aa  66.6  4e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0438  ArsR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
106 aa  66.6  5e-10  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.729784  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0047  transcriptional repressor of chromosomal ars operon  52.38 
 
 
112 aa  66.6  5e-10  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0346943  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 
207 aa  66.6  5e-10  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  54.93 
 
 
115 aa  65.9  7e-10  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1005  ArsR family transcriptional regulator  49.21 
 
 
112 aa  65.9  8e-10  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.146198  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 
209 aa  65.9  9e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  8.51252e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1211  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 
117 aa  65.9  9e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2563  transcriptional regulator, ArsR family  36.26 
 
 
112 aa  65.5  1e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  8.81945e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
114 aa  65.1  1e-09  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1167  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.54 
 
 
259 aa  65.1  1e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.17887e-05  hitchhiker  0.00731668 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.36 
 
 
215 aa  65.5  1e-09  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2434  transcriptional regulator, ArsR family  46.58 
 
 
111 aa  65.1  1e-09  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2641  Methyltransferase type 11  27.53 
 
 
268 aa  64.7  2e-09  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.307371  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0892  ArsR family transcriptional regulator  41.98 
 
 
112 aa  64.7  2e-09  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0417  ArsR family transcriptional regulator  41.03 
 
 
120 aa  65.1  2e-09  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.853765  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
114 aa  64.7  2e-09  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  53.85 
 
 
114 aa  64.7  2e-09  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>